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1、普通野生稻(O.rufrpogon)是亞洲栽培稻(O.sativa L.)的祖先種,具有豐富的遺傳多樣性。從野生稻中發(fā)掘栽培稻已經(jīng)丟失或削弱的優(yōu)異基因,對(duì)于拓寬水稻育種中面臨的遺傳基礎(chǔ)狹窄等問題具有重要意義。野生稻總體農(nóng)藝性狀表現(xiàn)較差,并且有利基因往往與不利基因連鎖,因此在育種中難以直接應(yīng)用。水稻中高密度分子遺傳標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用為發(fā)現(xiàn)野生稻中優(yōu)異打破連等位基因、鎖累贅并進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇提供了極大的便利。
本研究選用馬來
2、西亞的普通野生稻(IRGC-105491)為供體親本,我國(guó)曾廣泛應(yīng)用的優(yōu)良親本珍汕97為輪回親本,經(jīng)雜交和多次回交并結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇初步構(gòu)建了一套96個(gè)株系組成的染色體片段重疊代換系。并利用構(gòu)建過程中衍生的兩個(gè)回交重組自交系(BC2F4和BC3F3)群體對(duì)部分農(nóng)藝性狀進(jìn)行QTL定位分析和遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建。主要結(jié)果如下:
1.染色體片段代換系:96份初級(jí)代換系目標(biāo)片段重疊覆蓋全基因組363.8Mb(約1455cM),目
3、標(biāo)片段累計(jì)總長(zhǎng)度1019.4Mb,相當(dāng)于全基因組2.8倍,最大片段長(zhǎng)28.7Mb(114.8cM),最小片段長(zhǎng)0.15Mb(0.6cM),平均長(zhǎng)度10.6 Mb(42.5cM)。
2.利用BC2F4群體構(gòu)建了遺傳連鎖圖譜,該圖譜包含152個(gè)SSR標(biāo)記,總長(zhǎng)度1342.1 cM,相鄰標(biāo)記問平均遺傳距離8.8cM,標(biāo)記順序與已發(fā)表的圖譜相比有較好的一致性。其中有19個(gè)標(biāo)記表現(xiàn)偏分離,分布在第1、2、3、5、6、8、10染色體上
4、,偏分離方向基本上都是偏向野生型和雜合型,其中在第1、6和8染色體檢測(cè)到3個(gè)偏分離區(qū)域,其峰值標(biāo)記為RM5407、RM19996和RM22825。
3.分別用復(fù)合區(qū)間作圖(CIM)和完備復(fù)合區(qū)間作圖(ICIM)對(duì)BC2F4和BC3F3群體進(jìn)行QTL定位分析??疾榱藘蓚€(gè)群體抽穗期、株高、SPAD值、每株穗數(shù)、穗長(zhǎng)和千粒重6個(gè)性狀,分別檢測(cè)到20個(gè)QTL和35個(gè)QTL,其中7個(gè)QTL在兩個(gè)群體中在相同或相鄰位點(diǎn)。同時(shí),在BC2
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