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文檔簡介
1、本研究以地方品種固始雞和快大型肉雞安卡雞按F2設(shè)計方案進行雜交得到的資源群體為實驗素材,通過.PCR-SSCP、DNA測序、PCR-RFLP技術(shù)在試驗群體中對雞△-9脂肪酸脫氫酶基因序列進行SNP位點的篩選,并研究了△-9脂肪酸脫氫酶基因的多態(tài)性與生長性狀、肉質(zhì)性狀、屠宰性狀、肌肉性狀、血液生化指標、脂肪性狀、脂肪酸含量的相關(guān)關(guān)系。
1、通過PCR-SSCP和DNA測序?qū)Α?-脂肪酸脫氫酶基因進行SNP掃描,并對出現(xiàn)不同條
2、帶個體進行測序,發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子1、外顯子2、4具有多態(tài),外顯子1、3、6無多態(tài),外顯子5引物擴增結(jié)果較差。通過測序結(jié)果表明,在△-9脂肪酸脫氫酶基因的CDS區(qū)域檢測到3個SNP,為g.C138T(內(nèi)含子1),g.A3728G(外顯子2),g.G12904A(外顯子4),均為同義突變;內(nèi)含子1出現(xiàn)三種基因型CC、CT、TT,外顯子2出現(xiàn)三種基因型.AA、AG、GG,外顯子4出現(xiàn)三種基因型GG、GA、AA。群體遺傳學(xué)表明:4個突變位點的多態(tài)信息
3、含量(PIC)均為中度多態(tài)位點(0.25-0.5)。
2、通過相關(guān)性分析,結(jié)果顯示:
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點對資源群部分生長性狀有顯著影響。其中內(nèi)含子1突變位點對第4周脛長和第12周胸角有顯著影響,外顯子4突變位點對8周盆骨寬、8周胸骨長、8周胸角有顯著影響。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點與資源群部分肉質(zhì)性狀的相關(guān)性。內(nèi)含子1突變位點對肌間脂寬、皮脂、皮脂率有顯著影響,外顯子2突變
4、位點對腿肌失水率、肌間脂寬、皮脂重、皮脂率有顯著影響,外顯子4突變位點對腿肌PH影響很大。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP何點對資源群部分肌纖維性狀有影響。內(nèi)含子1突變位點對腿肌肌纖維寬度、腿肌肌纖維周長有顯著影響。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點對資源群部分屠宰性狀有顯著影響。內(nèi)含子1突變位點對爪重率、肌胃重率有顯著影響;外顯子2突變位點對活重、屠體重、屠體重率、半凈膛率、全凈膛重、頭重、全凈膛率、肌胃重率
5、、肌胃重有顯著影響;外顯子4突變位點對半凈膛率、胸肌重、屠體重率、全凈膛率、胰腺重有顯著影響。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點對資源群部分血清生化指標有顯著影響?!?9脂肪酸脫氫酶基因內(nèi)含子1突變位點對低密度脂蛋白有顯著影響,外顯子2突變位點對肌酸磷酸激酶、乳酸脫氫酶有顯著影響,外顯子4突變位點對堿性磷酸酶、膽堿脂酶、總膽固醇、乳酸脫氫酶有顯著影響。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點對資源群部分脂肪性狀有顯
6、著影響。△-9脂肪酸脫氫酶基因內(nèi)含子1突變位點對肌間脂寬、皮脂重、皮脂率有顯著影響;△-9脂肪酸脫氫酶基因外顯子2突變位點肌間脂寬、皮脂重、皮脂率有顯著影響;外顯子4突變位點對心臟重、心臟重率有顯著影響。
△-9脂肪酸脫氫酶基因SNP位點對資源群部分脂肪酸含量有顯著影響。△-9脂肪酸脫氫酶基因內(nèi)含子1突變位點對C12:0、C14:0、C15:0、C16:0、C16:1、C18:1、C20:2、C22:6含量有顯著影響;外顯
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