microRNA進化關系及編碼特性研究.pdf

1、microRNA是一類內源性的長度在22個核苷酸左右的非編碼小分子RNA，它們廣泛存在于真核生物基因組中。成熟的microRNA是由莖環(huán)結構前體pre-miRNA加工而來。microRNA基因具有三大生物學特性：保守性，基因成簇存在和時空特異性表達。成熟microRNA通過翻譯抑制和靶mRNA降解兩種機制來調控基因表達，在動植物的生長發(fā)育，細胞的增殖與死亡，細胞分化及腫瘤治療等多種領域發(fā)揮著重要的調控作用。近年來，microRNA基因及

2、其靶基因的預測是對microRNA進行研究的熱點。本論文獨辟蹊徑，從成熟microRNA序列出發(fā)，旨在探尋microRNA的進化特性和序列特征。全文分為三部分： 第一部分對microRNA的生物學特性，合成過程，作用機制，功能及現(xiàn)階段研究方法進行綜述。 第二部分分別運用Pearson相關系數(shù)，Spearman相關系數(shù)和物種距離定義構建模糊等價矩陣，由此得到18個物種的分子進化樹。所得的三種microRNA進化樹與物種實際

3、進化關系相當，其中，又以核苷多聯(lián)體的Spearman相關和物種距離定義所得進化樹與實際進化關系最為接近。 第三部分運用二項式分布的判定方法在不同置信度上尋找microRNA的8-mer編碼方式，包括從橫向尋找物種特異的編碼方式和從縱向尋找家族特異的編碼方式，同時對家族序列的位點信息進行挖掘。由此得到的物種特異碼字和家族特異碼字便構成了完整的8-mer碼字表。另外，從家族的D<,1>,D<,2>分布圖可以看出，microRNA的前