蜜蜂（Apis mellifera）ant基因和vha16基因的克隆及其功能預(yù)測的生物信息學(xué)研究.pdf

1、生物信息學(xué)是當(dāng)前生物科學(xué)的研究熱點(diǎn)之一,利用EST數(shù)據(jù)庫電子克隆新基因的研究就是其中一項(xiàng)重要的內(nèi)容.蜜蜂(Apis mellifera)是一種重要的農(nóng)業(yè)昆蟲,它不僅能生產(chǎn)蜂產(chǎn)品,而且還是農(nóng)作物的重要授粉者.目前蜜蜂已成為一種模式生物.此外,蜜蜂的社會性特性和行為特點(diǎn)也引起了生物學(xué)家的強(qiáng)烈興趣.但是,目前發(fā)現(xiàn)的蜜蜂基因數(shù)量很少.所以,在蜜蜂基因組計(jì)劃(Honey Bee Genome Project,HBGP)完成的基礎(chǔ)上,利用蜜蜂EST

2、數(shù)據(jù)庫信息電子克隆蜜蜂新基因的研究工作就有一定的現(xiàn)實(shí)意義.本文以果蠅(Drosophila melanogaster)基因cDNA序列為信息探針,對蜜蜂EST數(shù)據(jù)庫進(jìn)行同源檢索篩選,電子克隆蜜蜂相關(guān)基因,并預(yù)測其功能,旨在根據(jù)物種間同源基因序列,建立一條跨物種電子克隆新基因的有效途徑.1.蜜蜂腺苷酸轉(zhuǎn)移載體基因的克隆與分析.以果蠅腺苷酸轉(zhuǎn)移載體基因(ant)cDNA序列為信息探針,對蜜蜂EST數(shù)據(jù)庫進(jìn)行同源檢索篩選,克隆了蜜蜂腺苷酸轉(zhuǎn)移

3、載體基因的cDNA序列(GenBank登錄號為AY332626),基因全長1251bp.2.蜜蜂H<'+>-ATP合成酶16kDa蛋白脂質(zhì)C亞基基因的克隆與分析.以果蠅ATP合成酶16kDa蛋白脂質(zhì)C亞基基因(vha16)cDNA序列為信息探針,BLAST檢索GenBank的蜜蜂EST數(shù)據(jù)庫,拼接有部分同源的EST序列,獲得581bp的蜜蜂vha16基因的cDNA全序列(GenBank登錄號為AY343324).RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與電