玉米全基因組RCI2基因特征及表達分析.pdf

1、植物總是承受著各種環(huán)境因子的作用。其中尤以非生物逆境影響最為廣泛。Rare-coldinductible(RCI2)基因參與植物非生物逆境耐受。RCI2基因家族普遍存在于生物中,其高度保守,并且編碼小分子、高度疏水性蛋白。RCI2基因調(diào)控細胞離子代謝,而能影響膜勢。本研究以生物信息學方法分析了玉米RCI2基因家族,包括基因進化、表達。同時,與高粱、小米、水稻和雀麥草進行了比較。本研究結(jié)果為探討RCI2基因功能提供了系統(tǒng)性認識。主要研究結(jié)

2、果如下:
　　1.在全基因組水平檢索、驗證,獲得了10個RCI2基因。根據(jù)染色體定位情況命名了這些基因。預測了其所編碼蛋白質(zhì)的分子量、等電點。
　　2.構(gòu)建了玉米RCI2基因進化樹。此外,還構(gòu)建了禾本科植物RCI2基因進化樹。45個RCI2基因被劃分為三類。從整體來看,ZmRCI2基因主要定位在染色體兩端。ZmRCI2-3,5、ZmRCI2-4,6為片段復制基因。
　　3.分析了RCI2基因所編碼的蛋白。其氨基酸序列高

3、度保守,形成兩個跨膜結(jié)構(gòu)域。分析了禾本科植物45個RCI2蛋白基序。Motif1,2普遍存在,代表跨膜結(jié)構(gòu)域。Motif3多位于蛋白羧基端。
　　4.分析了10個玉米RCI2基因啟動子。ZmRCI2基因大多含有三種順式作用元件,即:ABRE、LTRE和DRE。ZmRCI2-10啟動子含有最多ABRE順式調(diào)控元件。
　　5.dbEST用于RCI2基因表達分析,10個RCI2基因都有EST表達記錄。ZmRCI2-1具有表達特異性