醫(yī)學(xué)信息檢索與利用課件

1、醫(yī)學(xué)信息檢索與利用總 論,中山大學(xué)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索教研室羅淑蓮,一、學(xué)習(xí)醫(yī)學(xué)信息檢索課的目的和意義,（一） 提高信息素質(zhì)與信息檢索 （二） 科技創(chuàng)新與信息檢索,（一）信息素質(zhì)教育與信息檢索,信息素質(zhì)(Information Literacy) 人們在工作中運(yùn)用信息、學(xué)習(xí)信息技術(shù)、利用信息解決問題的能力。,,信息素質(zhì)的構(gòu)成要素： （1）信息意識(shí) （2）信息能力 信息檢索力:指熟悉各種

2、信息源，掌握信息檢索的基礎(chǔ)理論和基本技術(shù)，熟練地利用各種手工檢索工具和計(jì)算機(jī)檢索系統(tǒng)查找所需信息的能力 （3）信息道德,信息素質(zhì)能力的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),“美國高等教育中學(xué)生信息素質(zhì)能力標(biāo)準(zhǔn)”：能確定信息資源的特點(diǎn)和范圍；能有效地獲取所需信息；能評(píng)價(jià)信息及其來源，利用其知識(shí)基礎(chǔ)和價(jià)值系統(tǒng)選擇適當(dāng)?shù)男畔ⅲ荒苡行Ю盟@得的信息實(shí)現(xiàn)特定的目標(biāo)；在信息獲取和利用時(shí)自覺遵守道德規(guī)范和有關(guān)的法律。,（二）科技創(chuàng)新與信息檢索,科技信息是知識(shí)創(chuàng)

3、新的源泉： 世界上任何一項(xiàng)科研成果或創(chuàng)新都是在吸取和借鑒前人或他人研究成果的基礎(chǔ)上，再加上自己的鉆研和創(chuàng)新所獲得的?？萍夹畔⑹强蒲械南葲Q條件。,科研選題與信息檢索 科研選題就是形成、選擇和確定所要研究和解決的課題。 科研選題是科學(xué)研究的起始步驟。它關(guān)系到科學(xué)研究的方向、目標(biāo)和內(nèi)容，直接影響科研的途徑和方法，決定著科研成果的水平，價(jià)值和發(fā)展前途。,,,1、科研選題的步驟一般是： 文獻(xiàn)

4、調(diào)研和實(shí)際考察——提出選題——初步論證——評(píng)議和確定課題。 2、選題的過程是一個(gè)不斷反饋調(diào)整的過程，常常需要反復(fù)文獻(xiàn)調(diào)研和多次論證，要繼承已有的研究成果，并防止低水平重復(fù)。,,3、科研選題應(yīng)遵循的基本原則 科學(xué)性原則 創(chuàng)造性原則 需要性原則 可行性原則http://kmdxb.jzcool.com/http://www.moobeye.com/http://www.szonline.net/ysj/

5、hljdxbhttp://www.dxp24.com,,（1）科學(xué)性原則： 科研選題既要尊重所依據(jù)的科學(xué)理論和科學(xué)事實(shí)，同時(shí)還要隨著基礎(chǔ)事實(shí)和背景理論的改變而對(duì)選擇的課題進(jìn)行調(diào)整。,,（2）創(chuàng)造性原則： 概念、理論、方法、或應(yīng)用上的創(chuàng)新 創(chuàng)造性原則實(shí)質(zhì)上是要求做到：在選題時(shí)熟悉別人已經(jīng)進(jìn)行過的工作，避免重復(fù)勞動(dòng)；課題論證時(shí)恰當(dāng)估計(jì)課題的意義和可能包含創(chuàng)造性成份。,二、醫(yī)學(xué)信息檢索的基本概念,（一）

6、信息——知識(shí)——文獻(xiàn)信息： 對(duì)現(xiàn)實(shí)世界事物的反映。 在自然界、人類社會(huì)以及人類思維活動(dòng)中普遍存在，是物質(zhì)存在方式及其運(yùn)動(dòng)的規(guī)律、特點(diǎn)的外在表現(xiàn)。知識(shí)：人們通過信息對(duì)世界的認(rèn)識(shí)與掌握，是人的大腦通過思維重新組合的系統(tǒng)化信息的集合。文獻(xiàn)：記錄有知識(shí)的一切載體。,（二）信息檢索與文獻(xiàn)檢索,信息資源： 可供人類開發(fā)利用的各類信息的集合。分為非文獻(xiàn)信息資源和文獻(xiàn)信息資源兩大類。,信息檢索： 收集、組

