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1、北京化工大學(xué)碩士學(xué)位論文介觀耗散粒子動(dòng)力學(xué)模擬程序并行化與性能優(yōu)化姓名:張猛申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)指導(dǎo)教師:趙英20110526ABSTRACTPARALLELIZATIONANDPERFoRMANCEoPTIMIZATIoNOFMESoSCALEDISSIIl氣TIVEPARTICLEDYNAMICSSIMULATIoNPRoGRAMABSTRACTDissipativeparticledynamics(DPD)isa
2、simulationmethodusedwithintherangefromatomisticscaletomesoscopicscaleThismethodiswidelyusedbecauseofitseffectivityindealingwithproblemsontheaccumulationanddispersingofmoleculesThissimulationmethodcanbeappliednotonlytosim
3、ulationsystemswithmuchmoreparticles,butalsotothestudyoflongertimemotionbehaviorofparticlesincertainsystemsHoweverthesequentialsimulationisnotabletohandleefficientythesituationthatthesimulationsystemisbecominglargerandthe
4、systemiccomplexityismcreasmgInthispapertheresearchbackgroundofmoleculesimulationandparallelcomputingisbrieflyintroducedAndacomprehensiveintroductionofthebasictheoriesandcomputingmethodofdissipativeparticledynamicsisprovi
5、dedThenaparallelalgorithmoftheserialsimulationprogrambasedonspatialdomaindecompositionisproposedThealgorithmisimplementedusingMPIandthesimulationtestsundervariousconditionsareaccomplishedonahighperformanceclusterplatform
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