[雙語翻譯]外文翻譯-分枝桿菌基因型直接檢測(cè)痰標(biāo)本對(duì)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體的評(píng)價(jià)（譯文）

1、中文 中文 5400 字， 字，3700 單詞， 單詞，2 萬英文字符 萬英文字符出處： 出處：Ki?Raz N, Sagli?K I, Ki?Remi?Tci? A, et al. Evaluation of the GenoType Mycobacteria Direct assay for direct detection of the Mycobacterium tuberculosis complex obtained fro

2、m sputum samples.[J]. Journal of Medical Microbiology, 2010, 59(8):930-934.分枝桿菌基因型直接檢測(cè)痰標(biāo)本對(duì)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌 分枝桿菌基因型直接檢測(cè)痰標(biāo)本對(duì)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體的評(píng)價(jià) 復(fù)合體的評(píng)價(jià)Nuri Kiraz, Imran Saglik, Abdurrahman Kiremitci, Nilgun Kasifoglu and Yurdanur Akgun摘

3、要 摘要近年來結(jié)核?。═B）患病率的增加加快了新的結(jié)核感染的快速診斷工具的出現(xiàn)。這項(xiàng)研究評(píng)估痰標(biāo)本的分枝桿菌基因型（GTMD）的直接檢測(cè)來檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體（MTBC），它與傳統(tǒng)的方法相比。GTMD 方法是一種商業(yè)的測(cè)定，基于核酸序列的擴(kuò)增技術(shù)。這個(gè)方法可以基于23S rRNA 基因擴(kuò)增檢測(cè) MTBC，鳥分枝桿菌，胞內(nèi)分枝桿菌，堪薩斯分枝桿菌等。通過凈化的臨床樣本在 6 h 內(nèi)完成。在本研究中，115 例痰標(biāo)本處理，使用顯微鏡方法

4、（苯酚品紅和熒光染色法），兩種培養(yǎng)方法羅氏培養(yǎng)和 BACTEC 培養(yǎng)法，及 GTMD 法檢測(cè)抗酸桿菌（AFB）。結(jié)果表明，86 例樣本直接鏡檢陽性，84 例 BACTEC 培養(yǎng)陽性，73 呈羅氏培養(yǎng)陽性，95GTMD 法呈陽性。所有的菌株都是 MTBC。此外，GTMD 法檢測(cè)患者 MTBC 的敏感性和特異性分別為 97％和 58％，結(jié)合培養(yǎng)法作為金標(biāo)準(zhǔn)。GTMD 法與行抗結(jié)核病治療的患者的樣本培養(yǎng)相比，測(cè)試的敏感性和特異性分別為 100

5、 和 15％。低的特異度可能因?yàn)橐种屏私Y(jié)核菌的增值。由于這兩種方法的目標(biāo)為相同的活菌，不同之處是顯著的。當(dāng)結(jié)合培養(yǎng)結(jié)果和臨床表現(xiàn)對(duì)患者進(jìn)行評(píng)估（真陽性標(biāo)本），所有患者的 GTMD 法的敏感性和特異性值分別為 97％和 90％。然而，當(dāng)患者接受抗結(jié)核治療后這兩個(gè)值會(huì)提高到 100％。這些結(jié)果暗示，為確定患者的痰是否包含活的 AFB，應(yīng)在患者的隨訪過程中采用的更敏感的技術(shù)。以上結(jié)果表明，GTMD 法可以作為臨床和影像學(xué)懷疑結(jié)核病但分枝桿菌涂

6、片陰性的病例的早期診斷方法。此外，在涂片陽性的情況下使用 GTMD 法對(duì)于快速鑒別 MTBC是有益的且實(shí)用的，這允許了更快速的處理決定和感染控制措施。簡(jiǎn)介 簡(jiǎn)介結(jié)核?。═B）仍然是一個(gè)重要的社區(qū)衛(wèi)生問題。據(jù)世界衛(wèi)生組織估計(jì)，每年 800 萬新發(fā)結(jié)核病例，現(xiàn)報(bào)道是在 2-3 萬患者死亡的原因。每一個(gè)未經(jīng)治療的肺結(jié)核病人一年導(dǎo)致 10-15 多人疾病的傳播。這使得結(jié)核病成為感染性疾病死亡的最重要原因之一。最有效保護(hù)的手段是在疾病的早期診斷和

