急性肝衰竭小鼠回腸、結(jié)腸以及糞便菌群變化的研究.pdf

1、目的：探討急性肝衰竭小鼠腸道微生態(tài)菌群的變化，尋找特征性差異菌，為急性肝衰竭腸道微生態(tài)紊亂的診治提供依據(jù)。
　　方法：BALB/c雄鼠30只（空白組5只，模型組25只），D-氨基半乳糖制造小鼠急性肝衰竭模型。提取小鼠下消化道不同節(jié)段（回腸、結(jié)腸）內(nèi)容物及糞便的微生物DNA，進行PCR擴增，對16S V3-V4區(qū)進行高通量測序，利用生物信息學(xué)分析技術(shù)對測序結(jié)果進行OTU聚類，物種注釋，α多樣性分析，LEfSe(LDA Effect

2、Size)分析，尋找模型組特征性差異菌。
　　結(jié)果：2組小鼠，共存活10只，其中模型組死亡率為80%?；啬c、結(jié)腸內(nèi)容物及糞便共30個樣本，測序覆蓋深度>97%。α多樣性分析顯示急性肝衰竭小鼠回腸中細菌豐度增加（chao1指數(shù)105.7±18.4與149.3±55，P<0.01），多樣性增加（shannon指數(shù)2.5±0.1與2.8±0.8，P<0.05）；結(jié)腸中細菌豐度減低（chao1指數(shù)285.4±46.1與276.98±46.

3、7，P<0.05）及多樣性增加（shannon指數(shù)4.9±0.3與5.65±0.39，P<0.01），糞便中細菌多樣性降低（shannon指數(shù)5.1±0.3與4.87±0.29，P<0.01），豐度（chao1指數(shù)270.1±53.7與250.2±54.4，P=0.067）無顯著差異。模型組腸道菌群與空白組相比小鼠腸道中檢測到10個菌門，以厚壁菌門、擬桿菌門和變形菌門為主。模型組回腸中細菌門水平差異無統(tǒng)計學(xué)意義；結(jié)腸中擬桿菌門比例增加（

4、9.3%±7.9%與33.8%±18.2%，P=0.024<0.05），TM7菌門比例增加（0.2%±0.3%與2.2%±1.6%，P=0.029<0.05）；糞便中厚壁菌門減少（32.8%±20.5%與10.2%±5.5%，P=0.05）、擬桿菌門增加（57.3%±23.4%與86.1%±67.2%，P=0.07），但差異無統(tǒng)計學(xué)意義。在最佳分類水平上，回腸梭菌科豐度減少（44.95%±19.28%與7.51%±16.57%,P<0.

5、05），結(jié)腸理研菌科（1.08%±1.01%與4.18%±2.39%,P<0.05）、S24-7（4.75%±4.87%與22.77%±13.05%,P<0.05）、F16（0.24%±0.28%與2.18%±1.61%,P<0.05）等豐度增加。LEfSe(LDA Effect Size)分析顯示兩組在葡萄球菌科、S24-7方面差異有統(tǒng)計學(xué)意義，其中S24-7可定義為特征性差異菌群。
　　結(jié)論：不同節(jié)段腸道擁有不同的腸道菌群結(jié)構(gòu)