南方養(yǎng)殖草魚呼腸孤病毒分子特性的分析及VP4重組蛋白免疫效果初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、草魚(Ctenopharyngodonidellus)是我國淡水養(yǎng)殖的重要品種,其產(chǎn)量約占淡水養(yǎng)殖總產(chǎn)量的20%,在我國農(nóng)業(yè)經(jīng)濟中具有重要的意義。但是其養(yǎng)殖期間易發(fā)生出血病,導致高死亡率,常造成草魚養(yǎng)殖業(yè)的巨大損失。本實驗室最近在廣東養(yǎng)殖草魚患出血病病魚體上分離到一株病毒株(暫命名為GCRV-GD108),人工感染實驗顯示該毒株對草魚具有強致病性。病毒全基因組測序的結(jié)果顯示該株與已報道的GCRV以及其它水生呼腸孤病毒屬已知種的序列存在較

2、大差異。本研究在此基礎上檢測南方草魚主養(yǎng)區(qū)病毒株的分子特性,并建立雙重PCR檢測方法,通過一次PCR反應鑒別病毒株屬于GCRV或GCRV-GD108。同時制備外衣殼蛋白VP4的重組蛋白,開展重組蛋白免疫原性與保護作用分析。本研究為草魚病毒性出血病的有效防控奠定基礎。
   1.南方各毒株樣品的分子特性分析
   根據(jù)本實驗室前期研究所獲得的GCRV-GD108株的序列,設計了針對每個節(jié)段的擴增引物,RT-PCR方法擴增采

3、自廣東、福建和湖南等地的病毒株。結(jié)果顯示各樣品相互間、樣品與GCRV-GD108株間11個節(jié)段序列均具有較高的同源性。各樣品序列兩兩間的相似性為95.2%~99.4%,各樣品與GCRV-GD108株序列的相似性在95.0%~99.8%間;樣品間同源性最高的為S9片段,L3片段的同源性最低,各樣品M4片段間的差異較大。本研究說明目前南方多個地區(qū)的草魚出血病病毒均具有與GCRV-GD108株相似的分子特征,提示GCRV-GD108株是南方省

4、市的主要代表性流行毒株。
   此外,還進行了病毒感染組織特異性的分析,結(jié)果顯示各組織樣品均能檢測到特異條帶,說明各組織中均感染有病毒。
   2.雙重PCR擴增方法的建立
   在上述檢測基礎上篩選合適引物對,以健康草魚、GCRV標準株以及GCRV-GD108株基因組RNA為模板,反轉(zhuǎn)錄所獲得的cDNA進行雙重PCR擴增,結(jié)果顯示健康草魚無特異條帶產(chǎn)生,GCRV標準株樣品均有450bp左右的條帶,而GCRV-G

5、D108株則出現(xiàn)了與各對引物預期大小相符的條帶。同時進行了靈敏性分析,結(jié)果顯示可擴增到濃度為5.07×10-9μg/ml的模板。說明該方法具有較高的靈敏性與特異性,通過一次PCR反應可鑒別所感染的病毒屬于GCRV或GCRV-GD108株,該方法適用于生產(chǎn)上大批量草魚樣品的檢測,可在短時間內(nèi)確定感染病毒的分子特性,以便采取相應的防控措施。
   3.GCRV-GD108M6基因的克隆、抗原性分析及重組蛋白制備
   本研究

6、克隆GCRV-GD108的M6節(jié)段。M6基因全長2028bp,含一個開放閱讀框(ORF)1716bp。M6基因的編碼蛋白VP4與GenBank上已登錄的GCRV標準株VP4序列同源性為47.4%。Blast分析顯示VP4蛋白具有ReovirusM2超家族的主要結(jié)構域(Reovirusmajorvirionstructural-proteinMu-1/Mu-1C(M2)superfamily),該蛋白家族在病毒的結(jié)構和功能的行使上起重要作

7、用,是病毒的外衣殼蛋白,在病毒的膜穿透過程中起作用,推測GCRV-GD108VP4具有相似的功能。用DNAstar軟件預測M6抗原區(qū),顯示其具有28個抗原表位,提示VP4具有較強的抗原性。本研究進一步采用基因工程技術制備重組重組VP4蛋白。根據(jù)M6的ORF序列設計引物,將VP4編碼序列克隆至表達載體中構建重組原核表達載體pET32a-VP4,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3),經(jīng)誘導可表達分子量大小為87kDa的His-VP4融合蛋白。本

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