pubmed統(tǒng)計分析系統(tǒng)

1、不一樣的PubMed---Pubmedplus,鄭友紅 北京唯博賽科技有限公司,Pubmedplus的介紹,來自于Pubmed,從Pubmed官方授權(quán)的接口獲取數(shù)據(jù)。認(rèn)可Pubmed的所有檢索模式，檢索結(jié)果和Pubmed完全一樣。彌補(bǔ)Pubmed的缺憾，展示Pubmed不能實現(xiàn)的功能。提供Pubmed站內(nèi)大數(shù)據(jù)聚類分析的功能。,Pubmedplus與Pubmed相同點,PubMed支持限定檢索，自由詞自動轉(zhuǎn)換主題詞等功能；Pu

2、bmed認(rèn)可的檢索式都可以在系統(tǒng)檢索，檢索結(jié)果也與Pubmed完全一致。讀者使用中文檢索式，由內(nèi)部詞典翻譯為英文再檢索；,一億四千萬引文與參考文獻(xiàn)，數(shù)據(jù)可以分析,彌補(bǔ)Pubmed沒有引文文獻(xiàn)的缺憾,實現(xiàn)了：使用Pubmed數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，檢索結(jié)果按文獻(xiàn)被引用次數(shù)排序。,一億四千萬引文與參考文獻(xiàn)，數(shù)據(jù)可以分析,一億四千萬引文與參考文獻(xiàn)，數(shù)據(jù)可以分析,引文的數(shù)量和來源,引文范圍：僅收集Pubmed收錄的期刊文獻(xiàn)。Pubmedplus收錄

3、了一億六千萬條引文與參考文獻(xiàn)，可以幫助讀者更好的檢索自己的課題。,,,,,中文主題詞導(dǎo)航。,,本地館藏庫與Pubmed檢索對接,實現(xiàn)了本館資源整合：讀者檢索文獻(xiàn)后，把讀者導(dǎo)向本館購買的、可以直接打開全文的鏈接。萬方，知網(wǎng)收錄的文獻(xiàn),Pubmed沒有提供鏈接;部分Springer,ACS,wiley等常規(guī)數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn)，Pubmed有遺漏鏈接；Pubmed提供了鏈接，讀者不清楚本館哪些有權(quán)限。,提供期刊鏈接，三大館,期刊導(dǎo)航，免

4、費(fèi)+權(quán)限,概念的聚類分析,Pubmed收錄了2470萬文獻(xiàn)目次，每天增加的文獻(xiàn)超過1000篇，每個課題檢索到的文獻(xiàn)結(jié)果太多，對結(jié)果進(jìn)行概念的聚類分析可以幫助讀者檢索，節(jié)約時間。對檢索結(jié)果進(jìn)行聚類分析可以幫助讀者了解研究熱點、發(fā)現(xiàn)新的課題。,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析:常用聚類,匯總的機(jī)構(gòu)作者縮

5、寫:提取作者縮寫信息。文獻(xiàn)主題詞:Mesh詞。城市:規(guī)范化的城市名稱。Substance:Pubmed自有的字段。癥狀:規(guī)范化的治療方法:規(guī)范化的分子功能:基因本體的一部分。生物過程:基因本體的一部分。基因蛋白:規(guī)范化處理的蛋白名稱。,聚類分析,作者,聚類分析,作者,聚類分析:其他聚類,機(jī)構(gòu):未規(guī)范化的機(jī)構(gòu)，用于查機(jī)構(gòu)的異名。單詞:文獻(xiàn)出現(xiàn)頻率最高的單詞。詞組:文獻(xiàn)出現(xiàn)頻率最高的詞組。物種:研究對象。解剖:文獻(xiàn)涉

6、及到的解剖位置。食品:文獻(xiàn)涉及到的食物。Chemical:藥物，未規(guī)范。Gene Ontology:基因本體，未規(guī)范。Gene Protein:基因蛋白，未規(guī)范。,共詞分析,共詞聚類分析法采用聚類的計算方法，對文章中共現(xiàn)的詞對（主題詞或關(guān)鍵詞）的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行運(yùn)算，將關(guān)系密切的詞聚集歸類，從而達(dá)到挖掘隱含信息的目的。聚類原理的分析方法具有客觀性、科學(xué)性、敏感性的特點。“主題詞與主題詞”，“主題詞與作者”，“作者與作者”,主題詞與主

7、題詞聚類：掌握領(lǐng)域內(nèi)的研究熱點,,耐藥性與腫瘤,共詞性分析,數(shù)據(jù)巨大,聚類分析,作者,三個例子：利用Pubmed完成三個目標(biāo),本機(jī)構(gòu)文獻(xiàn)的時時在線跟蹤，學(xué)科競爭力分析對比。投稿前選刊。矯正檢索式，跟蹤課題的最新研究。,聚類分析,本機(jī)構(gòu)分析，異名,聚類分析,本機(jī)構(gòu)分析，異名,一位神經(jīng)科的大夫想發(fā)表一篇IF值2-3的病例報告，發(fā)表在哪些期刊上比較合適？,舉例：,二：如何利用PubMedPlus進(jìn)行選刊,二：如何利用PubMedPlus進(jìn)

8、行選刊,思路：1.搜索近3年發(fā)表在PUBMED上的文章；2.通過過濾篩選①神經(jīng)科學(xué)；②病例報告；③IF值, 得到與課題相關(guān)的所有文獻(xiàn)；3.通過聚類分析“期刊”，找出合適期刊。4. 對期刊評估，最終選出適合的期刊,檢索2011至2013年pubmed收錄文章,影響因子2-3過濾,過濾病例報告,,,聚類分析“期刊”,,,期刊信息,,,,期刊信息,,期刊信息,,按收錄各國家文獻(xiàn)的百分比進(jìn)行分析,,,三種期刊分析對比表,某神經(jīng)內(nèi)科教授

9、想發(fā)表一篇影響因子是2-3的病例報告，選哪些期刊投稿比較合適？思路：查找最近3年、影響因子是2-3、神經(jīng)內(nèi)科的病例報告方面的期刊,查準(zhǔn)：優(yōu)先主題詞檢索并不是所有的詞都有主題詞只能檢索Medline數(shù)據(jù)（有主題詞標(biāo)引的數(shù)據(jù)）不能檢索：出版商提供的數(shù)據(jù)：[PubMed - as supplied by publisher]加工中的數(shù)據(jù)：[PubMed - in process],三、修正檢索式，輔助檢索查全,三、修正檢索式，輔

10、助檢索查全,非小細(xì)胞肺癌最后的檢索式,("carcinoma , non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "squamous cell carcinoma"[tiab] OR "non small cell