蛋白質(zhì)在晶體界面上吸附的分子動力學(xué)模擬.pdf

1、蛋白質(zhì)的吸附現(xiàn)象很早就被人們發(fā)現(xiàn),并已經(jīng)在生物醫(yī)學(xué)材料、生物醫(yī)學(xué)工程等領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用.分子模擬技術(shù)是近年來發(fā)展起來的一門新興技術(shù),為從微觀水平研究自然現(xiàn)象提供了一種十分有效的理論研究方法.其中的分子動力學(xué)模擬方法不僅可以用來研究系統(tǒng)的靜態(tài)性質(zhì),還可以研究系統(tǒng)的動態(tài)過程,是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的重要理論工具之一.采用分子動力學(xué)模擬方法研究蛋白質(zhì)吸附過程,可以從微觀水平上研究蛋白質(zhì)吸附的動態(tài)過程和機理. 在NVT條件下,采用TIP3

2、P水分子模型和CHARMM22力場,對聚十賴氨酸分子在金剛石、金、銅、氯化亞銅、氧化鎂等晶體界面上的吸附過程進行了分子動力學(xué)模擬.模擬結(jié)果表明,蛋白質(zhì)分子在這些晶體界面上的吸附過程中,主鏈的構(gòu)象均發(fā)生了變化,蛋白質(zhì)分子中α螺旋結(jié)構(gòu)也有不同程度的減少.但界面性質(zhì)對蛋白質(zhì)的吸附過程有重要影響,在不同的晶體界面上,吸附過程中的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化有較大差異.在金剛石晶體界面上吸附時,聚十賴氨酸分子構(gòu)象變化最大,絕大部分二面角都超出了α螺旋的范圍；在