COI基因在魚類物種鑒定與分類中的應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、我國魚類資源豐富,種類多達3000左右。為了有效地對魚類資源進行開發(fā)利用、最大程度地發(fā)揮魚類的經(jīng)濟價值以及加大對瀕危魚類資源的保護,因此,正確地對魚類進行鑒定、分類顯得尤為重要。傳統(tǒng)鑒定魚類的方法是以形態(tài)結構為主,結合行為、生理、遺傳性狀、地理、生態(tài)等特征對魚類進行鑒定和分類。但是,由于魚類表型特征的可變性,以及有些相同物種的外部特征在不同的生長發(fā)育階段和不同的性別之間存在差異,單單根據(jù)魚類外部形態(tài)特征對魚類進行鑒定和分類的準確性不高。

2、尤其是對于形態(tài)差異比較小、親緣關系比較近的的不同物種之間的鑒定存在困難。另外,由于傳統(tǒng)的形態(tài)學鑒定方法存在的缺陷,要求鑒定者要有豐富的鑒定經(jīng)驗以及對物種分類鑒定的知識儲備。
  DNA條形碼(DNA Barcoding)技術是指利用一段能夠代表物種的、短的、相對保守、容易擴增的標準目的基因片段實現(xiàn)物種快速、準確的鑒定的技術。目前,線粒體細胞色素C氧化酶亞基(COI)基因被廣泛用作DNA條形碼的目的基因,從分子學角度為魚類的鑒定分類

3、和系統(tǒng)進化提供了可靠的依據(jù)。研究內容如下:
  1.線粒體COI基因在觀賞魚中物種鑒定與分類應用
  觀賞魚種類繁多,形態(tài)各異,市場上多是以商品名命名,在物種鑒定分類上存在一定的難度。本研究基于線粒體COI基因,探討其在觀賞魚中物種鑒定與分類應用的可行性。通過PCR擴增,獲取18種觀賞魚249個個體的COI基因序列?;贙imura雙參數(shù)模型,利用MEGA軟件計算18種觀賞魚種間和種內遺傳距離,并構建系統(tǒng)進化樹。結果顯示,觀

4、賞魚類的種間遺傳距離明顯大于種內遺傳距離,線粒體COI基因序列可以用于物種鑒定。在系統(tǒng)進化樹中,系統(tǒng)進化關系跟傳統(tǒng)分類方法所得數(shù)據(jù)一致性高。研究表明,觀賞魚線粒體COI基因序列,在物種鑒定與進化分類上具有一定的應用價值。
  2.COI基因DNA條形碼在云南瀾滄江魚類物種中的鑒定與分類的應用
  云南瀾滄江魚類資源豐富,有許多特有種類,在幼魚階段、或形體不全的情況下以及一些相近種形態(tài)相似的情況下,僅僅依據(jù)傳統(tǒng)的形態(tài)學鑒定方法

5、,很難完全滿足物種鑒定和分類的需求。本文從分子學角度,探討了線粒體COI基因在瀾滄江云南段魚類中物種鑒定與分類應用的適用性。采用PCR技術,對采自瀾滄江云南段的18種魚共162個個體的COI基因片段進行了擴增和測序。利用MEGA軟件,基于K2P模型計算18種魚類的種間和種內遺傳距離,并構建系統(tǒng)進化樹。結果表明,種間遺傳距離顯著大于種內遺傳距離,符合Hebert等人提出的COI基因能有效進行鑒定的前提;由系統(tǒng)進化樹得知,COI基因在種屬水

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