整合組學(xué)數(shù)據(jù)構(gòu)建條件特異性代謝網(wǎng)絡(luò)模型.pdf

1、全基因組規(guī)模代謝網(wǎng)絡(luò)模型為生物代謝特征研究提供了一個(gè)強(qiáng)大的工具。然而在不同的組織或不同環(huán)境中，生物會(huì)有不同的響應(yīng)機(jī)制，因此，有必要構(gòu)建條件特異的代謝模型來(lái)真實(shí)揭示生物特定條件下的代謝狀態(tài)。我們通過(guò)整合組學(xué)數(shù)據(jù)到植物的代謝網(wǎng)絡(luò)模型，分別探索不同CO2濃度下擬南芥的響應(yīng)機(jī)制和玉米葉片不同發(fā)育階段的光合作用模式。對(duì)于深入探究C3和C4兩種類型植物代謝機(jī)制，將C4植物光合特征引入C3植物提供重要指導(dǎo)。
　　CO2對(duì)光合作用具有非常重要的影

2、響。我們利用系統(tǒng)生物學(xué)思想，整合不同CO2濃度下的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，構(gòu)建四種不同CO2濃度的網(wǎng)絡(luò)模型。從基因表達(dá)層面和代謝流層面分別分析擬南芥的響應(yīng)機(jī)制。發(fā)現(xiàn)擬南芥應(yīng)對(duì)不同CO2濃度的不同代謝途徑的變化；不同CO2基因表達(dá)水平和代謝流水平兩個(gè)層面的保守性和差異性；通過(guò)這兩個(gè)層面的比較，預(yù)測(cè)出不同CO2濃度下的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控信息。
　　以玉米葉片不同發(fā)育區(qū)段的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，構(gòu)建不同區(qū)段特異的代謝網(wǎng)絡(luò)模型，探究玉米不同區(qū)段代謝狀態(tài)，發(fā)現(xiàn)