7、治療。初步診斷根據(jù)臨床發(fā)現(xiàn)，但確定診斷基于實(shí)驗(yàn)室的方法。結(jié)核病診斷的金標(biāo)準(zhǔn)是培養(yǎng)，但耗時(shí)長(zhǎng)。因此，分子生物學(xué)方法可用于鑒別。在過去的十年中，已經(jīng)開發(fā)了幾種分子生物學(xué)方法直接檢測(cè)和鑒定臨床標(biāo)本中結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體（MTBC）。分枝桿菌基因型直接檢測(cè)（GTMD 法）是一個(gè)商業(yè)化的利用 DNA 探針檢測(cè)技術(shù)和反向雜交技術(shù)的一種方法法。這個(gè)方法直接從凈化的臨床樣本鑒定分枝桿菌分子。在我們的研究中，我們的目的是通過使用兩種不同的方法（苯酚品紅和熒

8、光染料）染色直接鏡檢檢測(cè)細(xì)菌的存在下，結(jié)合一個(gè)分子的方法，GTMD 法，與傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法對(duì)比，檢測(cè)感染患者的痰標(biāo)本。上一節(jié)下一個(gè)節(jié)方法 方法患者和應(yīng)變 患者和應(yīng)變總體而言，目前的研究結(jié)果表明， 115 痰標(biāo)本檢測(cè)分枝桿菌中 84 例 BACTEC 培養(yǎng)法陽性，73 例羅氏培養(yǎng)法陽性，95 例 GTMD 法呈陽性。總 17 痰標(biāo)本所有檢查均為陰性， 98 例至少其中一種方法陽性。此外，我們采用直接鏡檢檢測(cè)到 86 個(gè)痰標(biāo)本中的 AFS。為

9、了提高靈敏度，我們準(zhǔn)備了兩個(gè)直接和兩個(gè)均質(zhì)凈化為每一個(gè)病人的痰標(biāo)本涂片。當(dāng)我們均質(zhì)凈化痰標(biāo)本涂片檢查，我們發(fā)現(xiàn)在 86 和 66 個(gè)樣本，分別使用熒光燈及苯酚品紅染色檢查。由于苯酚品紅染色陽性患者的熒光染色也呈陽性，我們用熒光染色涂片制備勻漿凈化痰標(biāo)本直接鏡檢結(jié)果。石炭酸品紅染色結(jié)果表明，66 個(gè)樣本中，15 個(gè)患者痰標(biāo)本中 AFB 均為陰性，全部 66 個(gè)均質(zhì)凈化痰標(biāo)本涂片均陽性。同樣，雖然 86 制備勻漿凈化痰標(biāo)本熒光染色涂片呈陽性

10、，10 例痰標(biāo)本涂片為陰性。檢驗(yàn)這些不同的樣品中，我們把從均質(zhì)化和凈化的痰標(biāo)本涂片制備了細(xì)菌描述為'+'，中等數(shù)量的細(xì)菌為“+ +”。因此，目前的研究結(jié)果表明，只有少數(shù)的細(xì)菌直接涂片 AFB 增長(zhǎng)可能無法檢測(cè)到。此外，而只有少數(shù)幾個(gè)苯酚品紅染色培養(yǎng)（'+'），并從少量痰直接涂片，勻漿凈化痰涂片染色呈陰性。這一觀察結(jié)果暗示，痰標(biāo)本直接涂片往往無法檢測(cè)到結(jié)核菌的增長(zhǎng)，可能會(huì)浪費(fèi)時(shí)間和工作量。然而，直接涂片對(duì)少

11、量痰標(biāo)本是有用的，可能是同質(zhì)化和凈化程序稀釋樣品，導(dǎo)致結(jié)核菌的減少。染色和培養(yǎng)方法的比較示于表 1 中。用熒光染色，我們發(fā)現(xiàn) 31 個(gè)痰標(biāo)本中 7 個(gè)陽性，但并沒有顯示出任何增長(zhǎng)。這 7 個(gè)痰標(biāo)本取自抗結(jié)核治療下的患者。與培養(yǎng)相比，熒光染色法的敏感性和特異性分別為 94％和 77％。GTMD 測(cè)試結(jié)果和直接顯微鏡比較示表 1 中。有兩個(gè) GTMD 陽性而熒光染色陰性的樣本。這些樣品取自抗結(jié)核治療下的病人，這 2 個(gè)樣本的細(xì)菌密度為被確定