7、織、存儲(chǔ)一定范疇的信息，并可供用戶按需要查詢信息的技術(shù)和過程。 信息組織的方法即信息加工、標(biāo)引等（主題詞、分類…….） 信息檢索可分為三類 ： 事實(shí)型信息檢索 數(shù)據(jù)型信息檢索 文獻(xiàn)型信息檢索,,文獻(xiàn)檢索： 以某些特定的文獻(xiàn)信息資源為檢索對(duì)象，以獲取文獻(xiàn)信息為目的的信息檢索。 檢索結(jié)果是切題文獻(xiàn)或相關(guān)文獻(xiàn)的文

8、獻(xiàn)線索或具體的文獻(xiàn)。 根據(jù)檢出內(nèi)容的祥略，文獻(xiàn)檢索又可以分為書目檢索和全文檢索。,（三）文獻(xiàn)信息資源的分類,1、按文獻(xiàn)的出版形式分 圖書 期刊 報(bào)紙 特種文獻(xiàn)：科技報(bào)告、會(huì)議文獻(xiàn)、專利文獻(xiàn)、學(xué)位論文、檔案資料、產(chǎn)品資料等。,期 刊,核心期刊：刊載某學(xué)科文獻(xiàn)密度大、載文率、被引用率及利用率較高，深受本學(xué)科專家和讀者關(guān)注的期刊中的精華。評(píng)價(jià)期刊的常用工具： 《醫(yī)學(xué)核

9、心期刊指南》 《中文核心期刊要目總覽》 JCR（Journal Cition Report，期刊引用報(bào)告）。,,確定核心期刊和評(píng)價(jià)期刊質(zhì)量的常用方法：載文率法和引文法。IF（影響因子）= 某年內(nèi)SCI來源刊引用該刊前二年發(fā)表論文總次數(shù) / 該刊前二年發(fā)表論文篇數(shù)II（當(dāng)年被引率）=某刊當(dāng)年發(fā)表的論文被SCI來源刊引用的次數(shù) / 該刊當(dāng)年發(fā)表論文篇數(shù),,2、按文獻(xiàn)的載體形式 印刷型文獻(xiàn)

10、 縮微型文獻(xiàn) 聲像資料 機(jī)讀型電子出版物 電子期刊,,電子期刊的定義： 指從投稿、編輯、出版、發(fā)行、訂購、閱讀乃至讀者意見反饋的全過程都是在網(wǎng)上進(jìn)行，任何階段都不需用紙的新型出版物，稱網(wǎng)絡(luò)電子期刊。電子期刊的特點(diǎn)： 信息速發(fā)性高、信息量大、信息共享性強(qiáng)、交互性強(qiáng)、可讀性強(qiáng)、易檢索、良好的信息擴(kuò)展性、內(nèi)容、形式多樣,,從網(wǎng)絡(luò)獲取電子期刊的

11、方式： 出版商、代理商、搜索引擎、其它網(wǎng)站的友好鏈接、專門收集期刊的站點(diǎn),,3、按文獻(xiàn)的內(nèi)容加工級(jí)次 一次文獻(xiàn)：原始文獻(xiàn) 二次文獻(xiàn)：對(duì)一次文獻(xiàn)進(jìn)行加工整序后衍生得到的文獻(xiàn)。主要是揭示和報(bào)道一次文獻(xiàn)，提供查找一次文獻(xiàn)的線索。 三次文獻(xiàn)：包括綜述、評(píng)論、進(jìn)展等。 零次文獻(xiàn)：未經(jīng)發(fā)表或進(jìn)入社會(huì)交流、未經(jīng)系統(tǒng)加工整理的原始文獻(xiàn)記

12、錄。,三、文獻(xiàn)信息檢索語言,文獻(xiàn)信息檢索語言： 根據(jù)文獻(xiàn)信息檢索的需要而創(chuàng)制的人工語言。 檢索語言分為描述文獻(xiàn)外表特征的語言和描述文獻(xiàn)內(nèi)容特征的檢索語言兩大類。,,描述文獻(xiàn)外表特征的檢索語言： 題名索引、著者索引、引文索引、序號(hào)索引等。描述文獻(xiàn)內(nèi)容特征的檢索語言： 分類檢索語言 主題檢索語言 代碼檢索語言：用代表事物的代

