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1、113高通量測(cè)序領(lǐng)域常用名詞解釋大全高通量測(cè)序領(lǐng)域常用名詞解釋大全什么是高通量測(cè)序?什么是高通量測(cè)序?高通量測(cè)序技術(shù)(Highthroughputsequencing,HTS)是對(duì)傳統(tǒng)Sanger測(cè)序(稱(chēng)為一代測(cè)序技術(shù))革命性的改變一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸分子進(jìn)行序列測(cè)定因此在有些文獻(xiàn)中稱(chēng)其為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing,NGS)足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致
2、全貌的分析成為可能所以又被稱(chēng)為深度測(cè)序(Deepsequencing)。什么是什么是SangerSanger法測(cè)序(一代測(cè)序)法測(cè)序(一代測(cè)序)Sanger法測(cè)序利用一種DNA聚合酶來(lái)延伸結(jié)合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測(cè)定由一套四個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)構(gòu)成,每個(gè)反應(yīng)含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3OH基團(tuán),使延長(zhǎng)的
3、寡聚核苷酸選擇性地在G、A、T或C處終止。終止點(diǎn)由反應(yīng)中相應(yīng)的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對(duì)濃度可以調(diào)整,使反應(yīng)得到一組長(zhǎng)幾百至幾千堿基的鏈終止產(chǎn)物。它們具有共同的起始點(diǎn),但終止在不同的的核苷酸上,可通313測(cè)序名詞關(guān)系圖測(cè)序名詞關(guān)系圖什么是什么是fragmentsfragmentsfragments就是打成的片段,而測(cè)序測(cè)的就是這些fragments,測(cè)出來(lái)的結(jié)果就是reads,又可以分為單端側(cè)和雙端側(cè),單端測(cè)序的話
4、,只是從fragments的一端測(cè)序,測(cè)多長(zhǎng)read就多長(zhǎng),雙端測(cè)序就是從一個(gè)fragments的兩端測(cè),就會(huì)得出兩個(gè)reads什么是什么是ReadsReads高通量測(cè)序平臺(tái)產(chǎn)生的序列就稱(chēng)為reads。(測(cè)序讀到的堿基序列片段,測(cè)序的最小單位;)什么是什么是ContigContig拼接軟件基于reads之間的overlap區(qū),拼接獲得的序列稱(chēng)為Contig(重疊群重疊群)。(由reads通過(guò)對(duì)overlap區(qū)域拼接組裝成的沒(méi)有沒(méi)有g(shù)ap
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