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文檔簡介
1、<p><b> PBS緩沖液的配方</b></p><p> 發(fā)布日期:2008-11-11 熱門指數(shù):865 </p><p> PBS是最普遍不過的實驗室緩沖液,但其配方各異。以下是我的總結(jié): </p><p><b> 母液的配制: </b></p><p> 0.2M
2、 Na2HPO4:稱取 71.6g Na2HPO4-12H2O,溶于 1000ml 水</p><p> 0.2M NaH2PO4:稱取 31.2g NaH2PO4-2H2O,溶于1000ml 水</p><p> 各種濃度PB(pH=7.4)的配制:</p><p> 先配 0.2M PB (pH=7.4,100ml):取19ml 0.2mol/L的 NaH
3、2PO4, 81ml 0.2mol/L 的 Na2HPO4, 即可。</p><p> 然后 只需將0.2M PB (pH=7.4)按相應(yīng)比例適當稀釋 即可,如:</p><p> 0.1M PB(PH=7.4) :取 500ml 0.2M PB,加水稀釋至 1000ml 即可。</p><p> 0.01M PB (PH=7.4):取50ml 0.2M PB
4、,加水稀釋至 1000ml 即可。</p><p> 0.02M PB (PH=7.4):取100ml 0.2 M PB,加水稀釋至 1000ml 即可。 </p><p> 若需要 NaCL 的話,加入 NaCL 至0.9%(g/100ml)即可。 </p><p> 另:其它各種另 PH值的 0.2M PB(100ml)配方 :</p>&l
5、t;p> pH 0.2M NaH2PO4(ml) 0.2M Na2HPO4(ml)</p><p> 5.7 93.5 6.5</p><p> 5.8 92 8 &
6、lt;/p><p> 5.9 90 10</p><p> 6.0 87.7 12.3</p><p> 6.1 85 15<
7、/p><p> 6.2 81.5 18.5</p><p> 6.3 77.5 22.5</p><p> 6.4 73.5 26.5</
8、p><p> 6.5 68.5 31.5</p><p> 6.6 62.5 37.5</p><p> 6.7 56.5 43.5</p
9、><p> 6.8 51 49</p><p> 6.9 45 55</p><p> 7.0 38 62</p>&
10、lt;p> 7.1 33 67</p><p> 7.2 28 72</p><p> 7.3 23 77</p><p>
11、; 7.4 19ml 81ml</p><p> 7.5 16 84</p><p> 7.6 13 87</p><p> 7.
12、7 10.5 0.5</p><p> 7.8 8.5 91.5</p><p> 7.9 7 93</p><p> 8.0
13、 5.3 94.7 </p><p> 分子生物學常用溶液配制</p><p> 發(fā)布日期:2008-8-25 熱門指數(shù):3471 </p><p> 分子生物學常用溶液配制</p><p> 一、分子生物學常用貯存液的配制</p><p&g
14、t; 1.30%丙烯酰胺溶液</p><p> 【配制方法】將29g丙烯酰胺和1g N,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為60ml的水中。加熱至37℃溶解之,補加水至終體積為100ml。用濾器(0.45μm孔徑)過濾除菌,查證該溶液的pH值應(yīng)不大于7.0,置棕色瓶中保存于室溫。</p><p> 【注意】丙烯酰胺具有很強的神經(jīng)毒性并可以通過皮膚吸收,其作用具累積性。稱量丙烯酰胺和亞甲雙
15、丙烯酰胺時應(yīng)戴手套和面具。可認為聚丙烯酰胺無毒,但也應(yīng)謹慎操作,因為它還可能會含有少量未聚合材料。</p><p> 一些價格較低的丙烯酰胺和雙丙烯酰胺通常含有一些金屬離子,在丙烯酰胺貯存液中加入大約0.2體積的單床混合樹脂(MB-1Mallinckrodt),攪拌過夜,然后用Whatman 1號濾紙過濾以純化之。</p><p> 在貯存期間,丙烯酰胺和雙丙烯酰胺會緩慢轉(zhuǎn)化成丙烯酰和
16、雙丙烯酸。</p><p><b> 2.40%丙烯酰胺</b></p><p> 【配制方法】把380g丙烯酰胺(DNA測序級)和20g N,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為600ml的蒸餾水中。繼續(xù)按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法處理,但加熱溶解后應(yīng)以蒸餾水補足至終體積為1L。</p><p> 【注意】見上述配制30%丙烯酰胺的說
17、明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列測定。</p><p><b> 3.放線菌素D溶液</b></p><p> 【配制方法】把20mg放線菌素D溶解于4ml 100%乙醇中,1:10稀釋貯存液,用100%乙醇作空白對照讀取OD440值。放線菌素D(分子量為1255)純品在水溶液中的摩爾消化系數(shù)為21,900,故而1mg/ml的放線菌素D溶液在440nm處的吸光
18、值為0.182,放線菌素D的貯存液應(yīng)放在包有箔片的試管中,保存于-20℃。</p><p> 【注意】放線菌素D是致畸劑和致癌劑,配制該溶液時必須戴手套并在通風櫥內(nèi)操作,而不能在開放在實驗桌面上進行,謹防吸入藥粉或讓其接觸到眼睛或皮膚。</p><p> 藥廠提供的作治療用途的放線菌素D制品常含有糖或鹽等添加劑。只要通過測量貯存液在440nm波長處的光吸收確定放線菌素D的濃度,這類制品
19、便可用于抑制自身引導(dǎo)作用。</p><p> 4.0.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液</p><p> 【配制方法】在0.8ml水中溶解60mg ATP,用0.1mol/L NaOH調(diào)至pH值至7.0,用蒸餾水定容1ml,分裝成小份保存于-70℃</p><p> 5.10mol/L乙酸酰溶液</p><p> 【配制方法】把7
