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文檔簡介
1、本文以中國北方沿海的扁玉螺(Neverita didyma Roding)野生群體為研究對象,應(yīng)用簡單重復(fù)序列區(qū)間擴增(inter simple sequence repeat,ISSR)分子標(biāo)記技術(shù),對扁玉螺的遺傳多樣性進行了研究,從群體遺傳學(xué)角度揭示了扁玉螺野生群體的遺傳結(jié)構(gòu),對其種質(zhì)資源的遺傳多樣性進行了評估,探討了不同野生群體之間的遺傳關(guān)系,以期為保護和合理利用扁玉螺種質(zhì)資源提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下: 1、通過優(yōu)化
2、ISSR-PCR反應(yīng)體系,從30個ISSR引物中篩選出13個用于ISSR分析。13個引物均顯示出不同程度的多態(tài)性,在3個群體90只個體中共檢測到161個位點,平均每個引物記錄12.4個位點,擴增產(chǎn)物的分子量大多在200 bp-1600 bp之間。 2、多態(tài)性位點比例和Shannon's指數(shù)是衡量群體遺傳多樣性的重要指標(biāo)之一。實驗結(jié)果顯示:青島、大連和煙臺3個群體的多態(tài)性位點分別為74.53%、74.53%、85.09%,可見,煙
3、臺群體的多態(tài)性位點比例明顯高于青島和大連群體,雖然大連群體和青島群體的多態(tài)位點百分率相同,但綜合Shannon's信息指數(shù)(I)和Nei's基因多樣性指數(shù)(h)兩組數(shù)據(jù)來看,各群體遺傳多樣性水平的高低依次為YT>QD>DL。 3、Nei's基因多樣性指數(shù)(h)和Shannon's信息指數(shù)(I)在群體水平上分別為0.2811和0.4189,在物種水平上分別為0.3395和0.5113,顯示出扁玉螺群體擁有較高的遺傳多樣性水平,物種
4、水平的遺傳多樣性高于群體水平。群體內(nèi)遺傳多態(tài)度比例(Hpop/Hsp)為0.7873,群體間遺傳多態(tài)度比例(Hsp-Hpop)/Hsp為0.2127,即扁玉螺群體發(fā)生的遺傳變異有78.73%存在于群體內(nèi),21.27%的變異存在于群體間,這說明群體內(nèi)的變異是導(dǎo)致群體間分化的重要因素。 4、利用AMOVA的等級剖分法得出的群體間和群體內(nèi)對總的遺傳變異的貢獻率表明,扁玉螺27.16%的變異發(fā)生在群體間,72.84%的變異發(fā)生在群體內(nèi),
5、顯著性檢驗顯示扁玉螺群體間和群體內(nèi)均有極顯著的遺傳分化(φst=0.2720,P<0.001)。這與上述3中的分析結(jié)果是一致的。 5、群體內(nèi)的遺傳相似度反映了群體內(nèi)個體間的遺傳差異,本實驗結(jié)果顯示:QD群體內(nèi)個體間的遺傳相似系數(shù)平均為0.7709;YT群體內(nèi)個體間的遺傳相似系數(shù)為0.7307;DL群體內(nèi)個體間的遺傳相似系數(shù)為0.7824,表明YT群體內(nèi)個體間的遺傳差異較大。 6、遺傳距離(D)和遺傳相似度(S)是衡量群體
6、間遺傳變異程度的重要參數(shù),S值越大,表明親緣關(guān)系越近,遺傳變異越??;而D值越大,則表明親緣關(guān)系越遠,遺傳變異越大。通過對青島、大連和煙臺3個群體之間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離進行比較的結(jié)果顯示:QD與DL之間的遺傳距離最大,DL與YT群體間的遺傳距離最小。遺傳相似度的結(jié)果為YT與DL群體間的遺傳相似系數(shù)最大。表明在扁玉螺3個自然群體中,DL與YT之間的親緣關(guān)系較近,DL與QD之間的親緣關(guān)系較遠。 7、根據(jù)群體間的遺傳距離和個體間的
7、遺傳相似度,用NTSYS V2.20軟件中的不加權(quán)類平均聚類法(UPGMA)分別對三個群體及三個群體的90只個體進行聚類。結(jié)果顯示:群體間的聚類結(jié)果與上述6完全相同;QD、DL和YT群體內(nèi)的各30只個體分別匯聚成各自獨立的一支,表明群體內(nèi)的個體間有高度的遺傳相似性。 8、扁玉螺3群體之間的基因分化系數(shù)(Gst)為0.1720,由Gst估算的基因流(Nm)為2.4063。這表明3群體之間存在著有效的基因流,遺傳漂變不是影響扁玉螺群
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