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文檔簡(jiǎn)介
1、腫瘤的化療耐藥是導(dǎo)致腫瘤患者治療過(guò)程中死亡的主要原因,但腫瘤化療耐藥具體的分子機(jī)制并不清楚。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類(lèi)長(zhǎng)度大于200nt的非編碼RNA。目前越來(lái)越多的研究表明,lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中,發(fā)揮著重要的作用。lncRNA發(fā)揮作用的機(jī)制較為復(fù)雜,近年來(lái)文獻(xiàn)指出,lncRNA可以通過(guò)吸附microRNA間接調(diào)控基因的表達(dá),參與腫瘤進(jìn)程;可以通過(guò)吸附蛋白,對(duì)蛋白進(jìn)行修飾
2、,從而通過(guò)調(diào)控蛋白水平發(fā)揮作用;也可以在細(xì)胞核中富集,通過(guò)招募或者阻礙某些核轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,在基因的表達(dá)層面發(fā)揮調(diào)控作用;還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)核小體空間的重新構(gòu)向,繼而改變基因的表達(dá)。lncRNA豐富的調(diào)控機(jī)制,使得lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程發(fā)揮多種不同的功能。目前已有文獻(xiàn)報(bào)道,某些lncRNA參與了腫瘤的化療耐藥過(guò)程,可能是導(dǎo)致腫瘤化療耐藥的關(guān)鍵因素。因此,研究lncRNA在腫瘤化療耐藥中的關(guān)鍵作用,將可以闡明腫瘤發(fā)生化療耐藥的新機(jī)制,補(bǔ)
3、充腫瘤進(jìn)展的理論依據(jù),為臨床治療提供新的策略和藥物作用靶點(diǎn)。
目的:本研究通過(guò)篩選在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNA,并分析其在胃癌化療耐藥中的作用。
方法:
(1)通過(guò)lncRNA芯片篩選出在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNA;
(2)通過(guò)qRT-PCR技術(shù),在60例胃癌患者中檢測(cè)該lncRNA的表達(dá)水平,并結(jié)合臨床病理資料,分析該lncRNA的臨床相關(guān)性;
(3)檢測(cè)該lncRNA在不同胃
4、癌細(xì)胞中的表達(dá)情況,并通過(guò)干擾慢病毒在高表達(dá)該lncRNA的胃癌細(xì)胞中降低其表達(dá),形成穩(wěn)定低表達(dá)的胃癌細(xì)胞系作為模型;
(4)采用CCK8實(shí)驗(yàn)、Transwell實(shí)驗(yàn)、劃痕實(shí)驗(yàn)、流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞周期、裸鼠皮下成瘤實(shí)驗(yàn)、裸鼠腹腔轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)、裸鼠尾靜脈轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn),對(duì)該lncRNA的功能進(jìn)行檢測(cè);
(5)通過(guò)原位雜交技術(shù),檢測(cè)lncRNA在胃癌細(xì)胞和胃癌組織中的定位情況;
(6)通過(guò)表達(dá)譜芯片分析該lncRNA參與
5、細(xì)胞的具體功能;
(7)通過(guò)RNA pull-down技術(shù)檢測(cè)該lncRNA可能結(jié)合的蛋白,并分析其余l(xiāng)ncRNA功能之間的關(guān)系;
(8)檢測(cè)lncRNA的表達(dá)對(duì)于胃癌細(xì)胞奧沙利鉑敏感性的影響。
結(jié)果:
(1)篩選在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNA:我們通過(guò)lncRNA芯片篩選出在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNAs,并通過(guò)表達(dá)倍數(shù)、表達(dá)特異性篩選出15條在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNA。同時(shí)在10例胃
6、癌患者癌組織和癌旁組織中進(jìn)行驗(yàn)證,最終確定表達(dá)差異最明顯且最有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的lncRNA為lncRNA AK095203。