20、70g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后過濾除菌。</p><p> 6.10%過硫酸銨溶液</p><p> 【配制方法】把1g過硫酸銨溶解于終量為10ml的水溶液中,該溶液可在4℃保存數(shù)周。</p><p><b> 7.BCIP溶液</b></p><p> 【配制方法】把0.5g的5-溴-4-氯
21、-3-吲哚磷酸二鈉鹽(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃</p><p> 8.2×BES緩沖鹽溶液</p><p> 【配制方法】用總體積90ml的蒸餾水溶解1.07g鹽溶液BES[N,N-雙(2-羥乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4,室溫下用HCl調(diào)節(jié)該溶液的pH值至6.96、然后加入蒸餾水定容至100m
22、l,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成小份,保存于-20℃。</p><p> 9.1mol/L CaCl2溶液</p><p> 【配制方法】在200ml蒸餾水中溶解54g CaCl2?6H2O,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成10ml小份貯存于-20℃。</p><p> 【注意】制備感受態(tài)細胞時,取出一小份解凍并用蒸餾水稀釋至100ml,用Nalgen
23、e濾器(0.45μm孔徑)過濾除菌,然后驟冷至0℃。</p><p> 10.2.5mol/L CaCl2溶液</p><p> 【配制方法】在20ml蒸餾水中溶解13.5g CaCl2?6H2O,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p> 11.1mol/L二硫蘇糖醇(DTT)溶液</p><p>
24、 【配制方法】用20ml 0.01mol/L乙酸鈉溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,過濾除菌后分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p> 【注意】DTT或含有DTT的溶液不能進行高壓處理。</p><p> 12.脫氧核苷三磷酸(dNTP)溶液</p><p> 【配制方法】把每一種dNTP溶解于水至濃度各為100mmol/L左右,用微量移液
25、器吸取0.05mol/l Tris堿分別調(diào)節(jié)每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH試紙檢測),把中和后的每種dNTP溶液各取一份作適當稀釋,在下表中給出的波長下讀取光密度計算出每種dNTP的實際濃度,然后用水稀釋成終濃度為50mmol/L的dNTP,分裝成小份貯存于-70℃。</p><p> 堿基波長(nm)消化系數(shù)(ε)[L/(mol?cm)]</p><p> A2591
26、.54×104</p><p> G2531.37×104</p><p> C2719.10×103</p><p> T2607.40×103</p><p> 比色杯光徑為1cm時,吸光度=εM</p><p> 13.0.5mol/l EDTA(pH
27、8.0)溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-Na?2H2O),在磁力攪拌器上劇烈攪拌,用NaOH調(diào)節(jié)溶液的pH值至8.0(約需20g NaOH顆粒)然后定容至1L,分裝后高壓滅菌備用。</p><p> 【注意】EDTA二鈉鹽需加入NaOH將溶液的pH值調(diào)至接近8.0,才能完全溶解。</p><p>
28、; 14.溴化乙錠(10mg/ml溶液)</p><p> 【配制方法】在100ml水中加入1g溴化乙錠,磁力攪拌數(shù)小時以確保其完全溶解,然后用鋁箔包裹容器或轉(zhuǎn)移至棕色瓶中,保存于室溫。</p><p> 【注意】小心:溴化乙錠是強誘變劑并有中度毒性,使用含有這種染料的溶液時務(wù)必戴上手套,稱量染料時要戴面罩。</p><p> 15.2×HEPES
29、緩沖鹽溶液</p><p> 【配制方法】用總量為90ml的蒸餾水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO4?2H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/l NaOH調(diào)節(jié)pH值至7.05,再用蒸餾水定容至100ml。用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成5ml小份,貯存于-20℃。</p><p><b> 16.IPTG溶液</
30、b></p><p> 【配制方法】IPTG為異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量為238.3),在8ml蒸餾水中溶解2g IPTG后,用蒸餾水定容至10ml,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p> 17.1mol/L乙酸鎂溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解214.46g四水乙酸鎂,用水定容至
31、1L過濾除菌。</p><p> 18.1mol/L MgCl2溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解203.4g MgCl2?6H2O,用水定容至1L,分裝成小份并高壓滅菌備用。</p><p> 【注意】MgCl2極易潮解,應(yīng)選購小瓶(如100g)試劑,啟用新瓶后勿長期存放。</p><p> 19.β-巰基乙醇
32、(BME)溶液</p><p> 【配制方法】一般得到的是14.4mol/L溶液,應(yīng)裝在棕色瓶中保存于4℃。</p><p> 【注意】BME或含有BME的溶液不能高壓處理。</p><p><b> 20.NBT溶液</b></p><p> 【配制方法】把0.5g氯化氮藍四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰
