利用粳稻恢復(fù)系C堡與穞稻衍生的BIL群體定位籽粒灌漿QTL和構(gòu)建染色體片段置換系.pdf

1、中國每年水稻種植面積3067萬hm2左右，其中粳稻種植面積828hm2。雜交粳稻年種植面積僅占粳稻種植面積的3～5％，仍有很大的發(fā)展空間。雜交粳稻產(chǎn)量優(yōu)勢主要表現(xiàn)在大穗上，但大穗雜交粳稻存在兩段灌漿現(xiàn)象，導(dǎo)致部分籽粒充實度差，影響了雜交粳稻產(chǎn)量優(yōu)勢的發(fā)揮。提高籽粒充實度的關(guān)鍵在于提高籽粒的灌漿速率。穞稻是一種較原始的亞洲栽培稻粳稻類型，具有灌漿時間短、灌漿速率快的特點。充分挖掘穞稻中與灌漿速率相關(guān)的有利等位變異，并通過分子標(biāo)記輔助育種的

2、方法將其導(dǎo)入到粳稻恢復(fù)系中，有助于改善雜交粳稻F1植株部分籽粒充實度不足的缺點。本研究室前期利用穞稻與粳稻恢復(fù)系C堡雜交產(chǎn)生的BC1F1群體，通過世代平均數(shù)和主基因+多基因混合遺傳模型對籽粒灌漿進行的遺傳分析表明，該組合籽粒平均灌漿速率受2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因共同控制，以主基因遺傳為主。之后，通過一粒傳方法，將上述組合回交群體加代至BC1F5，形成了具有102個株系的堡穞堡BIL群體。本論文在上述工作的基

3、礎(chǔ)上，進行了以下兩項研究。一是在兩個生長環(huán)境下對堡穞堡(C堡/穞稻∥C堡)BIL群體各個株系6個不同灌漿期籽粒灌漿速率進行調(diào)查，結(jié)合SSR分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜，采用非條件QTL定位、與時間相關(guān)的動態(tài)QTL定位和將糙米粒重調(diào)至同一水平下的條件QTL三種定位方法，利用基于混合線性模型的QTLmapper2.0軟件和基于多元回歸模型的WinQTLCart2.5軟件對影響籽粒灌漿速率的位點進行定位。二是利用上述遺傳連鎖圖譜，通過SSR分子標(biāo)記輔

4、助選擇和連續(xù)回交+自交的方法，構(gòu)建以穞稻為供體、C堡為受體的染色體片段置換系。獲得的主要研究結(jié)果如下:
　　 1.非條件QTL定位方法中，利用QTLmapper2.0軟件和WinQTLCart2.5軟件共檢測到10個控制籽粒灌漿速率的非條件QTL，以及15個非條件QTL互作位點對。這10個非條件主效QTL分布于第1、4、5、6(2個)、8、9和10(2個)等7條染色體上。4個QTL的增效等位基因來自穞稻，其中位于第9染色體上RM

5、1328-RM3912區(qū)段內(nèi)的qGFR9.1在兩種遺傳模型中均被檢測到，表型變異解釋率分別為12.62％(混合線性模型)和38.46％(多元回歸模型)，加性效應(yīng)分別為0.10 mg/(?！ぬ?和0.14mg/(粒·天);位于第10染色體上RM1146-RM3773區(qū)段內(nèi)的qGFR10.2在兩種遺傳模型中均可檢測到，表型變異解釋率分別為7.17％(混合線性模型)和16.57％(多元回歸模型)，加性效應(yīng)分別為0.07 mg/(粒·天)和0.

