疫苗臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化和項(xiàng)目管理網(wǎng)絡(luò)化實(shí)現(xiàn)初探.pdf

1、目的：
　　疫苗的應(yīng)用大大提高了現(xiàn)代人群的健康水平，疫苗臨床試驗(yàn)的結(jié)果決定了疫苗是否能夠普及應(yīng)用，在這其中，規(guī)范數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析過程與疫苗的研制及其動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、臨床試驗(yàn)過程同樣至關(guān)重要。為了規(guī)范數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析的整個(gè)過程，從全局上研究如何對(duì)此部分進(jìn)行項(xiàng)目管理，實(shí)現(xiàn)從創(chuàng)建變量開始到統(tǒng)計(jì)分析結(jié)束所有信息都可追溯并且有相應(yīng)的具體內(nèi)容規(guī)范文件和事件記錄文件，在此基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)出符合現(xiàn)代網(wǎng)絡(luò)化的電子項(xiàng)目管理系統(tǒng)。
　　方法：
　　

2、以臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)（Clinical Data Interchange Standards Consortium，CDISC）標(biāo)準(zhǔn)為基礎(chǔ)，根據(jù)臨床數(shù)據(jù)獲取協(xié)調(diào)標(biāo)準(zhǔn)(Clinical Data Acquisition Standards Harmonization，CDash)說明中的變量名命名法則對(duì)用以收集原始數(shù)據(jù)的電子化病例報(bào)告表(Case ReportForm，CRF)的變量命名進(jìn)行定義，以制作出符合CDash標(biāo)準(zhǔn)的變量名列表，

3、并在此變量名列表基礎(chǔ)上制作病例報(bào)告表注釋(CRF annotation，aCRF)，根據(jù)CRF注釋法則配合CDash標(biāo)準(zhǔn)變量命名列表和標(biāo)準(zhǔn)編碼建立CDash aCRF注釋文件。以分析數(shù)據(jù)模型(Analysis DatasetModel，ADaM)標(biāo)準(zhǔn)制作符合疫苗臨床試驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析使用的分析數(shù)據(jù)集。在這個(gè)過程中使用SAS軟件編寫宏程序以完成數(shù)據(jù)管理過程所需要的數(shù)據(jù)處理。
　　以中國疾病預(yù)防控制中心開發(fā)的流行病學(xué)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)采集平臺(tái)(Epi

4、demiological DynamicData Collection platform，EDDC)為基礎(chǔ)，運(yùn)用其已有功能搭建出針對(duì)數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析的疫苗臨床試驗(yàn)項(xiàng)目管理系統(tǒng)，根據(jù)疫苗臨床試驗(yàn)的數(shù)據(jù)管理計(jì)劃(Data Manage Plan，DMP)將從數(shù)據(jù)管理到統(tǒng)計(jì)分析的全部過程按照時(shí)間順序制作表格后在EDDC系統(tǒng)中形成電子化模式，并利用系統(tǒng)管理員權(quán)限設(shè)定用戶分層權(quán)限，利用服務(wù)器終端的網(wǎng)絡(luò)和數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)儲(chǔ)存功能實(shí)現(xiàn)平臺(tái)的網(wǎng)絡(luò)化。對(duì)從系

5、統(tǒng)中導(dǎo)出的文件通過SAS軟件處理后，利用SAS AF建立人機(jī)交互界面的功能制作系統(tǒng)相對(duì)應(yīng)的疫苗臨床試驗(yàn)進(jìn)度查詢插件，插件中所需要的程序由SAS軟件進(jìn)行編寫。
　　結(jié)果：
　　建立了適用于疫苗臨床試驗(yàn)的CDash標(biāo)準(zhǔn)變量名列表，并與變量名長(zhǎng)度限制在八個(gè)字符的Epidata等常用錄入軟件的變量命名一一對(duì)應(yīng)，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行電子化CRF的建庫，并創(chuàng)建了疫苗臨床試驗(yàn)項(xiàng)目相對(duì)應(yīng)的aCRF注釋文件，通過SAS軟件編程實(shí)現(xiàn)了非標(biāo)準(zhǔn)和標(biāo)準(zhǔn)變量

6、命名之間的轉(zhuǎn)換。根據(jù)疫苗臨床試驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析特點(diǎn)和常用的分析指標(biāo)建立了ADam標(biāo)準(zhǔn)的受試者水平分析數(shù)據(jù)集(ADam Subject-Level Analysis Dataset，ADSL)、基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(ADam Basic Data Structure，BDS)分析數(shù)據(jù)集以及其相應(yīng)的分析數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)和分析變量元數(shù)據(jù)文件。
　　搭建疫苗臨床試驗(yàn)項(xiàng)目管理系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了外網(wǎng)訪問，并配備有離線端手機(jī)端等多種訪問形式。系統(tǒng)能夠?qū)γ總€(gè)臨床試驗(yàn)項(xiàng)目