33、胺中,保存于4℃。</p><p><b> 21.酚/氯仿溶液</b></p><p> 【配制方法】把酚和氯仿等體積混合后用0.1mol/L Tris?HCl(pH7.6)抽提幾次以平衡這混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆蓋等體積的0.01mol/l Tris?HCl(pH=7.6)液層,保存于4℃。</p><p> 【注意】酚腐蝕性很
34、強,并可引起嚴重灼傷,操作時應(yīng)戴手套及防護鏡,穿防護服。所有操作均應(yīng)在化學通風櫥中進行。與酚接觸過的部位皮膚應(yīng)用大量的水清洗,并用肥皂和水洗滌,忌用乙醇。</p><p> 22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)溶液</p><p> 【配制方法】用異丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分裝成小份貯存于-20℃。如有必要可配成濃度高達17.4mg/ml的貯
35、存液(100mmol/L)。</p><p> 【注意】PMSF嚴重損害呼吸道粘膜、眼睛及皮膚,吸入、吞進或通過皮膚吸收后有致命危險。一旦眼睛或皮膚接觸了PMSF,應(yīng)立即用大量水沖洗之。凡被PMSF污染的衣物應(yīng)予丟棄。</p><p> PMSF在水溶液中不穩(wěn)定。應(yīng)在使用前從貯存液中現(xiàn)用現(xiàn)加于裂解緩沖液中。PMSF在水溶液中的活性喪失速率隨pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃
36、。pH值為8.0時,20μmmol/l PMSF水溶液的半壽期大約為85min,這表明將PMSF溶液調(diào)節(jié)為堿性(pH>8.6)并在室溫放置數(shù)小時后,可安全地予以丟棄。</p><p> 23.磷酸鹽緩沖溶液(PBS)溶液</p><p> 【配制方法】在800ml蒸餾水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl調(diào)節(jié)溶液的
37、pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2(1034×105Pa)高壓下蒸氣滅菌20min。保存于室溫。</p><p> 24.1mol/L乙酸鉀(pH=7.5)溶液</p><p> 【配制方法】將9.82g乙酸鉀溶解于90ml純水中,用2mol/L乙酸調(diào)節(jié)pH值至7.5后加入純水定容到1L,保存于-20℃。</p><p> 25.乙酸
38、鉀溶液(用于堿裂解)</p><p> 【配制方法】在60ml 5mol/L乙酸鉀溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成鉀濃度為3mol/L而乙酸根濃度為5mol/L的溶液。</p><p> 26.3mol/L乙酸鈉(pH5.2和pH7.0)溶液</p><p> 【配制方法】在80ml水中溶解408.1g三水乙酸鈉,用冰乙酸調(diào)節(jié)pH值至5.2或
39、用稀乙酸調(diào)節(jié)pH值至7.0,加水定容到1L,分裝后高壓滅菌。</p><p> 27.5mol/L NaCl溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L,分裝后高壓滅菌。</p><p> 28.10%十二烷基硫酸鈉(SDS)溶液</p><p> 【配制方法】在900ml水中溶解100
40、g電泳級SDS,加熱至68℃助溶,加入幾滴濃鹽酸調(diào)節(jié)溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分裝備用。</p><p> 【注意】SDS的微細晶粒易擴散,因此稱量時要戴面罩,稱量完畢后要清除殘留在稱量工作區(qū)和天平上的SDS,10%SDS溶液無須滅菌。</p><p> 29.20×SSC溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解175.3
41、g NaCl和88.2g檸檬酸鈉,加入數(shù)滴10mol/l NaOH溶液調(diào)節(jié)pH值至7.0,加水定容至1L,分裝后高壓滅菌。</p><p> 30.20×SSPE溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4?H2O和7.4g EDTA,用NaOH溶液調(diào)節(jié)pH值至7.4(約需6.5ml 10ml/L NaOH),加水定
42、容至1L,分裝后高壓滅菌。</p><p> 31.100%三氯乙酸溶液</p><p> 【配制方法】在裝有500g TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。</p><p> 32.1mol/L Tris溶液</p><p> 【配制方法】在800ml水中溶解121.91g Tris堿,加入濃HCl調(diào)
43、節(jié)pH值至所需值。</p><p> pHHCl 7.4 70ml 7.6 60ml 8.0 42ml</p><p> 應(yīng)使溶液冷至室溫后方可最后調(diào)定pH值,加水定容至1L,分裝后高壓滅菌。</p><p> 【注意】如1mol/L溶液呈現(xiàn)黃色,應(yīng)予丟棄并置備質(zhì)量更好的Tris。</p><
44、;p> 盡管多種類型的電極均不能準確測量Tris溶液的pH值,但仍可向大多數(shù)廠商購得合適的電極。</p><p> Tris溶液的pH值因溫度而異,溫度每升高1℃,pH值大約降低0.03個單位。例如:0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃時的pH值分別為9.5、8.9和8.6。</p><p> 33.Tris緩沖鹽溶液(TBS)(25mmol/l Tris)<
45、/p><p> 【配制方法】在800ml蒸餾水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris堿,加入0.015g酚并用HCl調(diào)至pH值至7.4,用蒸餾水定容至1L,分裝后在151bf/in2(1.034×105Pa)高壓下蒸汽滅菌20min,于室溫保存。</p><p> 34.X-gal溶液</p><p> 【配制方法】X-gal為5-溴-4