13、碼作為標(biāo)識(shí)系統(tǒng)的索引語言。（化合物分子式索引、環(huán)狀化合物環(huán)系索引、化學(xué)物質(zhì)號(hào)索引等） 。,（一）分類語言及中圖法,分類語言： 一種用分類號(hào)表達(dá)文獻(xiàn)中的各種概念，按學(xué)科、專業(yè)對(duì)各種概念加以分類和系統(tǒng)排列的文獻(xiàn)信息檢索語言。 （美國國會(huì)圖書館圖書分類法、杜威十進(jìn)分類法、國際十進(jìn)分類法、中國圖書館分類法、國際疾病分類等） 我國文獻(xiàn)分類的主要依據(jù)是《中國圖書館分類法》（簡稱《中

14、圖法》）。,《中圖法》,定義： 依一定的思想觀點(diǎn)，以學(xué)科分類為基礎(chǔ)，綜合圖書資料的內(nèi)容、特點(diǎn)，分門別類組成的分類表。 以等級(jí)制為標(biāo)記制度，依照從總——分、一般——特殊、低級(jí)——高級(jí)、簡單——復(fù)雜的邏輯次序，逐層展開各門學(xué)科知識(shí)的類目等級(jí)體系，系統(tǒng)地組織文獻(xiàn)。,,《中圖法》第四版將文獻(xiàn)知識(shí)分為5大部類，即馬、列、毛澤東思想；哲學(xué)；社會(huì)科學(xué)；自然科學(xué)；綜合性圖書。下分22個(gè)基本大類。 例如 O：數(shù)理科

15、學(xué)、化學(xué) Q：生物科學(xué) R：醫(yī)藥衛(wèi)生 每個(gè)類目采用拉丁字母和阿拉伯?dāng)?shù)字相結(jié)合的混合號(hào)碼,,R 醫(yī)藥、衛(wèi)生（17個(gè)二級(jí)類目） 1   預(yù)防醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生學(xué) 2     中國醫(yī)學(xué) 3   基礎(chǔ)醫(yī)學(xué) 4  &

16、#160;  臨床醫(yī)學(xué) 5   內(nèi)科學(xué) 6     外科學(xué) 71 婦產(chǎn)科學(xué) 72  兒科學(xué) 73 腫瘤學(xué) 74  神經(jīng)病學(xué)與精神病學(xué) 75 皮膚病學(xué)與性病學(xué) 76  耳鼻咽喉科學(xué)

17、 77 眼科學(xué) 78  口腔科學(xué) 79 外國民族醫(yī)學(xué) 8 特種醫(yī)學(xué) 9 藥學(xué),每個(gè)類目還可細(xì)分至六、七級(jí)類目，如 ： R6 外科學(xué) R65 外科學(xué)各論 R655 胸部外科學(xué) R655.1

18、胸壁 R655.2 胸膜 R656 腹部外科學(xué) R656.1 急腹癥 R656.2 腹部疝 R656.3 腹壁 R656.31 腹壁炎癥 R656.32 腹壁損傷,

19、（二）文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼,文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼與中圖法分類號(hào)不是一回事根據(jù)《中國學(xué)術(shù)期刊檢索與評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)規(guī)范》的規(guī)定，對(duì)文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼規(guī)定如下： A——理論與應(yīng)用研究學(xué)術(shù)論文（含綜述） B——實(shí)用性技術(shù)成果報(bào)告 C——業(yè)務(wù)指導(dǎo)與技術(shù)管理性文章 D——一般動(dòng)態(tài)性信息（通訊、報(bào)導(dǎo)、會(huì)議活動(dòng)、專訪等） E——文件、資料,（三）主題語言,主題檢索語言：一種采

