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文檔簡介
1、引言:
腫瘤干細(xì)胞(tumor stem cells,TSCs)能夠進(jìn)行自我更新、無限制地生長并能產(chǎn)生異質(zhì)性的癌細(xì)胞。缺氧微環(huán)境作為腫瘤干細(xì)胞壁龕的重要組成部分,和實(shí)體腫瘤的進(jìn)展和預(yù)后密切相關(guān),并影響腫瘤中腫瘤干細(xì)胞的演進(jìn)和抗凋亡能力[1,2]。缺氧誘導(dǎo)因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)家族[3-7]包括HIF-1α和HIF-2α,在這些反應(yīng)中起著關(guān)鍵作用。近期研究表明,HIF-2α具有雙重性,可
2、能是致癌基因,也可能是抑癌基因,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程中起著關(guān)鍵作用,而且 HIF-2α基因在腫瘤干細(xì)胞中優(yōu)先表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),HIF-2α基因在多種人惡性腫瘤組織中(包括乳腺癌)均呈現(xiàn)高表達(dá)[8],可能涉及包括血管生成、腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移、腫瘤干細(xì)胞維持、抗凋亡、促進(jìn)耐藥基因的表達(dá)等多個(gè)方面,從而加速腫瘤惡性轉(zhuǎn)變。
本研究擬采用生物信息學(xué)工具分析 TCGA數(shù)據(jù)庫中1173例乳腺癌測序數(shù)據(jù),挖掘與缺氧相關(guān)的差異表達(dá)基因,尋找與HIF-2
3、α有差異表達(dá)關(guān)系的基因。通過Knock up/down技術(shù)分析相互之間的調(diào)控關(guān)系,明確HIF-2α在乳腺癌MCF-7細(xì)胞中的生物學(xué)功能,探索其促進(jìn)乳腺癌腫瘤干細(xì)胞發(fā)生的機(jī)制。
第一部分 TCGA數(shù)據(jù)庫挖掘HIF-2α及其表達(dá)相關(guān)基因在乳腺癌中表達(dá)及驗(yàn)證
目的:
檢測HIF-2α與其表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、SMAD2、OCT4在乳腺癌及癌組織中的表達(dá)水平。
方法:
利用生物信息學(xué)工具挖掘T
4、CGA數(shù)據(jù)庫,分析1173例浸潤性乳腺癌標(biāo)本的測序結(jié)果中尋找HIF-2α的表達(dá)相關(guān)基因及其相關(guān)通路,分析各個(gè)通路中可能與缺氧及腫瘤干細(xì)胞相關(guān)的基因;利用TCGA數(shù)據(jù)庫分析HIF-2α在1173乳腺癌組織中的表達(dá)情況,探討其表達(dá)程度與病人預(yù)后的相關(guān)性;采用IHC方法檢測45例女性乳腺癌組織中HIF-2α蛋白的表達(dá),并分析其與乳腺癌患者臨床病理的關(guān)系;采用Real-time PCR法檢測45例樣本中HIF-2α及其表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、S
5、MAD2、OCT4 mRNA表達(dá)情況及與乳腺癌患者臨床病理間的關(guān)系。
結(jié)果:
從TCGA數(shù)據(jù)庫中1173例乳腺癌標(biāo)本測序數(shù)據(jù)中分析獲得165個(gè)基因表達(dá)與HIF-2α呈正相關(guān),46個(gè)基因與HIF-2α呈負(fù)相關(guān);與缺氧及腫瘤干細(xì)胞形成相關(guān)的基因主要聚集在3條路徑上:HIF-1 signaling pathway、MAPK signaling pathway、TGF-βsignaling pathway;TCGA預(yù)后數(shù)據(jù)分
6、析顯示,HIF-2α高表達(dá)對乳腺癌患者來說意味著更差的預(yù)后;
免疫組化結(jié)果顯示HIF-2α蛋白在乳腺癌組織中的表達(dá)顯著高于癌旁組織中的表達(dá),并且HIF-2α蛋白在乳腺癌組織中的表達(dá)與腫瘤的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間存在顯著相關(guān)性 p<0.05;熒光定量 PCR檢測 HIF-2α及其表達(dá)相關(guān)基因 TGF-β、SMAD2、OCT4在乳腺癌組織中的基因表達(dá)水平分別為3.7211±1.4000、6.0131±1.1832、4.5751±1.118