46、-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二甲基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的貯存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,裝有X-gal溶液的試管須用鋁箔封裹以防因受光照而被破壞,并應(yīng)貯存于-20℃。X-gal溶液無須過濾除菌。</p><p><b> 二、常用抗生素溶液</b></p><p> 抗生素貯存液a工作濃度</p><p>
47、; 濃度保存條件嚴緊型質(zhì)粒松弛型質(zhì)粒</p><p> 氨芐青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml</p><p> 羧芐青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml</p><p> 氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)-20℃25μg/ml170μg/ml</p>
48、<p> 卡那霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml</p><p> 鏈霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml</p><p> 四環(huán)素b5mg/ml(溶于乙醇)-20℃10μg/ml50μg/ml</p><p> a:以乙醇為溶劑的抗生素溶液無須除菌處理。所有抗生素溶
49、液均應(yīng)放于不透光的容器保存。</p><p> b:鎂離子是四環(huán)素的拮抗劑,四環(huán)素抗性菌的篩選應(yīng)使用不含鎂鹽的培養(yǎng)基(如LB培養(yǎng)基)。</p><p> 三、常用的電泳緩沖液</p><p> 緩沖液使用液濃貯存液(每升)</p><p> Tris-乙酸(TAE)1×:0.04mol/L Tris-乙酸50
50、5;:242g Tris堿</p><p> 0.001mol/L EDTA57.1ml冰乙酸</p><p> 100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-磷酸(TPE)1×:0.09mol/L Tris-磷酸10×:10g Tris堿</p><p> 0.002mo
51、l/L EDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)</p><p> 40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-硼酸(TBE)a0.5×0.045mol/L Tris-硼酸5×:54g Tris堿</p><p> 0.001mol/L EDTA27.5硼酸</p>&l
52、t;p> 20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> 堿性緩沖液b1×:50mmol/L NaOH1×:5ml 10mol/L NaOH</p><p> 1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-甘氨酸c1×:25mmol/L
53、 Tris5×:15.1g Tris</p><p> 250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(電泳級)(pH8.3)</p><p> 0.1% SDS50ml 10% SDS(電泳級)</p><p> 實驗室常用技術(shù)參數(shù)資料(二)</p><p> 發(fā)布日期:2003-11-1 熱門指數(shù):6468 </
54、p><p><b> 二、常用緩沖液 </b></p><p> 1.分子克隆常用緩沖液</p><p><b> 2.磷酸緩沖液</b></p><p> (1)25℃下0.1mol/L磷酸鉀緩沖液的配制※</p><p> pH1mol/L K2HPO4(ml)
55、1mol/L KH2PO4(ml)</p><p> 5.88.591.5</p><p> 6.013.286.8</p><p> 6.219.280.8</p><p> 6.427.872.2</p><p> 6.638.161.9</p><p> 6
56、.849.750.3</p><p> 7.061.538.5</p><p> 7.271.728.3</p><p> 7.480.219.8</p><p> 7.686.613.4</p><p> 7.890.89.2</p><p> 8.094
57、.06.2</p><p> (2)25℃下0.1mol/L磷酸鈉緩沖液的配制※</p><p> pH1mol/L Na2HPO4(ml)1mol/L NaH2PO4(ml)</p><p> 5.87.992.1</p><p> 6.012.088.0</p><p> 6.217.8
58、82.2</p><p> 6.425.574.5</p><p> 6.635.264.8</p><p> 6.846.353.7</p><p> 7.057.742.3</p><p> 7.268.431.6</p><p> 7.477.422.6
59、</p><p> 7.684.515.5</p><p> 7.889.610.4</p><p> 8.093.26.8</p><p> ※:用蒸餾水將混合的兩種1mol/L貯存液稀釋至1000ml,根據(jù)Henderson-Hasselbalch方程計算其pH值:</p><p> pH=p
60、K’+1g([質(zhì)子受體]/[質(zhì)子供體])</p><p> 在此,pK’=6.86(25℃)。</p><p><b> 3.電泳緩沖液</b></p><p><b> 測序凝膠加樣緩沖液</b></p><p><b> 98%去離子甲酰胺</b></p>
61、;<p> 10mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> 0.025%二甲苯青FF</p><p><b> 0.025%溴酚藍</b></p><p> 甲酰胺:許多批號的試劑級甲酰胺,其純度符合使用要求,無須再進行處理。不過,一旦略呈黃色,則應(yīng)用在磁力攪拌器上將甲酰胺與Dowex XG8混合床樹脂共同攪拌1
