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1、鱖魚是我國(guó)重要的魚類養(yǎng)殖品種,而近年來(lái)傳染性脾腎壞死病毒(infectiousspleenandkidneynecrosisvirus,ISKNV)對(duì)鱖魚養(yǎng)殖造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。為了研究病毒與宿主的相互作用,本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了ISKNV感染鱖魚的抑制性消減雜交cDNA文庫(kù)基礎(chǔ)。本論文針對(duì)一個(gè)Ly-6超家族成員的cDNA進(jìn)行了進(jìn)一步研究。 序列分析。該cDNA含有一個(gè)282bp的開放閱讀框,編碼93個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì),預(yù)測(cè)分子量為
2、10.3kDa,等電點(diǎn)為5.15。其中N端19個(gè)氨基酸殘基為信號(hào)肽,成熟蛋白由74個(gè)氨基酸殘基組成,預(yù)測(cè)分子量為8.2kDa,等電點(diǎn)為5.05。通過(guò)生物信息學(xué)的分析,發(fā)現(xiàn)該蛋白具有Ly-6/uPAR樣結(jié)構(gòu)域,即以亮氨酸或異亮氨酸為N端開始,具有8-10個(gè)保守的半胱氨酸,屬于Ly-6SF的家族成員。預(yù)測(cè)定位于細(xì)胞外,無(wú)GPI錨定信號(hào),為分泌型蛋白。從系統(tǒng)進(jìn)化的距離,基因的結(jié)構(gòu),以及蛋白三維結(jié)構(gòu)的同源建模來(lái)看,該蛋白跟Ly-6SF的一個(gè)重要
3、成員CD59具有很大的相似性。猜測(cè)可能具有補(bǔ)體調(diào)節(jié)的功能。因此,我們將其命名為L(zhǎng)ypn(Ly-6/protectin)。 基因全長(zhǎng)的克隆。用反向PCR方法克隆了該基因的全長(zhǎng),lypn基因含有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子,上游側(cè)翼區(qū)域含有幾個(gè)潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),如AP-1,NF-KappaB,V-Mvb和GATA-1等。這些轉(zhuǎn)錄因子多跟血細(xì)胞的分化、增殖密切相關(guān)。 基因在ISKNV感染后的表達(dá)譜。用半定量RT-PCR研究了l
4、ypn基因在ISKNV感染鱖魚后的不同時(shí)段、不同組織內(nèi)的表達(dá)模式。結(jié)果表明,在健康情況下,Lypn可在鱖魚脾臟和血細(xì)胞中表達(dá),而在心、肝、頭腎、后腎、腦、鰓和卵巢中則檢測(cè)不到。鱖魚在ISKNV感染后的第4天,心、肝、脾、頭腎、后腎、腦、腮和卵巢等組織均無(wú)法檢測(cè)到Lypn的表達(dá);第11天,在肝、鰓和卵巢出現(xiàn)了較弱的表達(dá)條帶;第15天時(shí),鱖魚處在ISKNV感染后的康復(fù)階段,Lypn在肝、脾、頭腎、后腎、腦和卵巢均有表達(dá)。 重組蛋白的
5、表達(dá)。為了研究其功能,及尋找與其相互作用的蛋白質(zhì),我們進(jìn)行了Lypn的重組表達(dá)。分別以pMal-c2x和pGEX-4T-1質(zhì)粒為載體構(gòu)建了重組質(zhì)粒pMal-lypn和pGEX-lypn,轉(zhuǎn)化BL21(DE3)細(xì)菌,獲得了目的蛋白的表達(dá). 活性測(cè)定模型的構(gòu)建。我們從補(bǔ)體激活的經(jīng)典途徑出發(fā)構(gòu)建了鱖魚補(bǔ)體溶破紅細(xì)胞系統(tǒng)模型,為研究Lypn是否具有抑制補(bǔ)體的活性奠定了基礎(chǔ)。 上述研究結(jié)果,表明lypn基因的表達(dá)在ISKNV感染后
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