7、4顯著高于癌旁組織P<0.05,與TCGA數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果一致。
小結(jié):
通過TCGA數(shù)據(jù)庫信息分析結(jié)合免疫組化結(jié)果發(fā)現(xiàn)HIF-2α高表達(dá)是乳腺癌不良預(yù)后的標(biāo)志;TGF-β、SMAD2、OCT4是缺氧條件下HIF-2α表達(dá)相關(guān)基因。
第二部分 HIF-2α在乳腺癌MCF-7細(xì)胞中生物學(xué)功能的研究
目的:
應(yīng)用慢病毒感染方法獲得MCF-7 HIF-2α knock up/down的穩(wěn)定細(xì)胞株
8、,進(jìn)一步研究HIF-2α對乳腺癌細(xì)胞MCF-7細(xì)胞的增殖能力、侵襲能力、克隆形成能力和遷移能力等分子機(jī)制的影響;
方法:
利用HIF-2α ORF和HIF-2α shRNA慢病毒分別轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞,篩選構(gòu)建MCF-7 HIF-2α knock up/down的穩(wěn)定細(xì)胞株;在MCF-7 HIF-2α knock down細(xì)胞株上聯(lián)合CoCl2誘導(dǎo)環(huán)境缺氧,利用Realtime-PCR和Western Blot方法分
9、別檢測HIF-2α及其表達(dá)相關(guān)基因(TGF-β、SMAD2和OCT4)mRNA和蛋白的表達(dá)水平;利用EdU檢測HIF-2α對細(xì)胞增殖的影響;利用CCK-8方法檢測細(xì)胞活力;細(xì)胞遷移能力的變化采用細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)檢測;細(xì)胞侵襲能力變化采用Transwell實(shí)驗(yàn)檢測;細(xì)胞的成瘤能力使用平板克隆形成實(shí)驗(yàn)檢測。
結(jié)果:
慢病毒感染后,通過篩選獲得穩(wěn)定的MCF-7 HIF-2α Knock up/down細(xì)胞株;Real-time
10、 PCR和Western blot結(jié)果顯示在CoCl2誘導(dǎo)的缺氧條件下,HIF-2α及其表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、SMAD2、OCT4表達(dá)上調(diào);在MCF-7 HIF-2α knock down細(xì)胞株中加入CoCl2,誘導(dǎo)形成缺氧環(huán)境,因RNAi的而存在無法上調(diào)HIF-2α的表達(dá),而HIF-2α表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、SMAD2、OCT4表達(dá)受到抑制;EdU檢測結(jié)果顯示在MCF-7細(xì)胞中上調(diào) HIF-2α后,MCF-7細(xì)胞的增殖能力增強(qiáng),即
11、HIF-2α的高表達(dá)促進(jìn)MCF-7細(xì)胞增殖;CCK-8檢測證實(shí)HIF-2α高表達(dá)增強(qiáng)細(xì)胞活力,促進(jìn)MCF-7腫瘤細(xì)胞增殖;細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)表明HIF-2α高表達(dá)促進(jìn)MCF-7腫瘤細(xì)胞遷移;Transwell小室實(shí)驗(yàn)顯示HIF-2α高表達(dá)促進(jìn)MCF-7腫瘤細(xì)胞的侵襲能力增強(qiáng);平板克隆形成實(shí)驗(yàn)表明HIF-2α高表達(dá)促進(jìn)MCF-7細(xì)胞成瘤。
小結(jié):
HIF-2α與TGF-β、SMAD2和OCT4表達(dá)具有相關(guān)性,且HIF-2α能
12、夠增加細(xì)胞活力,促進(jìn)細(xì)胞增殖和侵襲遷移;
第三部分 HIF-2α對乳腺癌腫瘤干細(xì)胞形成的影響
目的:
探討HIF-2α表達(dá)對低氧下乳腺癌腫瘤干細(xì)胞特性(Breast Cancer Stem Cells,BCSCs)的影響。