62、小時進行去離子處理,并用Whatman 1號濾紙過濾2次,去離子甲酰胺分裝成小份,充氮存于-70℃。</p><p><b> 常用的電泳緩沖液</b></p><p> 緩沖液使用液濃貯存液(每升)</p><p> Tris-乙酸(TAE)1×:0.04mol/L Tris-乙酸50×:242g Tris堿
63、</p><p> 0.001mol/L EDTA57.1ml冰乙酸</p><p> 100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-磷酸(TPE)1×:0.09mol/L Tris-磷酸10×:10g Tris堿</p><p> 0.002mol/L EDTA15.5
64、ml85%磷酸(1.679g/ml)</p><p> 40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-硼酸(TBE)a0.5×0.045mol/L Tris-硼酸5×:54g Tris堿</p><p> 0.001mol/L EDTA27.5硼酸</p><p> 20ml
65、 0.5mol/L EDTA(pH8.0)</p><p> 堿性緩沖液b1×:50mmol/L NaOH1×:5ml 10mol/L NaOH</p><p> 1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)</p><p> Tris-甘氨酸c1×:25mmol/L Tris5×
66、:15.1g Tris</p><p> 250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(電泳級)(pH8.3)</p><p> 0.1% SDS50ml 10% SDS(電泳級)</p><p><b> 說明:</b></p><p> ①TBE溶液長時間存放后會形成沉淀物,為避免這一問題,可在室溫下用玻璃瓶
67、保存5×溶液,出現(xiàn)沉淀后則予以廢棄。</p><p> 以片都以1×TBE作為使用液(即1:5稀釋濃貯液)進行瓊脂糖凝膠電泳。但0.5×的使用液已具備足夠的緩沖容量。目前幾乎所有的瓊脂糖膠電泳都以1:10稀釋的貯存液作為使用液。</p><p> 進行聚丙烯酰胺凝膠垂直槽的緩沖液槽較小, 故通過緩沖液的電流量通常較大,需要使用1×TBE以提供足夠
68、的緩沖容量。</p><p> ?、趬A性電泳緩沖液應(yīng)現(xiàn)用現(xiàn)配。</p><p> ?、跿ris-甘氨酸緩沖液用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳。</p><p> 2×SDS凝膠加樣緩沖液:</p><p> 100mmol/L Tris?HCl(6.8)</p><p> 200mmol/L二硫蘇糖醇(DTT
69、)</p><p> 4%SDS(電泳級)</p><p><b> 0.2%溴酚藍</b></p><p><b> 20%甘油</b></p><p> 不含DTT的2×SDS凝膠加樣緩沖液可保存于室溫,應(yīng)在臨用前取1mol/L貯存液現(xiàn)加于上述緩沖液中。</p>
70、<p><b> 4.凝膠加樣緩沖液</b></p><p> 緩沖液類型6×緩沖液貯存溫度</p><p> ?、?.25%溴酚藍</p><p><b> 4℃</b></p><p> 0.25%二甲苯青FF</p><p> 4
71、0%(W/V)蔗糖水溶液</p><p> ?、?.25溴酚藍</p><p><b> 室溫</b></p><p> 0.25%二甲苯青FF</p><p> 15%聚蔗糖(Ficoll400)</p><p> ?、?.25%溴酚藍</p><p>
72、;<b> 4℃</b></p><p> 0.25%二甲苯青FF</p><p><b> 30%甘油水溶液</b></p><p> Ⅳ0.25%溴酚藍</p><p><b> 4℃</b></p><p> 40%(W/V)蔗
73、糖水溶液</p><p> 堿性加樣緩沖液: </p><p> 300mmol/L NaOH</p><p> 6mmol/L EDTA</p><p> ?、?8%聚蔗糖(Ficoll400)</p><p><b> 4℃</b></p><p>
74、 0.15%溴甲酚綠</p><p> 0.25%二甲苯青FF</p><p> 使用以上凝膠加樣緩沖液的目的有三:增大樣品密度;以確保DNA均勻進入樣品孔內(nèi);使樣品呈現(xiàn)顏色,從而使加樣操作更為便利,含有在電塊中能以可預(yù)知速率向陽極泳動的染料。溴酚藍在瓊脂糖中移動的速率約為二甲苯青FF的2.2倍,而與瓊脂糖濃度無關(guān)。以0.5×TBF作電泳液時,溴酚藍在瓊脂糖中的泳動速率
75、約與長300bp的雙鏈線狀DNA相同,而二甲苯青FF的泳動則與長4kb的雙鏈線狀DNA相同。在瓊脂糖濃度為0.5%~1.4%的范圍內(nèi),這些對應(yīng)關(guān)系受凝膠濃度變化的影響并不顯著。</p><p> 選用哪一種加樣染料純屬個人喜惡。但是,對于堿性凝膠應(yīng)當使用溴甲酚綠作為示蹤染料,因為在堿性pH條件下其顯色較溴酚更藍為鮮明。</p><p> 5.各種pH值的Tris緩沖液的配制</p
76、><p> 各種pH值的Tris緩沖液的配制 </p><p> 所需pH值(25℃)0.1mol/L HCl的體積</p><p><b> 7.145.7</b></p><p><b> 7.244.7</b></p><p><b> 7.34
77、3.4</b></p><p><b> 7.442.0</b></p><p><b> 7.540.3</b></p><p><b> 7.638.5</b></p><p><b> 7.736.6</b></p&
78、gt;<p><b> 7.834.5</b></p><p><b> 7.932.0</b></p><p><b> 8.029.2</b></p><p><b> 8.126.2</b></p><p><b&
79、gt; 8.222.9</b></p><p><b> 8.319.9</b></p><p><b> 8.417.2</b></p><p><b> 8.514.7</b></p><p><b> 8.612.4</b&
80、gt;</p><p><b> 8.710.3</b></p><p><b> 8.88.5</b></p><p><b> 8.97.0</b></p><p> 某一特定pH值的0.05mol/L Tris緩沖液的配制:將50ml 0.1mol/L Tr
