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文檔簡介
1、第一章用蛋白質(zhì)組學方法篩選肝癌特異性分子標志物
目的:采用二維凝膠電泳與基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜(2-DE/MALDI-TOF MS)方法篩選并鑒定肝細胞癌組織(HCC)和癌旁無瘤組織的差異表達蛋白質(zhì),并分析其與臨床病理學特征的相關(guān)性。
方法:收集27對肝細胞癌組織和癌旁無瘤新鮮組織,用2-DE技術(shù)分離各組蛋白質(zhì),考馬斯亮藍染色后用PDQuest圖像分析軟件識別各差異蛋白質(zhì)點,應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析/
2、電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOFMS)鑒定各差異蛋白質(zhì)。分別抽提各組織的mRNA和蛋白質(zhì),用RT-PCR和Western blot法,對差異表達蛋白質(zhì)PRDX3進行轉(zhuǎn)錄水平和蛋白質(zhì)水平的驗證。收集119例肝細胞癌組織和36例癌旁無瘤組織病理標本,用免疫組織化學法檢測差異蛋白質(zhì)過氧化物酶3(PRDX3)在各肝癌組織中的表達情況,進一步探討PRDX3的表達與臨床病理學特征之間的相關(guān)性。
結(jié)果:(1)采用2-DE方法篩選到4
3、3個差異表達蛋白質(zhì)點,并用MALDI-TOF MS鑒定了其中22個差異蛋白質(zhì),其中15個在HCC中表達上調(diào),它們分別是:亞胺甲基轉(zhuǎn)移酶環(huán)脫胺酶,線粒體醛脫氫酶,視網(wǎng)膜脫氫酶1,超氧化物歧化酶[Cu-Zn],谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶A1,鈣調(diào)磷酸酶B1,氨基?;?1,T復(fù)合體蛋白11樣蛋白1,抑素,磺基轉(zhuǎn)移酶1A2,3-巰基丙酮酸硫基轉(zhuǎn)移酶,硫氧還蛋白依賴性過氧化物還原酶,人腔鈣蛋白,果糖激酶。7個在HCC中表達下調(diào),它們分別是:CAP-G
4、ly結(jié)構(gòu)域連接蛋白4,載脂蛋白A-(Ⅰ),大同源物3,脯氨酰肽基異構(gòu)酶A,二磷酸核昔激酶A,半胱氨酸蛋白酶抑制因子B。根據(jù)其功能,將上述蛋白質(zhì)進行分類,其中與物質(zhì)代謝相關(guān)的有9個(9/22,40.9%),與抗凋亡相關(guān)的有4個(4/22,18.2%),與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的有7個(7/22,31.8%),與氧化還原調(diào)節(jié)相關(guān)的有5個(5/22,22.7%),與細胞骨架相關(guān)的有3個(3/22,13.6%),與解毒作用相關(guān)的有2個(2/22,9.1%
5、),分子伴侶有3個(3/22,13.6%),與蛋白質(zhì)水解相關(guān)的有1個(1/22,4.5%),涉及DNA合成和細胞分化的有2個(2/22,9.1%)。其中PRDX3蛋白(m/z1462.9,Mascot得分57分,序列覆蓋率21%,mass28.02 kDa,pI7.67)因在肝癌組織中的表達水平顯著高于癌旁無瘤組織,并與腫瘤中氧化應(yīng)激反應(yīng)有密切關(guān)系,是我們比較感興趣的一個差異表達蛋白。
(2) RT-pCR分析結(jié)果顯示,P
6、RDX3 mRNA在肝癌組織中的表達水平(0.79±0.14)顯著高于癌旁無瘤組織(0.15-0.05); Westernblot分析顯示,PRDX3蛋白在肝癌組織中的表達水平(0.82±0.13)顯著高于癌旁無瘤組織(0.52±0.09),差異具有統(tǒng)計學意義(p<0.05)。
(3)免疫組化結(jié)果顯示,PRDX3蛋白在肝癌組織中的表達(94.9%)高于癌旁無瘤組織及正常組織,并且其表達水平與肝細胞癌的低分化分級有顯著相關(guān)性
7、(p<0.05)。
結(jié)論:成功的篩選出了22個差異表達蛋白質(zhì),其中PRDX3在肝癌組織中高表達,且PRDX3的表達與組織分化程度相關(guān),推測其可能參與肝細胞癌的發(fā)生、發(fā)展過程。
第二章PRDX3 siRNA對HepG2細胞生物學功能的影響
目的:檢測PRDX3蛋白在各肝癌細胞株中的表達情況,及其對HepG2細胞的增殖、凋亡、遷移等生物學功能的影響。
方法:用RT-PCR、Wester
8、n blot法檢測PRDX3 mRNA和蛋白質(zhì)在肝癌細胞系HepG2、Hep3B、QGY-7703、HuH7及正常肝細胞系QSG-7701中的表達。構(gòu)建含PRDX3的小干擾RNA的質(zhì)粒pRNAT-PRDX3 siRNA,將該質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至肝癌細胞HepG2,另設(shè)立陰性對照組和空白對照組,通過MTT、流式細胞術(shù)、平板克隆形成實驗、劃痕實驗等檢測PRDX3表達下調(diào)后對HepG2細胞的增殖、凋亡、遷移等生物學功能的影響。
結(jié)果:(1
9、) PRDX3蛋白在所檢測的四種肝癌細胞系中均有不同程度的表達,相對表達強度分別為0.32±0.03、0.33±0.03、0.29±0.02、0.31±0.04;在正常肝細胞QSG-7701中表達較弱。
(2)穩(wěn)定轉(zhuǎn)染PRDX3siRNA后,HepG2細胞中的PRDX3mRNA和蛋白表達受到較為明顯的抑制。MTT實驗檢測發(fā)現(xiàn),PRDX3基因沉默組(HepG2/siPRDX3)細胞生長速度比陰性對照組(HepG2/siNC)
10、細胞的生長速度減慢,克隆形成實驗表明PRDX3基因沉默組(HepG2/siPRDX3)細胞的集落形成率明顯下降,流式細胞術(shù)檢測結(jié)果顯示沉默組的凋亡細胞比例顯著高于陰性對照組,細胞遷移實驗表明PRDX3表達減少后,HepG2細胞的遷移能力下降。這些表明PRDX3基因可能通過調(diào)節(jié)腫瘤相關(guān)基因的表達水平來促進細胞增殖、保護腫瘤細胞抵抗凋亡,從而引起肝細胞的惡性轉(zhuǎn)化。
結(jié)論:PRDX3的表達能夠促進肝癌細胞的增殖,抑制肝癌細胞的凋
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