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文檔簡介
1、玉米(Zea mays L.)是世界上主要的糧食和飼料作物,也是植物分子遺傳研究的重要模式。玉米種子既是玉米最為重要的生產(chǎn)性狀,同時也是研究種子發(fā)育的重要模式器官,具有重要的研究價值。 玉米籽粒的發(fā)育過程可分為早期胚胎發(fā)生(包括球形胚期、早期器官分化和建成)、種子的成熟(包括胚乳的發(fā)育和大量儲藏蛋白的積累)和種子的休眠(種子開始脫水)三個階段。從分子生物學(xué)的角度來說,籽粒的發(fā)育是大量基因有序的表達調(diào)控的過程,而轉(zhuǎn)錄因子在這其中起
2、到了關(guān)鍵性的作用。因此,本研究主要對玉米籽粒中的轉(zhuǎn)錄因子進行研究。 隨著擬南芥和水稻全基因組序列的測序完成,對轉(zhuǎn)錄因子的研究已經(jīng)轉(zhuǎn)到了全基因組水平。在本論文的第一部分研究中,我們從全基因組層面對玉米籽粒發(fā)育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子基因進行了研究。首先,我們構(gòu)建了覆蓋玉米籽粒發(fā)育全期的全長、均一化cDNA文庫,該文庫采用SMART技術(shù)和cDNA均一化技術(shù),文庫共含有約1.0×10<'6>個克隆,重組率大于98%,插入片段的平均長度為1.2K
3、b,可用于全長cDNA的克隆及進行大規(guī)模EST測序分析。接著,我們對從該文庫中隨機挑選的10,848個克隆進行測序,經(jīng)拼接處理后,共得到6,330個獨立的Unigene。利用生物信息學(xué)手段對它們進行分析,共發(fā)現(xiàn)了7大類57個轉(zhuǎn)錄因子基因。對其中的13個bZIP轉(zhuǎn)錄因子基因的進一步研究表明,在籽粒發(fā)育過程中大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子基因都是持續(xù)表達的,在表達上呈現(xiàn)發(fā)育階段特異性的僅4個(約占1/3)。這些轉(zhuǎn)錄因子的發(fā)現(xiàn)為今后進一步研究玉米籽粒的表達調(diào)
4、控網(wǎng)絡(luò)奠定了基礎(chǔ)。 玉米儲藏蛋白是玉米種子品質(zhì)的重要決定因素,其中α-醇溶蛋白是玉米中最主要的儲藏蛋白,根據(jù)分子量大小又可將α-醇溶蛋白分為22kDa和19kDa兩類。在α-醇溶蛋白基因的表達調(diào)控上,目前只對22kDa醇溶蛋白有所了解,而對19kDa醇溶蛋白卻了解甚少。因此在本論文的第二部分研究中,我們對19kDa,醇溶蛋白基因家族的表達和調(diào)控進行了研究。首先,我們在玉米W22自交系中,對19kDa醇溶蛋白基因家族進行了發(fā)育表達
5、譜研究。結(jié)果表明,在25個19kDa醇溶蛋白基因家族成員中,有13個成員表達,包括9個Z1A基因家族成員,2個Z1B基因家族成員和2個Z1D基因家族成員;而從表達模式上來看,19kDa醇溶蛋白的3個基因亞族的表達模式基本相同,都是從授粉后13天開始表達,在24天表達量達到最高,隨后表達量逐漸下降。接著,我們應(yīng)用Clontech公司的SMART技術(shù)及Evrogen公司的cDNA均一化技術(shù)構(gòu)建了酵母表達文庫,該文庫的容量為1.0×10<'6
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