81、is堿溶液與上表所示相應(yīng)體積(單位:ml)的0.1ml/L HCl混合,加水將體積調(diào)至100ml</p><p> ?。?)溫度對50mmol/L Tris?HCl液pH值的影響</p><p> 4℃25℃37℃</p><p> 8.17.57.2</p><p> 8.27.67.3</p><p&
82、gt; 8.37.77.4</p><p> 8.47.87.5</p><p> 8.57.97.6</p><p> 8.68.07.7</p><p> 8.78.17.8</p><p> 8.88.27.9</p><p> 8.98.38.0
83、</p><p> 9.08.48.1</p><p> 9.18.58.2</p><p> 9.28.68.3</p><p> 9.38.78.4</p><p> 9.48.88.5</p><p> (6)常用緩沖液的pKa值</p>&l
84、t;p> 緩沖液分子量pKa值緩沖范圍</p><p> Trisa12.18.087.1~7.9</p><p> HEPESb283.37.477.2~8.2</p><p> MPOSc209.37.156.6~7.8</p><p> PIPESd304.36.766.2~7.3</
85、p><p> MESe195.26.095.4~6.8</p><p> a:三羥甲基氨基甲烷;b:N-2-羥乙基哌嗪-N’-2-乙磷酸;c:3-(N-嗎啉代)丙磺酸;d:N,N’-雙(2-乙磺酸)哌嗪;e:2-(N-嗎啉代)乙磺酸。</p><p> 7.溫度對常用緩沖液pH的影響</p><p> 緩沖體系pKa(20℃)△
86、pKa/10℃</p><p> Mes6.15-0.110</p><p> Ada6.60-0.110</p><p> PiPes6.80-0.085</p><p> Aces6.90-0.200</p><p> Bes7.15-0.160</p><p>
87、; Mops7.20-0.013</p><p> Tes7.50-0.200</p><p> Hepes7.55-0.014</p><p> Tricine8.15-0.210</p><p> Tris8.30-0.310</p><p> Bicine8.35-0.180&
88、lt;/p><p> Glycylglycine8.40-0.280</p><p><b> 三、常用酶的配制</b></p><p><b> 1.溶菌酶</b></p><p> 用水配制成50mg/ml的溶菌酶溶液,分裝成小份并保存于-20℃。每一小份一經(jīng)使用后便予丟棄。</p
89、><p><b> 2.蛋白水解酶類</b></p><p> 貯存液貯存溫度反應(yīng)濃度反應(yīng)緩沖液溫度預(yù)處理</p><p> 0.01mol/L Tris(pH7.8) </p><p> 鏈霉蛋白酶a20mg/ml-20℃(溶于水)1mg/ml0.01mol/L EDTA37℃自消化b<
90、;/p><p> 0.5% SDS </p><p> 0.01mol/L Tris(pH7.8) </p><p> 蛋白酶Kc20mg/ml-20℃(溶于水)50μg/ml0.005mol/L EDTA37~56℃無須預(yù)處理</p><p> 0.5% SDS </p><p> a:鏈霉蛋
91、白酶是從鏈球菌(Streptomyces griseus)中分離到的一種絲氨酸酶和酸性蛋白酶的混合物。</p><p> b:自消化可消除DNA酶和RNA酶的污染,經(jīng)自消化的鏈酶蛋白酶的配制方法如下:把該酶的粉末溶解于10mmol./l Tris?HCl(pH7.5)、10mmol/l NaCl中,配成20mg/ml濃度,于37℃溫育1h。經(jīng)消化的鏈霉蛋白酶分裝成小份放在密封試管中,保存-20℃。</p&
92、gt;<p> c:蛋白酶K是一種枯草蛋白酶類的高活性蛋白酶,從林伯氏白色念球菌(Tritirachium album Limber)中純化得到。該酶有兩個Ca2+結(jié)合位點,它們離酶的活性中心有一定距離,與催化機理并無直接關(guān)系。然而,如果從該酶中除去Ca2+,由于出現(xiàn)遠程的結(jié)構(gòu)變化,催化活性將喪失80%左右,但其剩余活性通常已足以降解在一般情況下污染酸制品的蛋白質(zhì)。所以,蛋白酶K消化過程中通常加入EDTA(以抑制依賴于M
93、g2+的核酸酶的作用)。但是,如果要消化對蛋白酶K具有較強耐性的蛋白,如角蛋白一類,則可能需要使用含有1mmol/l Ca2+而不含EDTA的緩沖液。在消化完畢后、純化核酸前要加入EGT(pH8.0)至終濃度為2mmol/L,以鰲合Ca2+。</p><p> 3.無DNA酶的RNA酶</p><p> 將胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/l Tris?HCl(pH7.5)、1
94、5mmol/l NaCl中,配成10mg/ml的濃度,于100℃加熱15min,緩慢冷卻至室溫,分裝成小份保存于-20℃。</p><p><b> 四、常用抗生素溶液</b></p><p> 抗生素貯存液a工作濃度</p><p> 濃度保存條件嚴緊型質(zhì)粒松弛型質(zhì)粒</p><p> 氨芐青霉素5
95、0mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml</p><p> 羧芐青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml</p><p> 氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)-20℃25μg/ml170μg/ml</p><p> 卡那霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml<
96、;/p><p> 鏈霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml</p><p> 四環(huán)素b5mg/ml(溶于乙醇)-20℃10μg/ml50μg/ml</p><p> a:以水為溶劑的抗生素貯存液通過0.22μm濾器過濾除菌。以乙醇為溶劑的抗生素溶液無須除菌處理。所有抗生素溶液均應(yīng)放于不透光的容器保存。</p>