方法:
采用免疫磁珠法得到人乳腺癌 MCF-7干細(xì)胞株,感染慢病毒獲得 MCF-7 CSCs HIF-2α knock up/down細(xì)胞株;Realtime-PCR
13、和Western blot檢測HIF-2α、TGF-β、SMAD2、OCT4 mRNA及蛋白在MCF-7 CSCs、MCF-7 CSCsHIF-2α knock up/down細(xì)胞株中表達(dá)的變化;CCK-8檢測試劑盒檢測HIF-2α對MCF-7 CSC細(xì)胞增殖活力的影響;
CoCl2聯(lián)合無血清懸浮培養(yǎng)法培養(yǎng)MCF-7 knock up/down細(xì)胞株,誘導(dǎo)獲得“乳腺癌腫瘤干細(xì)胞(Breast Cancer Stem Cells
14、,BCSCs)微球體”;流式細(xì)胞儀被用來檢測細(xì)胞的凋亡及乳腺癌腫瘤干細(xì)胞標(biāo)志物 CD44+的表達(dá);裸鼠荷瘤實(shí)驗(yàn)比較MCF-7 Knock up/down腫瘤干細(xì)胞的腫瘤生長速度,及成瘤能力。
結(jié)果:
采用表面抗體標(biāo)記磁納米顆粒法分選獲得的乳腺癌MCF-7干細(xì)胞經(jīng)慢病毒感染后篩選獲得MCF-7 CSC HIF-2α knock up/down細(xì)胞株;Real-time PCR和Western blot結(jié)果顯示在MCF-
15、7 CSC HIF-2α knock up細(xì)胞株中,HIF-2α及表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、SMAD2、OCT4表達(dá)上調(diào);在MCF-7 HIF-2α knock down細(xì)胞株中因RNAi存在而抑制HIF-2α的表達(dá),HIF-2α表達(dá)相關(guān)基因TGF-β、SMAD2、OCT4表達(dá)變化無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;
流式細(xì)胞術(shù)檢測MCF-7 CSC HIF-2α knock up/down經(jīng)CoCl2聯(lián)合無血清懸浮培養(yǎng)的微球體中乳腺癌腫瘤干細(xì)胞標(biāo)志
16、物CD44+細(xì)胞比例顯示,MCF-7 HIF-2α knock up細(xì)胞株形成微球體中CD44+細(xì)胞比例(91.07%)顯著高于MCF-7(79.21%)和MCF-7 HIF-2α knock down細(xì)胞株(51.6%);CCK-8檢測結(jié)果顯示:HIF-2α過表達(dá)促進(jìn)MCF-7 CSC增殖;流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果顯示:HIF-2α過表達(dá)抑制MCF-7干細(xì)胞的凋亡;HIF-2α過表達(dá)的MCF-7干細(xì)胞成瘤能力明顯高于正常MCF-7干細(xì)胞和H
17、IF-2α下調(diào)的MCF-7干細(xì)胞。
小結(jié):
缺氧環(huán)境下上調(diào)HIF-2α能夠促進(jìn)MCF-7腫瘤干細(xì)胞的形成,并有促增殖作用和抑制MCF-7腫瘤干細(xì)胞凋亡,上調(diào)MCF-7腫瘤干細(xì)胞TGF-β、SMAD2和OCT4蛋白和mRNA的表達(dá)。裸鼠荷瘤實(shí)驗(yàn)證實(shí)HIF-2α過表達(dá)明顯增加MCF-7腫瘤干細(xì)胞的成瘤能力。
結(jié)論
1.乳腺癌組織中HIF-2α過表達(dá),可能與乳腺癌的預(yù)后相關(guān);
2、在缺氧微環(huán)境
18、中TGF-β、SMAD2、OCT4是HIF-2α的表達(dá)相關(guān)基因;
3、在乳腺癌MCF-7細(xì)胞及MCF-7干細(xì)胞中過表達(dá)HIF-2α能夠增強(qiáng)細(xì)胞活力,促進(jìn)細(xì)胞增殖,增加腫瘤細(xì)胞的侵襲、遷移和成瘤能力;
4、缺氧條件下,上調(diào)MCF-7細(xì)胞中HIF-2α的表達(dá),能夠促進(jìn)MCF-7 CSCs的發(fā)生;
5、HIF-2α過表達(dá)的MCF-7 CSCs成瘤能力明顯高于正常MCF-7 CSCs和HIF-2α下調(diào)的MCF-7
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