分子生物學(xué)國家重點實驗室

1、,,分子生物學(xué)國家重點實驗室工 作 報 告（2001.01－2005.12）,金由辛,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所,一、研究工作與成果二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng)三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢四、發(fā)展規(guī)劃與設(shè)想,報 告 內(nèi) 容,歷史沿革,,,研究方向,一、研究工作與成果,緊密結(jié)合“人口與健康”這一國家重大需求,為防治人類重要疾病、培養(yǎng)生物新品種提供理論依據(jù)，建成一個在分子生物學(xué)領(lǐng)域從事基礎(chǔ)性研究的實驗室，躋身國際前

2、列，并為我國國民經(jīng)濟建設(shè)作出貢獻(xiàn)。,總體定位,認(rèn)識未知的世界,突出原創(chuàng)性(基礎(chǔ)性研究)建立研究系統(tǒng)和新的實驗技術(shù)(國際前列)為解決國家重大需求作貢獻(xiàn)(國家需求),一、研究工作與成果,承擔(dān)任務(wù),承擔(dān)國外研究項目,,一、研究工作與成果,研究總經(jīng)費,2001-2005年，共11618萬,科 研 經(jīng) 費： 7850萬管 理 費： 750萬依托單位投入： 2718萬設(shè) 備 更 新 費： 300萬,組

3、均經(jīng)費800余萬,,,一、研究工作與成果,2001-2005年，共發(fā)表論文220篇，其中SCI論文206篇，聯(lián)系作者/第一作者197篇。SCI論文總影響因子646。論文中有152篇被引用，總引用頻次1041次，其中他引820次。合計發(fā)表IF>4論文57篇（上屆12篇）。,論文發(fā)表情況,一、研究工作與成果,論文發(fā)表情況比較,122.6,20,646,820,199,220,59,133,一、研究工作與成果,獲獎情況,王恩多（200

4、1）劉望夷（2005）,一、研究工作與成果,上海市科技進(jìn)步獎,戚正武（ 2003 ）,戚正武（ 2005 ）,劉望夷（ 2003 ）,國家自然科學(xué)二等獎,,專 利,已申請發(fā)明專利39項已獲批準(zhǔn)授權(quán)發(fā)明專利20項（1項國際）,一、研究工作與成果,,一、研究工作與成果,代表性研究成果,基因的表達(dá)、調(diào)控與功能,人類生殖系統(tǒng)發(fā)育與疾病研究,真核生物的生殖與發(fā)育是當(dāng)今生物學(xué)研究熱點之一，生殖細(xì)胞的分化發(fā)育與形態(tài)發(fā)生在人口與健康問題的研究中占

5、有重要的地位。,主要完成人：張永蓮、陳江野、金由辛等,代表性研究成果（一）,附睪自身免疫系統(tǒng)天然抗菌肽,起始精子運動,Science March 1, 2001使21世紀(jì)追求的既能避孕，又能防止性傳播感染的雙功能藥物的出現(xiàn)成為可能,Nature Cell Biology May 1, 2004迄今為止，被發(fā)現(xiàn)的第一個附睪蛋白質(zhì)與精子作用后刺激其功能,,,,,代表性研究成果（一）,Editorial Comments:“A Con

6、dom in Pill Form?”New findings may offer a lead for developing a drug that offers both contraception and STD prevention. Chinese researchers have identified a peptide, called Bin1b, that is expressed in the male rat'

7、;s reproductive tract, and seems to have equivalents in humans and chimpanzees. The peptide is related to a group of other anti-microbial molecules called ß-defensins, and is expressed only in the sex organ called t

8、he epididymus, which may be a reservoir for sexually transmitted bacteria and viruses, including HIV. In addition to showing antimicrobial activity, Bin1b is also responsible for sperm maturation, storage, and protection

9、, suggesting that the peptide may be a useful target for drugs that would both stop sperm production and protect against STDs.,,編輯短評：藥片型的避孕套中國研究者的這一新發(fā)現(xiàn)可能提供引導(dǎo)一種既可避孕又能防止性傳播感染的雙功能藥物的出現(xiàn). . . . . .,,代表性研究成果（一）,發(fā)表在Science的文章

