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文檔簡介
1、DNA 微陣列已經(jīng)在功能基因組學(xué)研究中獲得了廣泛的應(yīng)用。在人類疾病研究領(lǐng)域,分離出在疾病狀態(tài)下特異的基因表達變化具有十分重要的研究意義和實用價值。 如何從眾多差異表達基因中分離出那些跟疾病形成與發(fā)展相關(guān)的表達變化,已經(jīng)成為疾病基因表達譜數(shù)據(jù)分析的一個關(guān)鍵問題,目前的差異分析方法還不能完全解決這個問題。 為了解決這個問題,提出了系統(tǒng)的基因表達譜差異分析方法。通過整合基因水平差異分析和功能水平差異分析,從基因、功能兩個層次上
2、研究基因表達變化與疾病表型的關(guān)聯(lián)?;蛩讲町惙治霾捎昧诵拚腡 檢驗算法來分析單個基因的表達變化,并用顯著性p值來描述變化程度;功能水平差異分析采用了組合的S 檢驗,通過整合基因的功能編目分類信息,利用單個基因差異表達的定量信息,研究一組功能相關(guān)基因的一致性表達變化。 基于上述的分析策略,開發(fā)了基因表達譜差異分析軟件MageKey(v1.0)。利用MageKey 分析一組人類肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥疾病的基因表達譜數(shù)據(jù),測試結(jié)果
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