大鼠、水稻基因組中硒蛋白的信息學(xué)研究.pdf

1、本文依據(jù)硒代半胱氨酸插入元件（SECIS）結(jié)構(gòu)特征、利用從基因組中尋找硒蛋白的生物信息學(xué)方法對(duì)大鼠基因組進(jìn)行了搜索，并將結(jié)果與目前已知的硒蛋白基因進(jìn)行了比對(duì)，從而證實(shí)了本文工作的合理性。在此基礎(chǔ)上，對(duì)水稻基因組進(jìn)行硒蛋白生物信息學(xué)的研究。主要研究結(jié)果如下：1.獲取大鼠基因組中的硒蛋白，用SECISearch2.19軟件得到其莖環(huán)元件和對(duì)應(yīng)的序列。根據(jù)硒蛋白基因3’UTR區(qū)的保守性特征在基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì)分析，所研究的大鼠硒蛋白基因主

2、要有谷胱甘肽過(guò)氧化物酶、脫碘酶、硫氧化蛋白還原酶、硒蛋白M、硒蛋白W、硒蛋白P以及SBP2蛋白等。結(jié)果顯示在人、小鼠以及其他一些真核生物的基因組中含有與大鼠硒蛋白基因相似的序列，充分證明了硒蛋白基因的保守性。2.用SECISearch2.19程序?qū)⒌玫降乃净蚪M逐個(gè)進(jìn)行SECIS二級(jí)結(jié)構(gòu)特征的搜索，得到了符合I型和II型結(jié)構(gòu)特征的二級(jí)結(jié)構(gòu)共1176個(gè)，將得到的這些二級(jí)結(jié)構(gòu)整理分類并對(duì)應(yīng)找出了它們的一級(jí)序列和編碼區(qū)域。3.在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的一