10、在國際上引起巨大反響，已被他引72次。在國際上掀起了附睪?-defensin自身防御機制和男性避孕的研究高潮。共發(fā)表SCI論文11篇，平均每篇的IF值8.0，他引頻次達(dá)13次。 張永蓮2001年當(dāng)選中科院院士，獲2002年度何梁何利生命科學(xué)獎和2004年度上海市科技功臣稱號。 獲得美國Fogarty基金會的連續(xù)資助。獲973一項、基金委重點兩項、863兩項、中科院重要方向性項目一項和上海市重大項目一項的支持。,成果一小結(jié),代表

11、性研究成果（一）,氨基酰-tRNA合成酶與相關(guān)tRNA的相互作用在維持正常生命活動中的功能,,主要完成人：王恩多、金由辛等,代表性研究成果（二）,代表性研究成果（二）,為闡明蛋白質(zhì)生物合成精確性的機理作出了貢獻(xiàn)，為藥物設(shè)計提供潛在的靶點。,Nucleic Acids Res, J Biol Chem, Biochem J各4篇，Biochem. 2篇,,現(xiàn)代的LeuRS可能是由雙鏈進(jìn)化而來。20氨基酸結(jié)構(gòu)模體猶如LeuRS的進(jìn)化遺跡。

12、(人的闌尾?)LeuRS獨立的CP1結(jié)構(gòu)域可與tRNA的進(jìn)化早期的小螺旋相互作用，從另一個角度證明了aaRS/tRNA共進(jìn)化。,EMBO J四位審稿人的一致好評。認(rèn)為該研究為合成酶與tRNA共進(jìn)化理論提供了依據(jù)，將影響許多研究項目的提出。,代表性研究成果（二）,發(fā)表研究論文20篇，平均影響因子5.3；已被73篇研究論文引用。 王恩多研究員2005年當(dāng)選中科院院士。獲國家自然科學(xué)獎二等獎（王恩多等，2001）獲全國優(yōu)秀博士論文（李

13、勇，2002）,成果二小結(jié),代表性研究成果（二）,染色體和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定與白血病發(fā)生的相關(guān)性,主要完成人：徐國良、周金秋等,Science 2002, 297:1824-1827,核小體,,,代表性研究成果（三）,Cell 121, 167-178, 2005,,代表性研究成果（三）,Medical Science News中對該論文作出如下評論：“這項基于小鼠骨髓細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn)為開發(fā)AML急性白血病治療新藥提供了潛在靶點”。,,第一

14、次證明表觀遺傳學(xué)方面的改變引發(fā)了白血病。發(fā)表了Cell、J Biol Chem、Biochem J 等論文， 2005年發(fā)表的Cell論文，當(dāng)年引用頻次9次。中國科學(xué)院“百人計劃”終期評估為“優(yōu)秀”，獲得100萬元后續(xù)資助。獲國外3項經(jīng)費支持，其中德國馬普學(xué)會2項，歐盟合作項目1項，合計45萬歐元。獲973兩項、國家杰青兩項、中科院百人計劃2項和上海市項目等支持。,成果三小結(jié),代表性研究成果（三）,脂類代謝的細(xì)胞和分子機制,研究

15、針對肥胖與心血管疾病。發(fā)表了Cell Death and Differ、J Biol Chem、Biochem J等論文。發(fā)表影響因子大于6的研究論文5篇。一篇發(fā)表在J Biol Chem上的論文他引達(dá)42次。廖侃進(jìn)入國家基金委創(chuàng)新群體。獲得973、863、基金委重大、中科院和上海市項目等支持。英國Future Cardiology約稿綜述。,主要完成人：廖侃、李伯良等,代表性研究成果（四）,此工作為系統(tǒng)工作，獲得2003年度