6、09 mg/(粒·天)。6個QTL的增效等位基因來自C堡，它們分別是位于第1染色體上RM237-RM5389區(qū)段內(nèi)的qGFR1.1和RM8105-RM84區(qū)段內(nèi)的qGFR1.2、位于第4染色體上RM518-RM3471區(qū)段內(nèi)的qGFR4.1、位于第6染色體RM3330-RM162區(qū)段內(nèi)的qGFR6.1和RM6811-RM5753區(qū)段內(nèi)的qGFR6.2和位于第10染色體上RM3470-RM1125區(qū)段內(nèi)的qGFR10.1。
　　

7、2.與時間相關(guān)的動態(tài)QTL定位方法中，利用兩種遺傳模型共檢測到8個控制籽粒灌漿速率的QTL;以及13對互作位點對。這8個動態(tài)QTL分布于第1、2、5、6(2個)、8、9和第10染色體上。5個QTL的增效等位基因來自穞稻，其中qGFR10.2在兩種模型中均被檢測到，表型變異解釋率分別為9.35％(混合線性模型)和17.18％(多元回歸模型)，加性效應(yīng)分別為0.06 mg/(?！ぬ?和0.09 mg/(?！ぬ?。3個QTL的增效等位基因來自

8、C堡，它們分別是位于第1染色體RM5-RM5461區(qū)間的qGFR1.3、位于第2染色體RM3688-RM6617區(qū)間qGFR2.3以及位于第6染色體RM510-RM225區(qū)間的qGFR6.6。
　　 3.將粒重矯正到同一水平，利用兩種遺傳模型共檢測到13個控制籽粒灌漿速率的條件QTL以及11個位點間互作。這13個條件QTL分布于第1(2個)、4、5、6(3個)、8、9和10(2個)染色體上。8個條件QTL的增效等位基因來自穞稻，

9、其中qGFR9.1在兩種遺傳模型中檢測到，表型變異解釋率分別為12.15％(混合線性模型)和34.05％(多元回歸模型)，加性效應(yīng)分別為0.07 mg/(?！ぬ?和0.10 mg/(粒·天);qGFR10.2在兩種遺傳模型中也檢測到，表型變異解釋率分別為7.17％(混合線性模型)和16.58％(多元回歸模型)，加性效應(yīng)分別為0.07 mg/(?！ぬ?和0.09 mg/(粒·天)。5個條件QTL的增效等位基因來自C堡，它們分別是位于第1染

10、色體RM237-RM5389區(qū)段內(nèi)的qGFR1.1和RM5-RM5461區(qū)段內(nèi)的qGFR1.3、位于第4染色體RM518-RM3471區(qū)段內(nèi)的qGFR4.1、位于第8染色體RM3572-RM4085區(qū)段內(nèi)的qGFR8.1和位于笫10染色體RM3470-RM1125區(qū)段內(nèi)的qGFR10.1。
　　 4.利用回交和SSR分子標(biāo)記輔助選擇相結(jié)合的方法構(gòu)建了以C堡為遺傳背景的穞稻染色體片段置換系群體。該群體由55個置換系組成，覆蓋了96

11、.54％的穞稻基因組。其中含7個穞稻染色體片段的置換系有4個，含有6個、5個、4個、3個、2個和1個穞稻染色體片段的置換系數(shù)目分別為1個、17個、13個、11個、4個和5個。12條染色體上穞稻供體等位基因?qū)腩l率最大為18.42％，最小為0.44％，平均為4.72％。
　　 5.K111005-1、K111005-2、K111005-6、K111010-5、K111010-2、K111010-7等6個置換系攜帶的RM1328-R

12、M3912片段含有控制籽粒灌漿速率增效等位基因的雜合位點QTLqGFR9.1。K111009-1、K111009-5、K111009-10和K111011-7等4個置換系攜帶的RM1108-RM3773片段含有控制籽粒灌漿速率增效等位基因雜合位點QTLqGFR10.2。
　　 綜合上述籽粒灌漿速率QTL的定位結(jié)果，發(fā)現(xiàn)qGFR9.1和qGFR10.2是兩個控制籽粒灌漿速率的穩(wěn)定的主效QTL，在穞稻和C堡中均存在多個控制籽粒灌漿速