甘藍(lán)型油菜與白菜比較作圖和比較QTL研究.pdf

1、分子標(biāo)記的發(fā)展和大量遺傳圖譜的構(gòu)建使不同物種間開(kāi)展比較作圖和比較QTL(Quantitative Trait Locus)的研究成為可能。比較作圖可以作為一個(gè)有效的工具,將一個(gè)研究的比較透徹的物種中的信息和資源(像擬南芥、水稻等)轉(zhuǎn)移到其它有待研究的物種中。這樣不僅可以加快基因組的研究,又可以充分節(jié)省大量的人力和財(cái)力；同時(shí),在比較作圖的基礎(chǔ)上,對(duì)同一性狀在不同物種中(如蕓苔屬物種與擬南芥)開(kāi)展QTLs比較分析,有利于深入了解復(fù)雜性狀的遺

2、傳學(xué)基礎(chǔ)。
　　 實(shí)驗(yàn)室成員曾根據(jù)韓國(guó)已經(jīng)測(cè)序的白菜A3、A9染色體的208個(gè)BACs信息設(shè)計(jì)和初步篩選的407對(duì)引物(其中SSR引物92對(duì)、IBP(Intron Based Polymorphism)引物315對(duì))。本研究從中進(jìn)一步篩選出對(duì)應(yīng)于155個(gè)BACs的155對(duì)引物,將對(duì)應(yīng)于104個(gè)BACs的64個(gè)IBP標(biāo)記和44個(gè)SSR標(biāo)記定位到TN DH遺傳連鎖圖譜上,并利用實(shí)驗(yàn)室以前定位在圖譜上的標(biāo)記,重新構(gòu)建了含有938個(gè)標(biāo)記

3、的甘藍(lán)型油菜TN DH高密度遺傳連鎖圖。該圖譜包括472個(gè)SSR、64個(gè)IBP、41個(gè)AFLP、52個(gè)RFLP、97個(gè)SNP、57個(gè)SRAP和61個(gè)SSAP。
　　 將法國(guó)的DY群體、RNSL群體以及其一個(gè)甘藍(lán)型油菜整合圖譜上的標(biāo)記整合到TN DH遺傳連鎖圖上,得到了包含1107個(gè)標(biāo)記的甘藍(lán)型油菜整合圖譜。與IN DH遺傳連鎖圖相比,整合圖譜上增加了119個(gè)SSR、19個(gè)SNP和31個(gè)其它類(lèi)型的標(biāo)記；同時(shí),將韓國(guó)公布的CK、JW

4、F3P、VCS3個(gè)白菜遺傳圖譜上的標(biāo)記進(jìn)行整合,得到一個(gè)包含658個(gè)標(biāo)記的白菜整合圖譜,含有439個(gè)SSR標(biāo)記,145個(gè)IBP標(biāo)記,48個(gè)RFLP標(biāo)記和25個(gè)CAPS標(biāo)記。通過(guò)對(duì)甘藍(lán)型油菜/白菜整合圖譜的比較分析以及圖譜上的標(biāo)記信息與擬南芥的比對(duì),共發(fā)現(xiàn)了195個(gè)甘藍(lán)型油菜/白菜整合圖譜上的共同標(biāo)記,其中10個(gè)為共同標(biāo)記,138個(gè)為共BAC標(biāo)記,47個(gè)根據(jù)擬南芥信息推測(cè)得到,為擬同源標(biāo)記。根據(jù)甘藍(lán)型油菜/白菜整合圖譜的比較結(jié)果,推測(cè)甘藍(lán)

5、型油菜A基因組與白菜基因組間可能發(fā)生了24個(gè)染色體重排事件,其中有20個(gè)倒位和4個(gè)可能的片斷缺失,沒(méi)有明顯的片斷插入事件,重排涉及的片斷長(zhǎng)度(cM)占甘藍(lán)型油菜A基因組的17.92％。
　　 硫甙含量是衡量種子品質(zhì)的一個(gè)重要性狀。在白菜CK DH遺傳連鎖圖A9連鎖群上檢測(cè)到了1個(gè)穩(wěn)定出現(xiàn)的硫甙含量QTL。通過(guò)與實(shí)驗(yàn)室甘藍(lán)型油菜TN DH遺傳連鎖圖A9連鎖群上檢測(cè)到的1個(gè)多年多點(diǎn)重復(fù)出現(xiàn)的硫甙含量QTL比較,發(fā)現(xiàn)2個(gè)QTL位于同一