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文檔簡介
1、昆蟲和高等動物都已發(fā)現(xiàn)參與個體發(fā)育的Sox與Dmrt基因家族,這兩個基因家族在進(jìn)化上高度保守。Dmrt基因家族與性別決定相關(guān),該家族成員都含有一個具有DNA結(jié)合能力的保守基序―DM結(jié)構(gòu)域,以鋅指結(jié)構(gòu)與特異DNA序列結(jié)合,在性別決定和分化發(fā)育的調(diào)控中擔(dān)負(fù)著重要的功能。Sox家族成員的典型特征是編碼的蛋白質(zhì)都具有一個保守的基序HMG-box,可以與DNA序列特異性結(jié)合,促進(jìn)基因的特異轉(zhuǎn)錄,從而在胚胎發(fā)育及性別分化中起著重要的調(diào)控作用。
2、> 本文采用簡并PCR技術(shù),對尼氏真綏螨Sox基因的保守序列和Dmrt基因的DM結(jié)構(gòu)域進(jìn)行了擴(kuò)增、克隆和測序,并將序列與GenBank中其他物種的相應(yīng)序列進(jìn)行同源性比較;用Swiss-model軟件模擬編碼氨基酸三維結(jié)構(gòu),用MEGA4.0和ClustalW2等軟件構(gòu)建系統(tǒng)樹和分析了不同物種間Sox基因的保守序列和Dmrt基因的DM結(jié)構(gòu)域的進(jìn)化關(guān)系。
從尼氏真綏螨篩選克隆到4個Dmrt基因家族成員的DM結(jié)構(gòu)域,按通用命名法,根
3、據(jù)尼氏真綏螨的拉丁名Euseiusnicholsi,分別命名為EnDmrt2a,EnDmrt2b,EnDmrt2c,EnDmrt2d,它們與人DmrtA1、DmrtA2、DmrtA2、DmrtA1保守區(qū)的核苷酸的相似性分別為77%、76%、77%、72%,與人DmrtA2氨基酸序列的一致性分別為95%,95%,95%,91%;它們與人DmrtA2編碼的氨基酸三維模型間沒有明顯的變化;與人、獼猴、黃牛、鼠、褐牙鲆、太平洋牡蠣、大型蚤、果蠅
4、、線蟲等9個物種Dmrt基因DM結(jié)構(gòu)域編碼的氨基酸構(gòu)建的分子進(jìn)化樹表明,EnDmrt2a、EnDmrt2b、EnDmrt2和大型蚤聚為一類,與人等其他動物的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),EnDmrt2d與所有動物的親緣關(guān)系都遠(yuǎn)。
從尼氏植綏螨克隆得到了Sox基因HMG-box克隆,命名為EnSox1a。EnSox1a的核苷酸序列及其編碼氨基酸與其它無脊椎動物和脊椎動物物種的相似性分別達(dá)到74%-77%和85%-95%。與蜱、紅原雞、非洲爪蟾、
5、文昌魚、人、鼠、無腸蟲、野豬、貓等9種動物Sox基因的HMG-box編碼氨基酸序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹表明,EnSox1a單獨(dú)聚為一類,與其他物種的近緣關(guān)系較遠(yuǎn)。用EnSox1a、人Sox1和非洲爪蟾Sox2三者編碼氨基酸序列建立的三維結(jié)構(gòu)模型沒有幾乎沒有差異,說明不同物種Sox基因HMG-box具有功能上的相似性。
本研究結(jié)果顯示,在尼氏真綏螨基因組中存在著Sox和Dmrt基因家族的多個成員;與其他動物Sox和Dmrt基因的
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