2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、牦牛( Bos grunnines),屬哺乳綱( Mammalia)偶蹄目( Artiodactyla)??疲?Bovidae)牛屬( Bos),牦牛染色體核型為2n=60,基因組中共包含2,645.15 Mb堿基信息。本研究在已公布的野生牦?;蚪M測序基礎(chǔ)上做了以下實(shí)驗(yàn):對野生牦?;蚪M部分微衛(wèi)星序列特征進(jìn)行分析與統(tǒng)計;以麥洼牦牛為樣本篩選多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記;利用成功篩選的微衛(wèi)星標(biāo)記對麥洼牦?,F(xiàn)有群體遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。

2、主要研究結(jié)果如下:
  1.牦牛基因組微衛(wèi)星重復(fù)序列特征分析
  通過對野牦牛部分基因組,即251540707 bp(占全基因組的9.51%)的序列進(jìn)行微衛(wèi)星序列搜索,共找到43409個微衛(wèi)星重復(fù)序列位點(diǎn),根據(jù)結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)連續(xù)型微衛(wèi)星位點(diǎn)的數(shù)量有42063個,占到總數(shù)的96.734%,間斷型微衛(wèi)星位點(diǎn)數(shù)量(1009個)占總數(shù)的2.320%,復(fù)合型微衛(wèi)星位點(diǎn)最少(411個),僅占總數(shù)的0.945%;根據(jù)重復(fù)單元分為二堿基重復(fù)、

3、三堿基重復(fù)、四堿基重復(fù)、五堿基重復(fù)。分析發(fā)現(xiàn),在野牦?;蚪M中五堿基的總量最多,為16787個,占總量的38.59%;其次二堿基的總數(shù)量是12377個,占28.45%;三堿基的數(shù)量為9466個,占21.76%;最后是四堿基和六堿基,六堿基的含量最少,僅占總量的2.33%。緊接著又對連續(xù)型的各重復(fù)單元進(jìn)行細(xì)致分析, AC(AC/CA/TG/GT)、 AGC(TCG)、AAAT(TTTA)、ACTGA( TGACT)、TGAAAG(ACTT

4、TC)分別是在二堿基重復(fù)、三堿基重復(fù)、四堿基重復(fù)、五堿基重復(fù)、六堿基重復(fù)類型中含量最高的微衛(wèi)星重復(fù),分別占其對應(yīng)總量的60.15%、31.04%、18.36%、19.36%和11.05%。
  2.利用麥洼牦牛篩選驗(yàn)證從基因組獲得的微衛(wèi)星
  從基因組獲得的微衛(wèi)星序列中篩選出適合引物設(shè)計的序列,在其核心序列的兩側(cè)翼上設(shè)計引物,然后利用麥洼牦牛基因組 DNA為模板進(jìn)行微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測篩選具有多態(tài)性的微

5、衛(wèi)星標(biāo)記。在本研究中,共設(shè)計了470對微衛(wèi)星引物,共成功篩選了77對微衛(wèi)星引物,其中包含35個二堿基重復(fù)位點(diǎn)、15個三堿基重復(fù)位點(diǎn)、15個四堿基重復(fù)位點(diǎn)、12個五堿基重復(fù)位點(diǎn),篩選成功比率分別為46.1%、31.9%、33.3%、30%。挑選出具有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)的樣本送出測序,其結(jié)果驗(yàn)證了實(shí)驗(yàn)的正確性。
  3.麥洼牦牛微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)和群體分析
  實(shí)驗(yàn)篩選出的77對引物,分別對191個麥洼牦牛基因組 DNA樣本進(jìn)

6、行位點(diǎn)擴(kuò)增,通過使用聚丙烯酰胺凝膠實(shí)驗(yàn)或毛細(xì)管電泳實(shí)驗(yàn)對瓊脂糖效果明顯的個體進(jìn)行基因分型,得到的基因型數(shù)據(jù)通過Cervus3.0和 Genepop4.2軟件進(jìn)行位點(diǎn)多態(tài)性分析,并使用 Structure3.0軟件對麥洼牦牛群體遺傳分化特征進(jìn)行分析。二堿基、三堿基、四堿基、五堿基微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均等位基因位點(diǎn)數(shù)(N)分別為10.943、9.267、4.2、2.75個,平均觀測雜合度(Ho)分別為0.7346、0.5041、0.4191、0.

7、3830,平均期望雜合度(He)分別為0.7921、0.8152、0.5814、0.4501,平均多態(tài)位點(diǎn)含量(PIC)分別為0.7617、0.7831、0.5130、0.3652。大部分的微衛(wèi)星標(biāo)記具有高度多態(tài)性(40個, PIC>0.5),中度多態(tài)性有28個(0.25

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