培養(yǎng)與非培養(yǎng)方法對青藏高原土壤細(xì)菌多樣性的研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩83頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、本文采用傳統(tǒng)的細(xì)菌分離培養(yǎng)方法和DGGE非培養(yǎng)方法對青藏鐵路沿線23個不同地區(qū)土壤的細(xì)菌群落多樣性及群落動態(tài)變化進(jìn)行了研究。
   利用多種不同類型的培養(yǎng)基(R2A、嗜鹽、嗜堿、無氮阿須貝等),通過傳統(tǒng)的細(xì)菌分離培養(yǎng)方法從23種不同的土壤中分離篩選可培養(yǎng)細(xì)菌2249株,根據(jù)菌落菌體形態(tài)及地域特征,選擇了1043株菌進(jìn)行了16S rRNA基因序列的擴(kuò)增并序列測序,通過與GenBank已知序列進(jìn)行比對分析。結(jié)果表明,1043株細(xì)菌分

2、屬于83個類群,其中,假單孢菌屬、芽孢桿菌屬、節(jié)桿菌屬和鏈霉菌屬為最常見類群。本文章根據(jù)采樣地點土壤質(zhì)地、植被利用方式及氣候特點的不同,對各個地區(qū)的細(xì)菌數(shù)量、主要細(xì)菌類群及多樣性進(jìn)行了較為系統(tǒng)的分析。
   利用細(xì)菌通用引物,對從青藏高原23個地區(qū)土壤樣品中提取的總DNA進(jìn)行16SrRNA基因的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增,采用變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)對PCR產(chǎn)物進(jìn)行分析,以揭示青藏高原土壤中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的多樣性。DGG

3、E圖譜中的主要條帶的序列分析結(jié)果顯示,青藏高原23個土壤樣品中細(xì)菌群落大多數(shù)為非培養(yǎng)細(xì)菌(Uncultured bacterium)。DGGE圖譜分析結(jié)果顯示,青藏高原土壤細(xì)菌群落多樣性受土壤類型,植被特點及海拔高度等因素的影響。
   純培養(yǎng)方法從青藏高原鐵路周邊23種不同地區(qū)土壤中得到的細(xì)菌群落與DGGE檢測到的群落多樣性相比,發(fā)現(xiàn)利用非培養(yǎng)檢測到的群落較培養(yǎng)方法得到的明顯豐富。純培養(yǎng)得到常見菌群為假單孢菌屬、芽孢桿菌屬、節(jié)

4、桿菌屬和鏈霉菌屬。而對DGGE圖譜中的主要條帶序列分析結(jié)果顯示,非培養(yǎng)細(xì)菌(Uncultured bacterium),根瘤菌(Sinorhizobium),不動桿菌屬(Acinetobacter),黃單胞菌屬(Xanthomonas)為優(yōu)勢菌屬??梢姺桥囵B(yǎng)方法與培養(yǎng)方法結(jié)果差別較大。
   可培養(yǎng)的細(xì)菌中,編號為R43,R101,R720三株菌其16S rRNA基因序列在NCBIBlast中比對發(fā)現(xiàn)與Sphingomonas屬

5、的Sphingobium vermicomposti同源性最高為97.4-97.7%,且分離生境差異較大。以Sphingobium vermicomposti的模式菌ACCC05496=DSM21299T為參比菌株,采用多相分類的方法,對其形態(tài)學(xué)特征、生理生化特征、API鑒定系統(tǒng)、Biolog、脂肪酸成分組成分析(MIDI)、G+Cmol%測定及16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析等進(jìn)行分析。實驗結(jié)果初步證實,R43,R101,R72

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論