16、上海市科技進(jìn)步二等獎和2005年國家自然科學(xué)獎二等獎。獲國家基金委面上項目1項，中科院重要方向性項目1項，研究所、實驗室繼續(xù)資助經(jīng)費。,代表性研究成果（五）,核糖體失活蛋白及核糖體RNA結(jié)構(gòu)與功能,主要完成人：劉望夷等,核糖體失活蛋白（RIP）專一失活核糖體，導(dǎo)致細(xì)胞死亡。它可用作抗癌抗病毒感染藥物或殺蟲劑等，也可作為研究rRNA結(jié)構(gòu)與功能的工具酶。,代表性研究成果總結(jié),工作連續(xù)，系統(tǒng)性強成果影響力大，獲獎多在頂尖雜志上發(fā)表論文

17、創(chuàng)新文化成績卓越,科學(xué)編輯短評－藥片型的避孕套,第一次證明表觀遺傳學(xué)方面的改變引發(fā)了白血病,他引173次,證明了tRNA與合成酶的共進(jìn)化,一、研究工作與成果,一、研究工作與成果二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng)三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢四、發(fā)展規(guī)劃與設(shè)想,報 告 內(nèi) 容,隊伍建設(shè),二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),現(xiàn)有科研人員43人,隊伍建設(shè),二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),本屆期間4位當(dāng)選院士,原因：研究所、實驗室的優(yōu)良傳統(tǒng)，濃厚的 學(xué)

18、術(shù)氛圍，長期系統(tǒng)的工作與積累,隊伍建設(shè),張永蓮（2001）,張友尚（2001）,林其誰（2003）,王恩多（2005）,二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),中青年優(yōu)秀人才,本屆前后有8位杰青基金獲得者，6位百人計劃引進(jìn)人才。,二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),人才培養(yǎng),出站博士后9名獲博士學(xué)位70名在讀碩－博士生100名,二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),學(xué)生獲獎情況,全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎 2人次 李

19、勇（ 2002，導(dǎo)師王恩多）， 李鵬（ 2003，導(dǎo)師張永蓮）全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文提名獎 2人次 陳劍峰（ 2004，導(dǎo)師王恩多）， 惠利?。?2005，導(dǎo)師胡賡熙）中國科學(xué)院優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎 1人次 惠利?。?2004，導(dǎo)師胡賡熙）中國科學(xué)院院長特別獎 3人次 李鵬（ 2001，導(dǎo)師張永蓮），任秀榮（ 2001，導(dǎo)

20、師敖世洲）， 趙明煒（ 2005，導(dǎo)師王恩多）,二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng),各種冠名獎共63人次，很多老師也獲得了優(yōu)秀導(dǎo)師獎。很多畢業(yè)生在國內(nèi)外成為PI等。,報 告 內(nèi) 容,一、研究工作與成果二、隊伍建設(shè)與人才培養(yǎng)三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢四、發(fā)展規(guī)劃與設(shè)想,1998年109次香山會議上 提出了RNA組學(xué)。男性避孕與副睪抗菌肽方面引領(lǐng)了國際研究的方向。tRNA與氨酰tRNA合成酶的識別、核糖體失活蛋白的結(jié)構(gòu)

21、與功能研究、表觀遺傳學(xué)方面的研究等在國際上有很高的影響度，主辦了在國際上有重要影響的學(xué)術(shù)會議。在國際熱點、前沿領(lǐng)域（表觀遺傳學(xué)、非編碼RNA等）973項目的組織中起決定性的作用，獲得了很多國家級重大任務(wù)和國外資助。,國際學(xué)科前沿,PNAS, 2000, 97: 14035-37,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,國際機構(gòu)任職,胡賡熙Environmental Health Perspective， Reviewer,金由辛RNA Bi

22、ology，編委,,,林其誰亞大生物化學(xué)家與分子生物學(xué)家聯(lián)合會(FABMB)，主席國際細(xì)胞研究組織(ICRO)，副主席,張永蓮Androlodia (德國)，編委,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,,,國際合作與交流,,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,國際合作項目,張永蓮的Fogarty項目基金已獲延續(xù)，又獲2006年后的22.5萬USD資助。,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,,4次全球性會議,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,,19th I

