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文檔簡介
1、從分子水平上篩選影響鵝肥肝性狀的主效基因,并在早期選擇有較大產(chǎn)肝潛力的朗德鵝是迅速提高鵝產(chǎn)肝性能和朗德鵝產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟(jì)效益的方法之一。然而朗德鵝肥肝性狀受眾多基因和信號途徑的調(diào)控,難以確定控制鵝肥肝性狀的主效基因,因此從信號通路和基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的角度進(jìn)行分析將是揭示鵝肥肝形成的分子機(jī)制的有效途徑。
針對朗德鵝肥肝性狀的特點,文章通過圖論的方法從整體上把握肝臟脂平衡的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),然后尋找網(wǎng)絡(luò)中具有整體調(diào)節(jié)作用的信號通路,并從試驗的
2、角度分析填飼造成網(wǎng)絡(luò)中重要節(jié)點和脂代謝相關(guān)基因的表達(dá)變化。而對于圖論發(fā)現(xiàn)的調(diào)控通路也必須通過試驗的方法驗證和分析。
根據(jù)原始的研究文獻(xiàn)、綜述及分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫,將分子實體作為頂點,分子實體名稱對應(yīng)標(biāo)記分子網(wǎng)絡(luò)中的分子實體,邊對應(yīng)于分子實體間的關(guān)系,對分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)資料進(jìn)行收集,并構(gòu)建對應(yīng)的鄰接矩陣。然后將原始各個鄰接矩陣綜合為分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)綜合鄰接矩陣。
根據(jù)鄰接矩陣A,通過計算R=A+A2+A3+…+An,得到
3、可達(dá)矩陣。然后根據(jù)可達(dá)矩陣所研究分子所在的行和列的數(shù)據(jù)資料來判斷分子間的調(diào)節(jié)與被調(diào)節(jié)關(guān)系。將分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的鄰接矩陣Spath進(jìn)行k次冪來判斷肝臟脂代謝核心相關(guān)分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的分子的上游與下游信號分子間的調(diào)控關(guān)系、路徑長度及路徑數(shù)。依據(jù)綜合鄰接矩陣,通過Matlab軟件繪制了以核心基因為基礎(chǔ)的肝臟脂代謝調(diào)控圖。
填飼后朗德鵝的肝重、腹脂重、肝重指數(shù)和體重顯著增加。通過CT分析發(fā)現(xiàn)對照組肝脾比值大于1,而填飼組肝脾比值呈負(fù)數(shù),
4、與人的脂肪肝結(jié)果分析類似.在血清生化指標(biāo)方面,填飼組朗德鵝血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶、甘油三酯和H-膽固醇與對照組相比差異極顯著;膽堿脂酶顯著高于對照組。通過組織切片分析發(fā)現(xiàn):填飼處理后,朗德鵝肝臟細(xì)胞脹大,并且細(xì)胞質(zhì)內(nèi)充滿大小不等的脂泡。通過氣相色譜法測定了朗德鵝肝臟的脂肪酸組分發(fā)現(xiàn):填飼可以降低朗德鵝肝臟中飽和脂肪酸、C18:2、C20:4、PUFA、SFA/UFA的含量、PUFA/UFA和PUFA/MUFA的值;提高M(jìn)UFA、C18:1、UF
5、A的含量和MUFA/UFA的值(P<0.01)。
用熒光實時定量PCR法檢測了填飼對脂生成相關(guān)基因和相關(guān)分子mRNA表達(dá)的影響。結(jié)果顯示:與對照組相比,填飼可以顯著提高朗德鵝肝臟中ACCα、PPARα、aP2、LXRα、PPARγ、Spot14α、Spot14β、C/EBPα、C/EBPβ、GH基因mRNA的表達(dá)水平。肝臟組織中ACCα、LXRα基因的表達(dá)量與血清TG含量呈極顯著正相關(guān)。而肝臟組織中aP2、LXRα、PPA
6、Rγ基因的表達(dá)量與肝重指數(shù)呈極顯著相關(guān)(P<0.01)。填飼可以降低SREBP1c基因mRNA的表達(dá)量(P<0.05)。肝臟組織中SREBP1c基因的表達(dá)量與肝重指數(shù)呈極顯著相關(guān)(P<0.01),與血清TG成負(fù)相關(guān)(P<0.05)。
T3處理可以顯著提高體重、肝重(P<0.01),添加甜菜堿后可以逆轉(zhuǎn)這種變化。與對照組和填飼組相比,T3處理可以顯著提高血清Che, HDL和LDL的濃度,但是添加甜菜堿不能夠逆轉(zhuǎn)這種變化。T
7、3處理組空泡數(shù)量明顯減少,細(xì)胞質(zhì)內(nèi)脂滴增加,肝細(xì)胞膨脹。添加甜菜堿后,空泡數(shù)量進(jìn)一步減少,肝細(xì)胞內(nèi)脂滴比較均勻,細(xì)胞結(jié)構(gòu)的變化得到有效的逆轉(zhuǎn)。相對于填飼組,T3處理組顯著提高肝臟中不飽和脂肪酸的含量(P<0.05),并且添加甜菜堿后可以逆轉(zhuǎn)這種變化。
相對于填飼組,T3處理可以顯著提高ACCα基因的表達(dá)量,添加甜菜堿后可逆轉(zhuǎn)T3處理對ACCα基因表達(dá)量的影響。相對于填飼組,T3處理可以顯著降低PPARγ、PPARα、C/E
8、BPβ、LXRα和GH基因mRNA的表達(dá)量(P<0.01),顯著提高aP2基因mRNA的表達(dá)水平,添加甜菜堿后可逆轉(zhuǎn)T3處理對GH和aP2基因表達(dá)量的影響(P<0.05).肝臟組織中ACCα,Spot14α基因的表達(dá)量與血清TG呈極顯著相關(guān)。肝臟中SREBP1c基因mRNA表達(dá)量與肝重指數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān),與血清TG呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05)。
相對于填飼組,添加甜菜堿后肝重和肝重指數(shù)顯著增加,腹脂重降低,血清中Che,H
9、DL, ALT濃度顯著增加(P<0.01),而TG和LDL濃度沒有受到甜菜堿的影響。甜菜堿處理后,空泡數(shù)量明顯減少,脂滴沉積分布均勻,數(shù)量較多。然而添加甜菜堿對脂肪酸組分沒有影響。相對于填飼組,甜菜堿處理可降低C/EBPβ、PPARα、Spot14β、PPARγ和LXRαmRNA的表達(dá)水平(P<0,01)。而甜菜堿處理后可以顯著提高Spot14α基因mRNA的表達(dá)。
Spot14αcDNA全序列長792bp,與鴨比有87%
10、的同源性,并已提交到基因庫中,序列號為EU710582,編碼128個氨基酸,與鴨比有84%的同源性.序列中有2個CpG島,一個位于61~375區(qū),另一個位于433~645區(qū).移碼突變是由于399~400位之間插入一個C或T引起的,其可導(dǎo)致亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)的丟失,從而引起Spot14α同源二聚體的形成。
對Spot14α基因轉(zhuǎn)錄起始位點(-8+374)區(qū)域的33個CpG位點進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn):對照組該區(qū)域69.6%的位點甲基化,而經(jīng)
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