20、用描述文獻(xiàn)主題內(nèi)容的詞語標(biāo)識(shí)并按照字順排檢文獻(xiàn)的檢索語言。主要包括主題詞和關(guān)鍵詞兩種。敘詞法：嚴(yán)格規(guī)范化、可進(jìn)行概念組配、具有完善參照系統(tǒng)、具有范疇索引等。關(guān)鍵詞法：以出現(xiàn)在文獻(xiàn)的標(biāo)題、摘要或全文中能表達(dá)文獻(xiàn)實(shí)質(zhì)內(nèi)容的詞或關(guān)鍵性專業(yè)名詞術(shù)語作為檢索標(biāo)識(shí)。,1、主題語言——主題詞,主題詞： 又稱敘詞，是以規(guī)范化的詞匯來表達(dá)文獻(xiàn)內(nèi)容的主題。 規(guī)范化也就是對(duì)文獻(xiàn)中的同義詞、近義詞、多義詞等加以規(guī)范，同一主題概念的文

21、獻(xiàn)相對(duì)集中在一個(gè)主題詞下。采用參照系統(tǒng)間接反映主題概念之間的關(guān)系,,如：“腎功能衰竭” renal failure 或 Kidney failureMESH: renal failure see Kidney failure 采用主題詞檢索，能實(shí)現(xiàn)較高的查全率和查準(zhǔn)率。,2、主題語言——關(guān)鍵詞,關(guān)鍵詞

22、： 非規(guī)范化（未經(jīng)嚴(yán)格規(guī)范化處理）檢索語言，屬于自然語言范疇。能夠及時(shí)反映文獻(xiàn)的最新信息，用法簡便。 如：Apoptosis 但對(duì)同義詞、近義詞未經(jīng)嚴(yán)格規(guī)范，因此同一主題概念的文獻(xiàn)標(biāo)引相對(duì)分散，容易導(dǎo)致漏檢和誤檢。,3、醫(yī)學(xué)主題詞詞表——MeSH,Medical Subject Headings（MeSH）美國國立醫(yī)學(xué)圖書館編制的權(quán)威性主題詞表。規(guī)范化的可擴(kuò)充的動(dòng)態(tài)性敘詞表。匯集約18,00

23、0多個(gè)醫(yī)學(xué)主題詞。,,MeSH 附有各種參照和注釋，它是對(duì)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行標(biāo)引和檢索的依據(jù)。 MeSH引入范疇表(樹形結(jié)構(gòu),Tree Structure)，將主題詞按其學(xué)科性質(zhì)、詞義范圍的上下類屬及派生關(guān)系，分別劃為15大類，其中有9類又分若干子類目，子類目下面又分若干更小的類目。18,000多個(gè)主題詞按其學(xué)科概念的性質(zhì)分別列入各自所屬的類目之下。,,GASTROIN TESTINAL NEOPLASMS胃腸腫瘤 INTEST

24、IINAL NEOPLASMS 腸腫瘤 CECAL NEOPLASMS 盲腸腫瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 闌尾腫瘤 COLONIC NEOPLASMS 結(jié)腸腫瘤 COLONIC POLYPS 結(jié)腸息肉 ... ...

25、 ... ... DUODENAL NEOPLASMS 十二指腸腫瘤 ILEAL NEOPLASMS 回腸腫瘤 ... ... ... ...,,副主題詞(Subheadings)又稱限定詞，與主題詞進(jìn)

26、行組配，對(duì)某一主題詞的概念進(jìn)行限定或復(fù)分，使主題詞具有更高的專指性。 如：診斷（Diagnosis，DI）、藥物治療（Drug Theray，DT）。MeSH有副主題詞92個(gè)在檢索中，主題詞與副主題詞的組配（主題詞/副主題詞）須有邏輯關(guān)系。 如：阿司匹林治療感冒 阿司匹林/治療應(yīng)用；感冒/藥物療法。,四、醫(yī)學(xué)信息檢索的方法、途徑,檢索途徑 常用檢索方法檢索步驟及檢索策略 檢索效果評(píng)價(jià)指標(biāo)

27、提高機(jī)檢查全率、查準(zhǔn)率的方法,1、常用的檢索途徑,（1）主題途徑（2）著者途徑（3）代碼途徑（4）題名途徑（5）分類途徑,2、常用的檢索方法,順查法 倒查法 抽查法 追溯法,3、醫(yī)學(xué)信息檢索的一般步驟,檢索準(zhǔn)備階段檢索實(shí)施階段,,檢索準(zhǔn)備階段①分析課題，明確檢索目的及要求（課題所屬的學(xué)科范圍、要求的文獻(xiàn)類型、年限、語種、需要的文獻(xiàn)量等）；②選擇檢索系統(tǒng)（包括檢索工具或數(shù)據(jù)庫）；③確定檢索方法；④選擇檢索用詞及檢索

