甘藍(lán)型油菜葉片和種子中油脂合成的轉(zhuǎn)錄組比較分析.pdf

1、油菜作為食用油主要來源作物之一，不僅為人類生活提供大量的油脂，同時(shí)還被應(yīng)用于化工和能源等領(lǐng)域。油菜種子含油量達(dá)到40％以上，是油脂主要的貯藏組織，而油菜葉片，只含有少量的油脂，但種類繁多，并且葉片中的油脂在許多重要的生物學(xué)功能中起到更多的作用，如光合作用、糖原生成、光合膜生成，能量供給等。因此，油脂在植物種子和葉片中的調(diào)控具有差異性。然而，關(guān)于種子和葉片中油脂合成差異的分子機(jī)制的報(bào)道非常少。
　　在本研究中，我們通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來分

2、析兩個(gè)組織的油脂合成差異。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組從頭組裝，我們最終獲得了47216個(gè)unigenes，其中N50長(zhǎng)度值和長(zhǎng)度中間值分別為1271bp和755bp，這表明轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝的完整性較好。在所有unigenes中，有36368個(gè)unigenes（約77.02％）在數(shù)據(jù)庫COG，GO，KEGG，Swissport和Nr中得到注釋。
　　通過比較種子和葉片中unigenes的RPKM值(unigenes表達(dá)量參數(shù))，在油脂

3、合成途徑中，109個(gè)unigenes在種子中的表達(dá)量比葉片高，72個(gè)unigenes在種子中的表達(dá)量比葉片低。此外，在油酸合成途徑中，油菜種子中含量最多的游離脂肪酸，23個(gè)unigenes在種子中的表達(dá)量比葉片高，而僅有4個(gè)unigenes在種子中的表達(dá)量比葉片低。在TAG合成途徑中，編碼關(guān)鍵酶的unigenes在種子中的表達(dá)量都比葉片高，如PP和DGAT。然而，參與棕櫚酸，棕櫚油酸，硬脂酸，亞油酸和亞麻酸合成的所有unigenes在葉

4、片中的表達(dá)量幾乎都比種子高，這表明這些脂肪酸的合成對(duì)于葉片非常重要。
　　在油脂合成途徑中，除了大量的酶參與其中，還有很多轉(zhuǎn)錄因子也參與并調(diào)控油脂合成，如已證實(shí)參與油脂及脂肪酸生物合成的轉(zhuǎn)錄因子ABI3，LEC1，WRI1,ADOF1,EMF2,AP2,LEC2,FUS3,GL2,HSI2-LI和HSI2的unigenes,在種子中表達(dá)量普遍高于葉片。此外，我們還鑒定了49個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族的unigenes，其中ABI3VP1,RK