緣蝽科部分種類線粒體DNACytb序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、該論文從分子生物學(xué)的角度入手,采用Cytb作為分子標(biāo)記,共獲得緣蝽科4個亞科14個種的代表個體以及龜蝽科1個種的代表個體的470bp左右的Cytb部分序列,通過PCR和測序的實(shí)驗(yàn)方法,分析緣蝽科線粒體DNA的Cytb基因序列特征,探討該保守區(qū)段的序列信息,并應(yīng)用分子生物學(xué)軟件對測序結(jié)果進(jìn)行分析處理,建立分子系統(tǒng)進(jìn)化樹,以期得到研究類群間的系統(tǒng)關(guān)系,并試圖確定其分類地位,以彌補(bǔ)形態(tài)學(xué)的不足,為進(jìn)一步研究緣蝽的生物防治提供基礎(chǔ)的資料.使用四

2、種常用的建樹方法:NJ法、臟法、MP法以及ML法,對緣蝽科部分昆蟲的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行研究,幾種方法所產(chǎn)生的分子樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)大致相同,僅在個別屬種的歸屬上存在差異.通過對結(jié)果的分析討論,得出以下結(jié)論:1.通過對14種緣蝽線粒體Cytb基因序列的分析,表現(xiàn)出強(qiáng)烈的A、T偏向性(69.8%),第三位A或T的偏好更加明顯(82.8%),這與原有的結(jié)論相符.2.緣蝽Cytb基因中核苷酸的替代轉(zhuǎn)換明顯高于顛換,顛換的發(fā)生主要以T-A、A-T為主,大

3、都發(fā)生在密碼子第三位.密碼子第三位的高A+T含量與氨基酸的變異確實(shí)存在一定的相關(guān)性.密碼子以A、T結(jié)尾頻率高,第三位是C的密碼子使用較少,反映出Cytb基因在密碼子的使用上具有偏向性.在密碼子應(yīng)用上,第一位為A的氨基酸(賴氨酸lysine[AAA]、天冬酰胺asparagine[AAY]、絲氨酸seri ne[AGR])使用頻率較高,這三種氨基酸占整個蛋白質(zhì)氨基酸的30.59%(Lys9.95,Asn 9.52,Ser 11.12).3

4、.從分子水平方面提供了緣蝽科4亞科間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系,(((巨緣蝽亞科Mictinae+緣蝽亞科Coreinae)+蛛緣蝽亞科Alydinae)+姬緣蝽亞科Phopalinae).結(jié)果顯示:在亞科級關(guān)系上,姬緣蝽亞科最原始,蛛緣蝽亞科次之,巨緣蝽亞科和緣蝽亞科親緣關(guān)系較近,為較進(jìn)化種類.4.三種建樹方法一致顯示出兩個問題:緣蝽亞科的瘤緣蝽屬和同緣蝽屬是否仍應(yīng)置于緣蝽亞科中,同緣蝽屬是否應(yīng)歸入巨緣蝽亞科,由于巨緣蝽亞科和緣蝽亞科的形態(tài)學(xué)特征

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