12、為“+”，該樣品沒有表現(xiàn)出增長(zhǎng)。我們得出的結(jié)論是，該樣品檢驗(yàn)陽性可能是由于存在死菌。同樣地，其他樣品的細(xì)菌密度被確定為“+”。樣本取自未抗結(jié)核治療的一個(gè)病人，并在 18 天內(nèi)表現(xiàn)出增長(zhǎng)（BACTEC）。由于我們觀察到 GTMD 內(nèi)部控制放大頻帶上的條帶，在樣品中的抑制劑的存在下，不考慮結(jié)果假陰性。相比直接顯微鏡檢查，GTMD 測(cè)試其敏感性，特異性和陽性預(yù)測(cè)值（PPV）和陰性預(yù)測(cè)值（NPV）分別為 98，62，88 和 90％。84 個(gè)和

13、 73 個(gè)痰標(biāo)本分別在 BACTEC 和的羅氏培養(yǎng)基檢查呈陽性。羅氏培養(yǎng)基上的所有的增長(zhǎng)模式是一致 MTBC（淺奶油色，粗糙，面包屑狀菌落）。BACTEC 培養(yǎng)基生長(zhǎng)地由 NAP 試驗(yàn)來確定為 MTBC。此外，82/84 的痰標(biāo)本 GTMD 法培養(yǎng)陽性也驗(yàn)證為陽性（表 1 ）。其余兩個(gè)樣本的培養(yǎng)陽性，但 GTMD 陰性。直接鏡檢檢查陰性的情況下行 GTMD 法。GTMD 測(cè)試陰性，可能是由于在此樣品中只有少數(shù)細(xì)菌的存在。同樣，其他樣本的

14、細(xì)菌密度直接鏡檢檢查后確定為“+”，這個(gè)樣品是取自沒有收到抗結(jié)核治療的病人。由于我們 GTMD 法檢測(cè)到內(nèi)部控制放大頻帶，不考慮樣品中的抑制劑的發(fā)生和假陰性的結(jié)果，解釋為由于只有少數(shù)細(xì)菌存在的。此外，GTMD 測(cè)試呈陽性的 13 個(gè)痰標(biāo)本沒有表現(xiàn)出生長(zhǎng)，其中 11 個(gè)患者獲得了抗結(jié)核治療，其中六個(gè)，我們檢測(cè)陽性后，直接鏡檢評(píng)估。13 痰液樣品（沒有增長(zhǎng)的培養(yǎng)，但 GTMD 為陽性）其他兩個(gè) AFB 陰性，采樣時(shí)間取在沒有收到抗結(jié)核治療的

15、患者，與不同的肺部疾病診斷。然而，沒有關(guān)于這兩例患者的結(jié)核感染病史。當(dāng)與培養(yǎng)相比，敏感性，特異性，PPV 和 NPV 的 GTMD 法分別為 97，58，86 和 90％。當(dāng)培養(yǎng)結(jié)果和臨床表現(xiàn)的患者進(jìn)行了評(píng)估（真陽性標(biāo)本）（佛朗哥·阿爾瓦雷斯月神等人，2006 ; Piersimoni 等，2002），其敏感性，特異性，PPV 和 NPV GTMD 試驗(yàn)分別為 97，90，97 和 90％。我們注意到接受抗結(jié)核治療和那些沒有接

16、受抗結(jié)核治療的結(jié)核病患者之間的差異。115 個(gè)樣本中 88 個(gè)不接受結(jié)核病治療的患者（表 2）GTMD 的敏感性，特異性，陽性預(yù)測(cè)值和陰性預(yù)測(cè)值的沒有抗結(jié)核治療的患者接受測(cè)試確定分別為 97，89，97 和 89％。超過 2 個(gè)月的抗結(jié)核治療的患者在獲得的 27 個(gè)樣品的結(jié)果總結(jié)在表 3 。在這些患者中，GTMB 法其敏感性，特異性，PPV 和 NPV 為 100，15，56 和 100％。當(dāng)培養(yǎng)結(jié)果和臨床癥狀的患者進(jìn)行了評(píng)估（真陽性標(biāo)