28、途徑。檢索實(shí)施階段 包括實(shí)際檢索操作，檢索策略優(yōu)化與反饋，檢索結(jié)果的篩選和整理，獲取原始文獻(xiàn)等。,4、檢索效果評(píng)價(jià)指標(biāo),被檢出相關(guān)文獻(xiàn)量查全率：R = 相關(guān)文獻(xiàn)總量 被檢出相關(guān)文獻(xiàn)量查準(zhǔn)率：P = 被檢出文獻(xiàn)總量 未檢出相關(guān)文獻(xiàn)量漏檢率：M =

29、 相關(guān)文獻(xiàn)總量 被檢出非相關(guān)文獻(xiàn)量誤檢率：N = 被檢出文獻(xiàn)總量,,,,,,5、提高查全率、查準(zhǔn)率的方法,提高查全率的方法： 用主題詞檢索； 主題詞、關(guān)鍵詞、同義詞間用or 組配； 用上位詞（擴(kuò)展下位詞）檢索； 截詞檢索； 少用副主題詞組配。,,提高查準(zhǔn)率的方法： 用主

30、題詞檢索； 用下位詞（專指度）檢索 ； 檢索詞的字段限定 ； 副主題詞組配限制 。,五、計(jì)算機(jī)檢索基礎(chǔ),文獻(xiàn)檢索的技術(shù)手段 手工檢索：利用各種印刷型檢索工具，人工查找所需的文獻(xiàn)信息。 計(jì)算機(jī)檢索：根據(jù)信息特定的需求，利用計(jì)算機(jī)從相關(guān)數(shù)據(jù)庫中檢索所需要的文獻(xiàn)信息。 網(wǎng)絡(luò)信息檢索：通過互聯(lián)網(wǎng)上提供的網(wǎng)絡(luò)信息查詢工具，從網(wǎng)上獲取文獻(xiàn)信息。,,計(jì)算機(jī)檢索系

31、統(tǒng)包括文獻(xiàn)存儲(chǔ)和文獻(xiàn)檢索兩部分，分別對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)庫的建立和利用。計(jì)算機(jī)檢索是目前廣大醫(yī)學(xué)臨床與科研工作者獲取醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息最常用的方法和手段，具有信息量大、操作技能容易掌握、方便快捷等特點(diǎn)。,（一）數(shù)據(jù)庫基本概念,數(shù)據(jù)庫的定義： 計(jì)算機(jī)把大量的數(shù)據(jù)項(xiàng)有機(jī)地集中起來存放在數(shù)據(jù)文件中，構(gòu)成一個(gè)存放數(shù)據(jù)的整體，即數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫文件： 各項(xiàng)數(shù)據(jù)以二維表格形式存放于數(shù)據(jù)文件中，一個(gè)以二維表格形式存放在

32、磁盤上的數(shù)據(jù)文件稱為數(shù)據(jù)庫文件（庫文件）。,數(shù)據(jù)庫文件示意（字段、記錄、文檔）,記錄,字段,,,,,,記錄,（二）字段、記錄、文檔,字段： 計(jì)算機(jī)檢索的最基本單位。計(jì)算機(jī)檢索的重要字段包括篇名(Title)、作者(Author)、作者地址(Address)、刊名（Source,來源）、關(guān)鍵詞(Keyword)、主題詞(MeSH)、文摘(Abstract)等。記錄： 在一個(gè)二維表格中

33、，每一欄稱為一個(gè)字段(Field)，多個(gè)字段構(gòu)成的一條完整信息稱為一條記錄(Record)。,,文檔(File)：數(shù)據(jù)庫中一部分記錄的集合。文檔中的一條記錄就是一篇文獻(xiàn)的題錄或文摘。一個(gè)數(shù)據(jù)庫可以由一個(gè)文檔組成，也可以由多個(gè)文檔組成。,（三）計(jì)算機(jī)檢索的布爾邏輯運(yùn)算符,邏輯與　 AND A AND B，要求檢出文獻(xiàn)中同時(shí)包含概念A(yù)和概念B，其作用是縮小檢索范圍，提高查準(zhǔn)率。 邏輯或　OR A OR B，要求檢出文獻(xiàn)