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文檔簡(jiǎn)介
1、干旱是影響植物地域分布、阻礙其成長(zhǎng),甚至死亡的一個(gè)重要的外在因素。泡桐是我國(guó)主要的造林樹(shù)種,大規(guī)模栽植泡桐對(duì)營(yíng)造良好的生態(tài)環(huán)境、提高農(nóng)民的生活水平發(fā)揮著重大的作用。至目前,有關(guān)泡桐microRNAs(miRNAs)響應(yīng)干旱脅迫的研究鮮有報(bào)道。以轉(zhuǎn)錄組為背景研究泡桐miRNAs對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)對(duì)揭示泡桐抵抗干旱的分子機(jī)理、推廣泡桐具有重大的理論意義和應(yīng)用價(jià)值。
通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù),我們鑒定出豫雜一號(hào)泡桐中107個(gè)miRNAs,其
2、中已知的miRNAs有32個(gè),新miRNAs有75個(gè)。77個(gè)miRNAs差異顯著表達(dá)(60個(gè)下調(diào),17個(gè)上調(diào)),其中60個(gè)miRNAs差異極顯著表達(dá)(44個(gè)下調(diào),16個(gè)上調(diào))。借助降解組數(shù)據(jù),我們預(yù)測(cè)到42個(gè)靶基因。Gene Ontology分類(lèi)結(jié)果表明,這些靶基因的功能主要體現(xiàn)在細(xì)胞、細(xì)胞進(jìn)程、細(xì)胞零件、代謝過(guò)程上;Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes結(jié)果表明,這些靶基因參與了次生代謝物合成、
3、植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)、光合作用、二萜類(lèi)物質(zhì)合成、堿基切除修復(fù)、植物病原體相互作用、剪接體、mRNA監(jiān)督、嘧啶代謝、氨基糖和核苷酸糖代謝、甘/絲/蘇氨酸代謝、以及非同源末端連接等代謝通路。靶基因與Nr數(shù)據(jù)庫(kù)功能注釋的比對(duì)結(jié)果表明,其中的一些基因主要通過(guò)植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、光合作用以及滲透調(diào)節(jié)來(lái)響應(yīng)干旱脅迫。因此,我們推測(cè)部分差異表達(dá)的miRNAs可能與豫雜一號(hào)泡桐響應(yīng)干旱脅迫有關(guān)。此外,本研究隨機(jī)選擇的7個(gè)miRNAs的實(shí)時(shí)熒光定量
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