2023年全國(guó)碩士研究生考試考研英語(yǔ)一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁(yè)
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1、隨著生物測(cè)序技術(shù)的飛速進(jìn)步,越來(lái)越多的生物數(shù)據(jù)需要處理。而傳統(tǒng)的串行算法在處理生物數(shù)據(jù)時(shí),運(yùn)行效率低,耗費(fèi)時(shí)間長(zhǎng)。為了讓處理生物數(shù)據(jù)的速度得到有效提升,本文針對(duì)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)各個(gè)部分的串行算法進(jìn)行分析。在此基礎(chǔ)上,以生物序列數(shù)據(jù)作為研究對(duì)象,挖掘串行算法在并行化改進(jìn)方面的潛力,提出了相應(yīng)的并行算法。使得處理生物數(shù)據(jù)的算法性能得到大幅度提升,為后續(xù)的生物研究奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
  首先,多序列比對(duì)階段包含多序列兩兩比對(duì)、構(gòu)建向?qū)?shù)和多序列

2、依次累進(jìn)比對(duì)三個(gè)部分。本文利用兩兩比對(duì)每次比對(duì)結(jié)果互不依賴(lài)的特性,分析不同的并行策略,將每一次的兩序列比對(duì)視為并行粒子,對(duì)串行算法作出了利于并行化的改進(jìn),提出并實(shí)現(xiàn)了基于矩陣降維的并行算法。隨后通過(guò)實(shí)驗(yàn)比較了串、并行算法的性能。
  其次,在計(jì)算距離矩陣這部分,針對(duì)矩陣上三角元素的計(jì)算無(wú)關(guān)性,本文實(shí)現(xiàn)了基于OpenMP的并行算法,為了充分利用計(jì)算機(jī)的處理器資源,本文還提出了基于OpenMP+GPU的混合并行的算法,將串行算法拆分,

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