長鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性研究.pdf

1、本研究包括三部分，第一部分以龍風鯉(♂)×錦鯉(♀)、龍鳳鯉(♂)×龍鳳鯉(♀)為親本，得到兩組子代龍鳳鯉(93尾)，測量這兩組子代龍鳳鯉的10個主要形態(tài)性狀和20個框架結(jié)構(gòu)參數(shù)，研究親本對子代形態(tài)的影響：第二部分以長鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉共76尾個體為研究素材，從鯉魚微衛(wèi)星引物中篩選20對引物，利用微衛(wèi)星分子標記方法，分析基因組DNA在20個微衛(wèi)星位點上的遺傳差異；第三部分以長鰭鯉8尾、錦鯉8尾和龍風鯉個體10尾為研究對象，利用線粒體DN

2、A D-loop區(qū)分子標記方法，研究這3種鯉魚在線粒體DNA非編碼區(qū)的遺傳差異和親緣關(guān)系，主要研究結(jié)果如下： 1、兩組子代30個形態(tài)指標通過均值t檢驗、主成分分析、判別分析和差異系數(shù)檢驗方法分析得到，兩組子代只在體厚/體寬、胸鰭基起點至頭部背側(cè)末端BC/體長、背鰭基起點至臀鰭基起點EF/體長和背鰭基起點至臀鰭基末端EH/體長四個指標具有顯著差異(P<0.05)，其余指標均沒有顯著差異；主成分分析得到9個主成分，累積貢獻率為81.

3、11％，主成分分析圖顯示彼此之間沒有明顯的偏離態(tài)勢；判別分析得到以體厚/體長、吻長/體長、眼間距/體長、胸鰭基起點至腹鰭基起點BD/體長、胸鰭基起點至頭部背側(cè)末端BC/體長和腹鰭基起點至頭部背側(cè)末端DC/體長6個指標為分析因子的判別方程，兩組子代的判別準確率為78.5％；差異系數(shù)檢驗發(fā)現(xiàn)30個形態(tài)指標的差異系數(shù)值均小于1.28，沒有達到劃分亞種的標準。從總體判斷，由龍風鯉(♂)×龍鳳鯉(♀)的子代和由龍鳳鯉(♂)×錦鯉(♀)的子代在形態(tài)

4、上具有高度的相似性。 2、使用20對微衛(wèi)星引物對長鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性進行研究，發(fā)現(xiàn)3個群體在20個位點上分別檢測到108、164、154個等位基因，有效等位基因數(shù)分別為4.496、5,695和5.506，遺傳多樣性分別為0.764、0.803和0.799，期望雜合度分別為0.769、0.806和0.801，多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.703、0.761和0.757，總體遺傳多樣性水平較高，其中錦鯉的遺傳多樣性最高

5、，龍鳳鯉次之，長鰭鯉最低。Hardy-Weinberg平衡檢驗發(fā)現(xiàn)，3個群體共有26個基因座表現(xiàn)為極顯著的遺傳不平衡(P<0.01)，偏離指數(shù)分析顯示：3個群體在20個微衛(wèi)星位點上大部分處于雜合子過剩狀態(tài)。平均遺傳分化系數(shù)為7.1％，基因流Nm的平均值為3.5895，3個群體間基因流動性較大。 3、對長鰭鯉、錦鯉和龍風鯉的線粒體DNA D-loop區(qū)序列進行遺傳結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系分析，得到長度為386 bp的分析片段，該片段富含A+

6、T，G+C含量較少，共發(fā)現(xiàn)17個變異位點，約占分析總位點的4.66％，其中單一多態(tài)位點7個，簡約信息位點10個，觀測到一個堿基缺失及174 bp處的A堿基插入。共發(fā)現(xiàn)10種單倍型，其中2種單倍型為群體共享，其他均為各群體所特有，群體平均單倍型變異為0.708±0.095，3個群體的平均核苷酸變異和核苷酸多態(tài)性分別為3.966和0.0103，遺傳聚類分析顯示，龍鳳鯉和錦鯉遺傳距離近，而與長鰭鯉的遺傳距離較遠，說明在3個群體中龍鳳鯉在很多遺