大白菜霜霉病苗期抗性主效QTL--BraDM的精細(xì)定位.pdf

1、大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)近年來逐漸成為世界性蔬菜作物。據(jù)農(nóng)業(yè)部統(tǒng)計(jì)，我國大白菜每年種植面積約267萬公頃，占全國蔬菜總播種面積的15％左右，可見大白菜對我國蔬菜供應(yīng)和農(nóng)民增收具有重要作用。然而大白菜主產(chǎn)區(qū)霜霉病發(fā)病嚴(yán)重，發(fā)病面積日益擴(kuò)大，因此大白菜霜霉病抗病品種的選育現(xiàn)已成為大白菜育種的主要目標(biāo)之一。
　　遺傳圖譜在研究基因組結(jié)構(gòu)以及對目的基因進(jìn)行定位中，具有非常重要的作用。挖掘和分離不同

2、來源的抗性QTL，并通過分子設(shè)計(jì)育種進(jìn)行高效聚合，選育穩(wěn)定、持久抗病品種，是保證大白菜安全無污染生產(chǎn)的有效途徑之一。本研究利用高感霜霉病大白菜自交系91-112和高抗霜霉病DH系T12-19，以及由二者為雙親構(gòu)建的包含100個(gè)株系的DH群體為材料，通過構(gòu)建高密度bin遺傳圖譜對大白菜霜霉病抗性進(jìn)行QTL分析，主要研究結(jié)果如下:
　　1.利用3482個(gè)SLAF標(biāo)簽和已公布的206個(gè)SSR和InDel標(biāo)記組成了1064個(gè)bins，最終

3、構(gòu)建了一個(gè)總長度為858.98 cM的高密度bin遺傳圖譜，利用該圖譜對不同發(fā)育時(shí)期的大白菜（溫室幼苗期、大田幼苗期、大田蓮座期和大田抽薹期）進(jìn)行QTL分析，共檢測到6個(gè)與霜霉病抗性相關(guān)的QTL，其中4個(gè)QTL位于A08連鎖群上。
　　Yu等(2009)利用DH群體在A08連鎖群上定位了一個(gè)大白菜苗期霜霉病抗性主效QTL，即BraD，但該QTL的置信區(qū)間還較大，還需進(jìn)一步精細(xì)定位研究。本研究在初級定位的基礎(chǔ)上，選擇了遺傳背景一致性

4、較高，而BraDM區(qū)域存在差異的兩個(gè)DH株系DH-60（高感霜霉?。┖虳H-88（高抗霜霉病），通過雜交、回交和游離小孢子培養(yǎng)構(gòu)建了DH群體，包含232個(gè)株系，利用該群體對BraDM進(jìn)行精細(xì)定位研究。主要結(jié)果如下:
　　2.根據(jù)父母本基因組重測序結(jié)果，開發(fā)出11對有效Indel標(biāo)記，在DH232群體中作圖分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)BraDM被定位在Bra17865446與bru1209之間2.6 cM的區(qū)域，物理距離為340.085kb，與抗

5、病相關(guān)的候選基因有11個(gè)。
　　為進(jìn)一步研究與大白菜苗期霜霉病抗性相關(guān)的位點(diǎn)，本研究組還利用960個(gè)SLAF分子標(biāo)記與202份大白菜自然群體進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，主要結(jié)果如下:
　　3.在A01染色體上檢測到1個(gè)新的與抗霜霉病關(guān)聯(lián)的SLAF標(biāo)記，即SLAFMarkerA0124655323，根據(jù)該標(biāo)記左右兩翼最近標(biāo)記之間的距離確定熱點(diǎn)區(qū)間24573724～24755150的物理范圍。
　　4.利用該區(qū)間內(nèi)的一個(gè)SNP位