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文檔簡介
1、蝙蝠是數(shù)量僅次于嚙齒類動(dòng)物的翼手目(Chiroptera)類哺乳動(dòng)物,共包含19個(gè)科962種,在全球范圍內(nèi)廣泛分布。蝙蝠攜帶病原種類繁多,其中檢測到病毒137種,涉及人畜共患病病毒61種。值得注意的是這其中包括一些對(duì)人高致病性的病毒,如SARS樣冠狀病毒(SARS-like coronavirus)、埃博拉病毒(Ebola virus)、馬爾堡病毒(Marburg virus)、狂犬病毒(Rabies virus)、登革病毒(Dengu
2、e virus)等。近期研究結(jié)果表明一些新病毒正陸續(xù)從蝙蝠體內(nèi)被發(fā)現(xiàn),包括肝炎病毒(Hepatitis virus)、呼腸孤病毒(Retrovirus)、博卡病毒(Bocavirus)、圓環(huán)病毒(Circovirus)、星狀病毒(Astrovirus)等均發(fā)現(xiàn)一些新的種。2003年的“非典”疫情,共造成全球8,000多人感染,至少800人死亡,使冠狀病毒在全球范圍內(nèi)引起關(guān)注。2014年西非的埃博拉疫情,導(dǎo)致6,388人喪生,確診或疑似感
3、染病例17,942個(gè)。2016年阿根廷的登革病毒疫情,造成15,000人感染。引發(fā)這幾次疫情的病原有一個(gè)共同的動(dòng)物宿主——蝙蝠。因此,蝙蝠作為自然界貯存病原的巨大病原庫,引起了越來越多科研工作者的關(guān)注。
病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)理論基礎(chǔ)上,結(jié)合傳統(tǒng)病原檢測技術(shù)新興的學(xué)科分支,其應(yīng)用迅速展示出巨大的優(yōu)越性,尤其是在新發(fā)病毒的發(fā)現(xiàn)和預(yù)警方面,突破了傳統(tǒng)方法依賴病毒保守基因序列的局限性。本研究基于病毒宏基因組學(xué)策略,系統(tǒng)分析20
4、15年7-8月從我國東南沿海部分地區(qū)共收集的5種210只蝙蝠。對(duì)采集的蝙蝠的腸和肺組織進(jìn)行高通量測序,對(duì)測序結(jié)果進(jìn)行分類整理,發(fā)現(xiàn)獲得的序列信息共涉及38個(gè)病毒科。其中包括16個(gè)脊椎動(dòng)物病毒科、4個(gè)植物病毒科、5個(gè)昆蟲病毒科。感染脊椎動(dòng)物的病毒包括冠狀病毒科(Coronaviridae)、腺病毒科(Adenoviridae)、皰疹病毒科(Herpesviridae)、雙小RNA病毒科(Picornaviridae)、逆轉(zhuǎn)錄病毒科(Ret
5、roviridae)、非洲豬瘟樣病毒病毒科(Asfarviridae)、星狀病毒科(Astroviridae)、杯狀病毒科(Caliciviridae);圓環(huán)病毒科(Circoviridae)、肝炎病毒科(Hepeviridae)、乳頭瘤病毒科(Papillomaviridae)、細(xì)小病毒科(Parvoviridae)、呼腸孤病毒科(Retroviridae);黃病毒科(Flaviviridae)、痘病毒科(Poxviridae)和披膜
6、病毒科(Togaviridae)。通過序列分析比較發(fā)現(xiàn),不同地區(qū)和不同蝙蝠種類在注釋到的病毒種類、序列方面存在同源性和豐度差異。初步掌握了東南沿海部分地區(qū)蝙蝠攜帶病毒的生態(tài)學(xué)狀況,為下一步驗(yàn)證工作的開展提供了方向。
根據(jù)宏基因組注釋信息,選取了圓環(huán)病毒、博卡病毒、軟腐病毒等設(shè)計(jì)簡并引物,應(yīng)用特異性RT-PCR檢測方法,獲取了上述病毒在蝙蝠體內(nèi)和不同地域的攜帶和分布情況。結(jié)果顯示在舟山、岱山、長樂、連江蝙蝠體內(nèi)各檢測到1株圓環(huán)病
7、毒,分別命名為BtCV-ZS62、BtCV-DS13、BtCV-CL6、BtCV-LJ22;在岱山蝙蝠體內(nèi)檢測到2株博卡病毒,命名為:BtBov-DS9和BtBov-DS10;在廈門蝙蝠體內(nèi)檢測到2株軟腐病毒,命名為BtIFA-XM9和BtIFA-XM10?;诤昊驕y序注釋信息,借助已知同源序列保守區(qū)設(shè)計(jì)系列簡并套式引物,經(jīng)反向PCR擴(kuò)增、序列測定和拼接,進(jìn)一步獲得了其中4株圓環(huán)病毒的全基因序列(1,873bp、1,910bp、2,0
8、51bp、1,806bp)和1株博卡病毒的大部分序列(3,921bp)。依據(jù)國際病毒分類委員會(huì)(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)關(guān)于圓環(huán)病毒新種的判定標(biāo)準(zhǔn),初步判斷BtCV-ZS62、BtCV-DS13、BtCV-CL6、BtCV-LJ22是四種新的蝙蝠圓環(huán)病毒,屬于圓環(huán)病毒科,圓環(huán)病毒屬。根據(jù)ICTV關(guān)于博卡細(xì)小病毒新種的判定標(biāo)準(zhǔn),初步判斷BtBov-DS10是一
9、株全新的博卡細(xì)小病毒。
在獲得上述病毒基因組信息基礎(chǔ)上,選取圓環(huán)病毒、博卡病毒進(jìn)行重組結(jié)構(gòu)蛋白制備和血清流行病學(xué)初步分析,選擇結(jié)構(gòu)蛋白BtB OV-DS10-NP和BtCV-DS13-Cap進(jìn)行原核表達(dá)和純化,探索從血清學(xué)水平初步驗(yàn)證蝙蝠攜帶病毒情況,以期完善病毒感染的流行病學(xué)證據(jù)鏈。
我國蝙蝠種類豐富,有7科130種,分布廣泛,其生態(tài)圈與人類活動(dòng)圈有較大交叉。因此開展我國蝙蝠攜帶病毒的自然本底調(diào)查對(duì)于預(yù)防新發(fā)傳染病
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