皖東牛白細(xì)胞GPR54差異表達(dá)與相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、GPR54基因變異會(huì)影響牛初情期啟動(dòng)，本研究采集皖東牛（22頭）血液樣品，提取皖東牛血液白細(xì)胞總RNA，通過(guò)對(duì)樣本牛血液GPR54調(diào)控區(qū)SNPs檢測(cè)，多態(tài)片段基因型鑒定，通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析不同基因型GPR54表達(dá)水平，采用RNA-Seq技術(shù)分析不同基因型牛GPR54與初情期相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平及信號(hào)通路之關(guān)聯(lián)性。結(jié)果表明:
　　1.檢測(cè)出皖東牛GPR54基因啟動(dòng)子區(qū)SNPs，獲得2個(gè)位點(diǎn)，基因型組合分別為CCTT（A組）、CT

2、TC（B組）和TTCC(C組)。
　　2.不同基因型牛的GPR54基因表達(dá)水平顯示為CCTT＞CTTC＞TTCC。CTTC型GPR54基因表達(dá)水平介于兩個(gè)純合型之間。
　　3.由RNA-seq技術(shù)共測(cè)了8個(gè)樣品，平均產(chǎn)生了24136079條原始reads，clean reads平均數(shù)目為23739830。與參考基因和參考基因組比對(duì)，得出clean reads的平均比對(duì)率為分別是59.97％和91.22％。
　　4.通過(guò)

3、RNA-seq檢測(cè)，A（CCTT型）組和B組（CTTC型）共測(cè)得差異基因16719個(gè)，其中上調(diào)基因6778個(gè)，下調(diào)基因9920個(gè)。通過(guò)對(duì)差異基因篩選結(jié)果進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)大量與初情期啟動(dòng)相關(guān)的基因。如對(duì)青春期啟動(dòng)具有抑制作用的GABA、NPY;興奮性因素有膠質(zhì)細(xì)胞分泌的TGF和IGF，以及GPR54/Kiss-1;另外還有雌激素受體基因(ER)和性激素結(jié)核球蛋白基因(SHBG)都與初情期啟動(dòng)相關(guān)。
　　5.通過(guò)對(duì)差異基因Pathway