橘紅海生桿菌SYL130T的多相分類學(xué)鑒定.pdf

1、自然界中有十分豐富的微生物資源，目前已分類鑒定的微生物約有15萬(wàn)種僅為微生物總量的10％左右，其中已開(kāi)發(fā)利用的僅占1％。因此，仍有大量的未知微生物資源需要挖掘并研究其應(yīng)用。
　　本研究對(duì)韓國(guó)釜山公園污水沉積物土壤進(jìn)行了菌種的分離篩選，對(duì)55株菌的168rRNA基因序列進(jìn)行比對(duì)，發(fā)現(xiàn)它們分布在Pedobacter、Sphingobium和Sphingomonas等18個(gè)屬，Sphingobium屬菌株所占比例最大。通過(guò)進(jìn)一步鑒定得到

2、了疑似新菌SYL130。SYL130為一株好氧菌株，在R2A培養(yǎng)基中呈橙色菌落。其細(xì)胞為彎曲桿狀，革蘭氏染色為陰性，可進(jìn)行滑行運(yùn)動(dòng)。對(duì)SYL130進(jìn)行16S rRNA基因序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)該菌株與Sediminibacterium aquarii JCM31013T(96.1％)相似度最高且與Sediminibacterium屬其它菌株相似性均小于97％。利用鄰近距離法、最大似然法、最大簡(jiǎn)約法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)，發(fā)現(xiàn)該菌在進(jìn)化樹(shù)中一直穩(wěn)定的與Sedi

3、minibacteriumaquarii JCM31013T聚在一個(gè)小分支，再與該屬的其他成員聚在一個(gè)大分支。根據(jù)進(jìn)化樹(shù)分析和菌株SYL130的16S rRNA基因序列分析，SYL130可能是Sediminibacterium屬的一個(gè)新種。以Sediminibacterium屬的相關(guān)菌株Sediminibacterium aquarii JCM31013T,Sediminibacterium goheungense KCTC23945T

4、和Sediminibacterium salmoneum NBRC103935T為參考菌株對(duì)SYL130進(jìn)行了多相分類學(xué)鑒定，發(fā)現(xiàn)SYL130對(duì)NaCl無(wú)耐受性，生長(zhǎng)溫度范圍為4-37C，生長(zhǎng)pH范圍為5.0-7.0，DNA G+C mol％含量是47.8mol％，主要脂肪酸(＞5％)為iso-C151G(23.22％)、iso-C150(28.29％)、anteiso-C150(5.98％)、iso-C1603-OH(5.61％)和i

5、so-C1703-OH(9.56％)，主要極性脂為磷脂酰乙醇胺、未知的氨脂、未知的氨基磷脂、兩種未知的氨基磷脂和六種未知的脂質(zhì)，主要的呼吸醌為MK-7。此外，SYL130與參考菌株有明顯的生理生化特性差異，如其生長(zhǎng)溫度和生長(zhǎng)pH范圍，可同化L-阿拉伯糖和D-麥芽糖，沒(méi)有α-半乳糖苷酶活性等特性與參考菌株有明顯不同。
　　通過(guò)表型、基因型和化學(xué)分類學(xué)特征分析證明了SYL130即符合Sediminibacterium屬內(nèi)特征又具有自身