蛋白質(zhì)分子表面構(gòu)建與靜電勢(shì)分析.pdf

1、蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)，研究蛋白質(zhì)分子具有重要的意義。這主要體現(xiàn)在：首先，蛋白質(zhì)是細(xì)胞中的主要功能分子，大多數(shù)的生命功能都需要蛋白質(zhì)來調(diào)控。其次，蛋白質(zhì)也是細(xì)胞中含量最為豐富的分子之一。因此，蛋白質(zhì)分子的功能和結(jié)構(gòu)的研究一直是生命科學(xué)研究的熱點(diǎn)。蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)決定其功能。特別的，分子表面原子之間的結(jié)構(gòu)對(duì)功能影響極大。另外，在研究蛋白質(zhì)分子時(shí)，分析靜電勢(shì)場(chǎng)是一個(gè)主要的手段。本文從上述兩個(gè)方面對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行分析。
　　 在前人構(gòu)建的蛋

2、白質(zhì)分子表面原子拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)SASG的基礎(chǔ)上，本文提出了表面原子圖SAG的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和相關(guān)算法，通過構(gòu)建SAG并且搜索SAG的表面原子連通子圖，找到真正的表面原子，去掉了由于SASG計(jì)算所包含的一些多余的原子。在提取表面原子的基礎(chǔ)上，構(gòu)建了蛋白質(zhì)分子的溶劑外部曲面(SES)，結(jié)果表明用新的方法構(gòu)建的SES更符合其定義。另外，把提取的表面原子還應(yīng)用到搜索蛋白質(zhì)分子吸附取向等問題的研究中，結(jié)果表明本文的方法是高效而且是有意義的。
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