97、<p> b:鎂離子是四環(huán)素的拮抗劑,四環(huán)素抗性菌的篩選應(yīng)使用不含鎂鹽的培養(yǎng)基(如LB培養(yǎng)基)。</p><p> 五、常用貯存液的配制</p><p> 1.30%丙烯酰胺溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 將29g丙烯酰胺和1g N,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總
98、體積為60ml的水中。加熱至37℃溶解之,補加水至終體積為100ml。用Nalgene濾器(0.45μm孔徑)過濾除菌,查證該溶液的pH值應(yīng)不大于7.0,置棕色瓶中保存于室溫。</p><p><b> 【注意】</b></p><p> 丙烯酰胺具有很強的神經(jīng)毒性并可以通過皮膚吸收,其作用具累積性。稱量丙烯酰胺和亞甲雙丙烯酰胺時應(yīng)戴手套和面具。可認為聚丙烯酰胺無
99、毒,但也應(yīng)謹慎操作,因為它還可能會含有少量未聚合材料。</p><p> 一些價格較低的丙烯酰胺和雙丙烯酰胺通常含有一些金屬離子,在丙烯酰胺貯存液中加入大約0.2體積的單床混合樹脂(MB-1Mallinckrodt),攪拌過夜,然后用Whatman 1號濾紙過濾以純化之。</p><p> 在貯存期間,丙烯酰胺和雙丙烯酰胺會緩慢轉(zhuǎn)化成丙烯酰和雙丙烯酸。</p><p
100、><b> 2.40%丙烯酰胺</b></p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把380g丙烯酰胺(DNA測序級)和20g N,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為600ml的蒸餾水中。繼續(xù)按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法處理,但加熱溶解后應(yīng)以蒸餾水補足至終體積為1L。</p><p>
101、<b> 【注意】</b></p><p> 見上述配制30%丙烯酰胺的說明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列測定。</p><p><b> 3.放線菌素D溶液</b></p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把20mg放線菌素D溶解于4m
102、l 100%乙醇中,1:10稀釋貯存液,用100%乙醇作空白對照讀取OD440值。放線菌素D(分子量為1255)純品在水溶液中的摩爾消化系數(shù)為21,900,故而1mg/ml的放線菌素D溶液在440nm處的吸光值為0.182,放線菌素D的貯存液應(yīng)放在包有箔片的試管中,保存于-20℃。</p><p><b> 【注意】</b></p><p> 放線菌素D是致畸劑和
103、致癌劑,配制該溶液時必須戴手套并在通風櫥內(nèi)操作,而不能在開放在實驗桌面上進行,謹防吸入藥粉或讓其接觸到眼睛或皮膚。</p><p> 藥廠提供的作治療用途的放線菌素D制品常含有糖或鹽等添加劑。只要通過測量貯存液在440nm波長處的光吸收確定放線菌素D的濃度,這類制品便可用于抑制自身引導(dǎo)作用。</p><p> 4.0.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液</p><
104、p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在0.8ml水中溶解60mg ATP,用0.1mol/L NaOH調(diào)至pH值至7.0,用蒸餾水定容1ml,分裝成小份保存于-70℃</p><p> 5.10mol/L乙酸酰溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><
105、;p> 把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后過濾除菌。</p><p> 6.10%過硫酸銨溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把1g過硫酸銨溶解于終量為10ml的水溶液中,該溶液可在4℃保存數(shù)周。</p><p><b> 7.BCIP溶液
106、</b></p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二鈉鹽(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃</p><p> 8.2×BES緩沖鹽溶液</p><p><b> 【配制方法】</b
107、></p><p> 用總體積90ml的蒸餾水溶解1.07g鹽溶液BES[N,N-雙(2-羥乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4,室溫下用HCl調(diào)節(jié) 該溶液的pH值至6.96、然后加入蒸餾水定容至100ml,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成小份,保存于-20℃。</p><p> 9.1mol/L CaCl2溶液</p>&l
108、t;p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在200ml蒸餾水中溶解54g CaCl2?6H2O,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成10ml小份貯存于-20℃。</p><p><b> 【注意】</b></p><p> 制備感受態(tài)細胞時,取出一小份解凍并用蒸餾水稀釋至100ml,用Nalge
109、ne濾器(0.45μm孔徑)過濾除菌,然后驟冷至0℃。</p><p> 10.2.5mol/L CaCl2溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在20ml蒸餾水中溶解13.5g CaCl2?6H2O,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p>