23、nternational tRNA workshop “tRNA 2002”,地區(qū)性會議1次全國性會議2次其它大型學(xué)術(shù)會議3次,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,中科院－馬普青年科學(xué)家小組,徐國良（馬普三組） 周金秋（馬普四組）,胡賡熙（馬普二組）,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,國內(nèi)合作與交流,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－地位,出國訪問 112 人次，接待

24、來訪 87 人次。以通訊作者/第一作者身份發(fā)表論文：92/197,開放交流實效顯著,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,Okada, et al. Cell, 121: 167 (2005)Mao, et al. Mol Cell, 7: 801 (2001)Zheng et al. Nucleic Acids Res. 32: 3294(2004).,Li, et al. Science, 291: 1783 (2001)Zhan

25、g, et al. Cancer Res, 64: 7579 (2004) Liu, et al. Nucleic Acids Res, 29: 783 (2001),Hao, et al. Nucleic Acids Res, 33: 3606 (2005)Huo, et al. J Biol Chem, 278: 11561 (2003) Jia, et al. J Biol Chem, 279: 41960 (2004),與

26、國內(nèi)合作發(fā)表論文52篇,與所內(nèi)其它實驗室合作發(fā)表論文13篇,與國外合作發(fā)表論文27篇,以院士為核心的人才隊伍,,,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,競爭力強,,承擔(dān)國外研究項目,,,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,,,研究領(lǐng)域瞄準(zhǔn)國際前沿與熱點,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,所有課題組的工作均已延伸到細(xì)胞生物學(xué)方面,很多課題組的工作向結(jié)構(gòu)生物學(xué)和生物信息學(xué)延伸,,,,,向其它領(lǐng)域延伸,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,成果累累,國家自然科學(xué)二等

27、獎2項,全國優(yōu)秀博士論文獎2項,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,技術(shù)保障堅實,,表觀遺傳學(xué)平臺,經(jīng)典遺傳學(xué)平臺,分子生物學(xué)國家重點實驗室,RNA組學(xué)平臺,生化與細(xì)胞所,細(xì)胞研究分析中心,干細(xì)胞技術(shù)平臺,抗體研究中心,動物實驗中心,上海生科院,蛋白質(zhì)組平臺,芯片平臺,Knock out 平臺,,,,,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,生物信息學(xué)平臺,科研環(huán)境優(yōu)良,,,預(yù)計2006年9月竣工總建筑面積 2.3萬平方米,生化細(xì)胞所,上海生

28、科院,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,Isolated the old cells from culture,組長會議,聯(lián)合申請重大課題,實驗室內(nèi)部密切交流與合作,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,創(chuàng)新文化建設(shè)扎實,繼承老科學(xué)家的優(yōu)良傳統(tǒng)：耐得寂寞不趕潮流的平靜心態(tài)與勇于參加國際競爭的進(jìn)取精神，嚴(yán)謹(jǐn)踏實的學(xué)風(fēng)，幾十年如一日刻苦努力的工作作風(fēng)。競爭合作機制：有競爭又有協(xié)作幫助和人性化管理。營造濃厚學(xué)術(shù)氛圍。實事求是的科學(xué)發(fā)展觀：考核價值趨

29、向不急功近利，允許鼓勵課題組長們在單位的學(xué)科發(fā)展方向中，有自己的個性、自己的領(lǐng)域（即同中有異），形成基礎(chǔ)研究學(xué)科發(fā)展的多樣性等。,三、國內(nèi)外地位與優(yōu)勢－－優(yōu)勢,創(chuàng)新體制管理規(guī)范,開放基地 —— 接待來訪，科普網(wǎng)站、年報 —— 信息公開透明管理 —— 嚴(yán)格細(xì)致,開放課題 —— 注重實效 劉望夷 國家自然科學(xué)二等獎（2005）