基于猬蝦線粒體基因組的十足目高級(jí)階元系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、進(jìn)入二十一世紀(jì)以來(lái)，利用線粒體基因組研究十足目動(dòng)物的高階系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系得到了很多學(xué)者的重視。到目前為止，已經(jīng)有30多個(gè)十足目物種的線粒體基因組被測(cè)定，但是所得到的基因組數(shù)據(jù)在十足目?jī)?nèi)部個(gè)分類單元的分布極不均衡。
　　十足目是一類物種極其多樣的甲殼動(dòng)物，作為系統(tǒng)發(fā)育研究的重要類群，眾多學(xué)者對(duì)十足目的形態(tài)學(xué)與分子生物學(xué)方面做了大量研究。十足目本身作為一個(gè)單系群已為大多數(shù)學(xué)者認(rèn)可，但是對(duì)于十足目?jī)?nèi)部的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系還沒(méi)有達(dá)成一致的認(rèn)識(shí)。

2、r>　　迄今為止，還沒(méi)有猬蝦下目的線粒體基因組全序列數(shù)據(jù)，本文第一次報(bào)道了來(lái)自猬蝦下目的Stenopus hispidus(Olivier1811).的線粒體基因組全序列。Stenopushispidus線粒體基因全長(zhǎng)為15，528 bp，包含13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)核糖體RNA基因和一個(gè)非編碼的AT富含區(qū)；與后生動(dòng)物典型的線粒體基因組22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因相比，存在1個(gè)trnQ基因的重復(fù)，一共含有23個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因。和泛甲殼動(dòng)物的線

3、粒體基因組原始排列相比，Stenopus hispidus線粒體基因組全序列的基因排列出現(xiàn)了5個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因的易位(trnL1，trnE，trnR，trnM，trnQ)，1個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因的倒置(trnL1)，還有1個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因的重復(fù)(trnQ)?？梢钥闯?，在猬蝦下目中線粒體基因的基因序列排列并不保守。
　　基于線粒體基因組的13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的核苷酸和氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育分析支持十足目(Decapoda)、枝鰓亞目(De

4、ndrobranchiata)、腹胚亞目(Pleocyemata)、和爬行亞目(Reptantia)的單系性。本研究也支持真蝦下目(Caridea)、猬蝦下目(Stenopodidea)、異尾下目(Anomura)、短尾下目(Anomura)、龍蝦下目(Palinura)和鰲蝦下目(Astacidea)的單系性。研究結(jié)果表明真蝦下目(Caridea)位于腹胚亞目(Pleocyemata)基部位置，猬蝦下目(Stenopodidea)和爬