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文檔簡介
1、上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文鯉魚(Cyprinus carpio L.)遺傳圖譜構(gòu)建及其生長相關(guān)性狀的QTL分析姓名:張研申請學(xué)位級別:博士專業(yè):水產(chǎn)養(yǎng)殖指導(dǎo)教師:孫效文20080601位點為6 7 8 個位點,偏分離的標(biāo)記為3 9 1 個,嚴(yán)重偏分離的標(biāo)記為2 2 1 個。將嚴(yán)重偏分離的標(biāo)記剔除,共4 5 7 個標(biāo)記用于圖譜構(gòu)建。2 .鯉魚遺傳圖譜構(gòu)建對基本符合孟德爾遺傳的分離標(biāo)記進(jìn)行了連鎖分析,繪制了鯉魚遺傳連鎖圖譜。鯉魚連鎖圖譜的框架
2、圖有4 5 7 個遺傳標(biāo)記組成,分布于5 0 個連鎖群,其中R A P D 標(biāo)記1 5 個,A F L P 標(biāo)記2 7 5 個,微衛(wèi)星位點1 6 6 個,連鎖群長度從9 .3 9 c M到2 0 8 .7 5c M ,每個連鎖群含2 .3 2 個標(biāo)記。圖譜長度為3 7 3 2 .5 2c M ,各連鎖群平均圖距在4 .6 5 到2 9 .1 9 c M 之間,總平均圖距為1 1 .1 9c M 。鯉魚遺傳圖譜的預(yù)期長度為4 8 0 3
3、.3 9 c M ,圖譜的覆蓋率為7 7 .7 1 %。3 .與鯉魚生長相關(guān)性狀的Q T L 定位研究利用該圖譜進(jìn)行了生長相關(guān)性狀的Q T L 定位,在鯉魚連鎖圖譜上,共定位了3 5 個關(guān)于體長、體重、體高等9 個生長相關(guān)性狀的Q T L ,單個Q T L 可解釋的表型變異為1 .1 0 %~3 4 .2 9 %。9 個性狀( 除眼徑外) 的表型相關(guān)均達(dá)到極顯著水平( p < O .0 1 ) ,P e a r s o n 相關(guān)系
4、數(shù)均超過O .6 7 。在鯉魚連鎖圖譜上,共檢測到3 個與體厚相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第1 5 ,2 2 和3 1 連鎖群上;檢測到一個與體重相關(guān)的Q T L ,定位于鯉魚連鎖圖譜的第2 4 ,2 0 和3 6 連鎖群上,單個Q T L 可解釋的表型變異從1 .6 7 %到2 0 .0 5 %,G 3 f 2 5 4 的基因效應(yīng)最大2 0 .0 5 %,為主效Q T L ,其L O D 值為7 .2 5 ,臨近的標(biāo)記
5、為G 8 f 3 3 9 ,與Q T L 之間的重組率為4 %;檢測到四個與體高性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第4 ,3 ,2 2 和2 0 連鎖群上,位于連鎖圖譜第2 3 連鎖群上的Q T L 為主效Q T L ,擁有最大的L O D ( 5 .2 8 ) ,可解釋的表型變異為2 0 .4 9 %;檢測到五個與眼間距性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第4 ,4 0 ,2 2 ,2 0 和2 8 連鎖群上
6、。檢測到四個與眼徑性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第1 ,7 ,4 0 和3 9 連鎖群上。檢測到三個與尾柄高性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第6 ,2 4 和2 8 連鎖群上,位于連鎖圖譜第2 8 連鎖群上的Q T L 為主效Q T L ,擁有最大的L o D ( 5 .4 3 ) ,可解釋的表型變異為2 2 .4 6 %,臨近的標(biāo)記為F 3 f 1 2 4 ,與Q T L 之間的重組率為O .1 %;
7、 僅檢測到二個與尾長性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第2 8 和1 3 連鎖群上,位于連鎖圖譜第2 8 連鎖群上的Q T L 為主效Q T L , 擁有最大的L O D ( 4 .4 2 ) ,可解釋的表型變異為2 4 .6 8 %,臨近的標(biāo)記為F 3 f 1 0 5 ,與Q T L 之間的重組率為1 5 .3 %; 共檢測到九個與頭長性狀相關(guān)的Q T L ,分別定位到鯉魚連鎖圖譜的第2 ,3 ,4 ,6 ,3 1 和4
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