基于基因芯片數(shù)據(jù)初步分析絨氈層轉(zhuǎn)錄調(diào)控通路.pdf

1、花粉的正常形成，在植物的生殖過程中起重要的作用，花粉的正常發(fā)育，既取決于配子自身的分子與細(xì)胞功能，也依賴于花藥特別是絨氈層細(xì)胞的供給支持。模式植物擬南芥絨氈層的發(fā)育過程由一系列復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)所控制，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及特定基因與其它基因的調(diào)控關(guān)系對(duì)于發(fā)育分子機(jī)理深入研究具有重要的意義。由于絨氈層在花粉發(fā)育過程中的重要作用，目前已經(jīng)有5個(gè)與絨氈層發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子其的功能被報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)室的前期工作確定了這5個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的上下游關(guān)系。但是DYT1

2、、TDF1、AMS、AtMYB103四個(gè)轉(zhuǎn)錄因子怎樣調(diào)控絨氈層發(fā)育，調(diào)控絨氈層發(fā)育的哪幾個(gè)生物過程，目前尚不清楚。
　　 本研究以擬南芥突變體dyt1，tdf1，ams,ms188的花序?yàn)椴牧线M(jìn)行生物芯片分析，產(chǎn)生高通量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。選取芯片信號(hào)值(突變體/野生型)＜0.5的基因作為下調(diào)基因，根據(jù)GO和Mapman數(shù)據(jù)庫(kù)的信息將不同突變體背景的下調(diào)基因逐一進(jìn)行功能分類。經(jīng)過分類分析，下調(diào)基因，主要可以分為五個(gè)功能類：蛋白質(zhì)降解、R