110、 11.1mol/L二硫蘇糖醇(DTT)溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 用20ml 0.01mol/L乙酸鈉溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,過濾除菌后分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p><b> 【注意】</b></p><p>
111、 DTT或含有DTT的溶液不能進行高壓處理。</p><p> 12.脫氧核苷三磷酸(dNTP)溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把每一種dNTP溶解于水至濃度各為100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/l Tris堿分別調(diào)節(jié) 每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH試紙檢測),把中和
112、后的每種dNTP溶液各取一份作適當稀釋,在下表中給出的波長下讀取光密度計算出每種dNTP的實際濃度,然后用水稀釋成終濃度為50mmol/L的dNTP,分裝成小份貯存于-70℃。</p><p> 堿基波長(nm)消化系數(shù)(ε)[L/(mol?cm)]</p><p> A2591.54×104</p><p> G2531.37×
113、;104</p><p> C2719.10×103</p><p> T2607.40×103</p><p> 比色杯光徑為1cm時,吸光度=εM</p><p> 13.0.5mol/l EDTA(pH8.0)溶液</p><p><b> 【配制方法】</b
114、></p><p> 在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-Na?2H2O),在磁力攪拌器上劇烈攪拌,用NaOH調(diào)節(jié) 溶液的pH值至8.0(約需20g NaOH顆粒)然后定容至1L,分裝后高壓滅菌備用。</p><p><b> 【注意】</b></p><p> EDTA二鈉鹽需加入NaOH將溶液的pH值
115、調(diào)至接近8.0,才能完全溶解。</p><p> 14.溴化乙錠(10mg/ml溶液)</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在100ml水中加入1g溴化乙錠,磁力攪拌數(shù)小時以確保其完全溶解,然后用鋁箔包裹容器或轉(zhuǎn)移至棕色瓶中,保存于室溫。</p><p><b> 【注意】
116、</b></p><p> 小心:溴化乙錠是強誘變劑并有中度毒性,使用含有這種染料的溶液時務(wù)必戴上手套,稱量染料時要戴面罩。</p><p> 15.2×HEPES緩沖鹽溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 用總量為90ml的蒸餾水溶解1.6g NaCl、0
117、.074g KCl、0.027g Na2PO4?2H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/l NaOH調(diào)節(jié) pH值至7.05,再用蒸餾水定容至100ml。用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成5ml小份,貯存于-20℃。</p><p><b> 16.IPTG溶液</b></p><p><b> 【配制方法】</b></
118、p><p> IPTG為異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量為238.3),在8ml蒸餾水中溶解2g IPTG后,用蒸餾水定容至10ml,用0.22μm濾器過濾除菌,分裝成1ml小份貯存于-20℃。</p><p> 17.1mol/L乙酸鎂溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在8
119、00ml水中溶解214.46g四水乙酸鎂,用水定容至1L過濾除菌。</p><p> 18.1mol/L MgCl2溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 在800ml水中溶解203.4g MgCl2?6H2O,用水定容至1L,分裝成小份并高壓滅菌備用。</p><p><b&
120、gt; 【注意】</b></p><p> MgCl2極易潮解,應(yīng)選購小瓶(如100g)試劑,啟用新瓶后勿長期存放。</p><p> 19.β-巰基乙醇(BME)溶液</p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 一般得到的是14.4mol/L溶液,應(yīng)裝在棕色瓶中保存于4℃。&
121、lt;/p><p><b> 【注意】</b></p><p> BME或含有BME的溶液不能高壓處理。</p><p><b> 20.NBT溶液</b></p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把0.5g氯化氮藍四唑溶
122、解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。</p><p><b> 21.酚/氯仿溶液</b></p><p><b> 【配制方法】</b></p><p> 把酚和氯仿等體積混合后用0.1mol/L Tris?HCl(pH7.6)抽提幾次以平衡這一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆蓋等體積的0.01mol/
123、l Tris?HCl(pH7.6)液層,保存于4℃。</p><p><b> 【注意】</b></p><p> 酚腐蝕性很強,并可引起嚴重灼傷,操作時應(yīng)戴手套及防護鏡,穿防護服。所有操作均應(yīng)在化學通風櫥中進行。與酚接觸過的部位皮膚應(yīng)用大量的水清洗,并用肥皂和水洗滌,忌用乙醇。</p><p> 22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PM
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