(2)lncRNA AK095203在胃癌組織中的表達(dá)情況及其臨床意義:我們通過(guò)qRT-PCR實(shí)驗(yàn),在60例胃癌組織和癌旁組織中檢測(cè)lncRNA AK095203的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)lncRNAAK095203在胃癌組織中高表達(dá)(P=0.00662),且lncRNA的表達(dá)與胃癌大小呈正相關(guān),與胃癌分化程度呈反相
7、關(guān)。
(3)lncRNA AK095203的表達(dá)對(duì)胃癌細(xì)胞行為學(xué)的影響:我們通過(guò)構(gòu)建穩(wěn)定低表達(dá)的胃癌細(xì)胞株SGC7901和BGC823,CCK8實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)lncRNA AK095203的低表達(dá),胃癌細(xì)胞的增殖能力受到了明顯抑制;流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞周期發(fā)現(xiàn),干擾lncRNAAK095203的表達(dá)后,胃癌細(xì)胞難以進(jìn)入G2期;Transwell實(shí)驗(yàn)和劃痕實(shí)驗(yàn)表明,干擾lncRNA AK095203可以明顯抑制胃癌細(xì)胞的侵襲和遷移能力;
8、裸鼠皮下成瘤實(shí)驗(yàn)、裸鼠腹腔種植轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)、裸鼠強(qiáng)制肺轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)則從體內(nèi)實(shí)驗(yàn)角度證明了干擾lncRNAAK095203的表達(dá),胃癌細(xì)胞的增殖和侵襲能力受到了明顯抑制。
(4)lncRNA AK095203在胃癌細(xì)胞和組織中的定位:我們通過(guò)原位雜交實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),lncRNAAK095203主要在細(xì)胞核中富集。
(5)表達(dá)譜芯片分析lncRNA AK095203的具體功能:我們通過(guò)表達(dá)譜芯片檢測(cè)發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA AK0952
9、03的表達(dá)后胃癌細(xì)胞的細(xì)胞分裂相關(guān)基因、DNA損傷修復(fù)相關(guān)基因的表達(dá)受到了明顯抑制,提示lncRNA AK095203與細(xì)胞分裂、DNA損傷修復(fù)密切相關(guān)。
(6)我們通過(guò)RNA pull-down實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),lncRNAAK095203可以與SSRP1和H2A/H2B結(jié)合,而SSRP1與胃癌奧沙利鉑導(dǎo)致的DNA損傷修復(fù)密切相關(guān),lncRNAAK095203可能是通過(guò)與SSRP1結(jié)合,從而導(dǎo)致胃癌奧沙利鉑耐藥的。
(7)
10、我們發(fā)現(xiàn)干擾lncRNA AK095203的表達(dá)后,胃癌細(xì)胞SGC7901和BGC823對(duì)奧沙利鉑敏感性明顯增加。
結(jié)論:
(1)我們通過(guò)lncRNA芯片和qRT-PCR實(shí)驗(yàn),篩選出一條在胃癌組織中高表達(dá)的lncRNA,即lncRNA AK095203,并通過(guò)臨床病理資料分析發(fā)現(xiàn),該lncRNA的表達(dá)與胃癌大小、分化程度密切相關(guān)。
(2)轉(zhuǎn)染干擾慢病毒,形成穩(wěn)定抑制lncRNA AK095203表達(dá)的細(xì)胞系
11、,并通過(guò)體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA AK095203的表達(dá),胃癌細(xì)胞的增殖能力、侵襲能力受到了明顯抑制。
(3)表達(dá)譜芯片顯示,lncRNA AK095203的表達(dá),與細(xì)胞分裂功能、DNA損傷修復(fù)關(guān)系密切。
(4)通過(guò)RNA pull-down實(shí)驗(yàn)和原位雜交聯(lián)合免疫熒光實(shí)驗(yàn),我們初步證明lncRNAAK095203可以與SSRP1和H2A/H2B結(jié)合。干擾lncRNA AK095203的表達(dá),胃癌細(xì)胞對(duì)奧沙利
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