7、的數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析過程中產(chǎn)生文件進(jìn)行保存，并自動(dòng)記錄操作時(shí)間和負(fù)責(zé)人員的信息，對(duì)系統(tǒng)設(shè)立了賬戶權(quán)限分級(jí)，整個(gè)系統(tǒng)可定期自動(dòng)備份至網(wǎng)絡(luò)云盤。運(yùn)用SAS AF模塊制作了配套的進(jìn)度查詢插件，并以兩種形式對(duì)其進(jìn)行配置:項(xiàng)目管理系統(tǒng)數(shù)據(jù)導(dǎo)出后用SAS程序進(jìn)行處理放入插件相應(yīng)文件夾內(nèi)或在項(xiàng)目進(jìn)行過程中直接通過插件逐條將內(nèi)容輸入。
　　討論：
　　CDICS標(biāo)準(zhǔn)在中國疫苗臨床試驗(yàn)中的應(yīng)用仍然處于起步階段，疫苗與藥物有所區(qū)別和獨(dú)有的部分目

8、前在CDICS標(biāo)準(zhǔn)中還沒有明確的描述，現(xiàn)在按照CDISC命名和分域規(guī)則得到的變量名列表需要在之后不斷的實(shí)際應(yīng)用中進(jìn)行擴(kuò)充和完善。國內(nèi)目前還沒有對(duì)aCRF做出明確的要求，但是從長(zhǎng)遠(yuǎn)角度看，aCRF的建立定義了eCRF中每個(gè)變量的變量名、格式、長(zhǎng)度和單位等等的必要信息，規(guī)范了數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析，使其更加透明化，標(biāo)準(zhǔn)化，并能更好的連接整個(gè)團(tuán)隊(duì)的工作，提高了效率，有效減少了錯(cuò)誤的發(fā)生。ADam分析數(shù)據(jù)集的應(yīng)用則是將CDash標(biāo)準(zhǔn)下的原始數(shù)據(jù)集和

9、之后的分析處理過程連接了起來。
　　我國臨床試驗(yàn)周期相對(duì)較長(zhǎng)，在這個(gè)過程中又可能同時(shí)進(jìn)行若干個(gè)不同的試驗(yàn)項(xiàng)目，數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析又往往由不同的人員進(jìn)行處理，將這一過程中發(fā)生的事件全部記錄下來，文件全部歸類保存就顯得尤為重要。項(xiàng)目管理系統(tǒng)對(duì)于長(zhǎng)期進(jìn)行臨床試驗(yàn)項(xiàng)目的研究機(jī)構(gòu)非常必要，EDDC項(xiàng)目管理系統(tǒng)可以對(duì)已完成的項(xiàng)目和正在進(jìn)行或還未進(jìn)行的項(xiàng)目進(jìn)行一定的規(guī)劃和處理，并且每進(jìn)行一次臨床試驗(yàn)，從中吸取經(jīng)驗(yàn)后進(jìn)行改進(jìn)使整個(gè)系統(tǒng)更加完善。在

10、線、離線、多客戶端以及SASAF進(jìn)度查詢插件可以滿足不同環(huán)境下對(duì)管理系統(tǒng)的使用。但是也存在著一些問題，這些客戶端之間和網(wǎng)絡(luò)端之間的連接較為單向，即離線端能上傳至網(wǎng)絡(luò)端，但網(wǎng)絡(luò)端的數(shù)據(jù)只能供進(jìn)度查詢插件使用，仍有很多地方需要進(jìn)一步優(yōu)化。
　　結(jié)論：
　　CDISC標(biāo)準(zhǔn)與臨床試驗(yàn)相結(jié)合從對(duì)原始數(shù)據(jù)的采集就開始運(yùn)用CDash標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行變量命名并將其屬性、長(zhǎng)度和單位都明確定義能夠?qū)?shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析起到很好的規(guī)范作用，分域制作的變量名

11、列表可以隨著試驗(yàn)項(xiàng)目累積不斷擴(kuò)展，用SAS軟件編寫的變量名替換宏程序在數(shù)據(jù)管理程序之前運(yùn)行一次就可以將傳統(tǒng)錄入軟件中不規(guī)范的命名轉(zhuǎn)換為CDash標(biāo)準(zhǔn)的變量名，標(biāo)準(zhǔn)化后的變量名與研究數(shù)據(jù)列表模型(Study Data Tabulation Model，SDTM)和ADam分析數(shù)據(jù)集變量命名之間的映射有助于數(shù)據(jù)在各個(gè)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)集之間轉(zhuǎn)換，并且標(biāo)準(zhǔn)化后的變量名即使脫離了數(shù)據(jù)集也能了解其含義。ADam標(biāo)準(zhǔn)下的分析數(shù)據(jù)集有助于統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果的重現(xiàn)，