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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究采用PCR-SSCP和DNA測(cè)序技術(shù),檢測(cè)了郟縣紅牛、魯西牛和秦川牛3個(gè)黃牛品種共403個(gè)個(gè)體GPR41和GPR43基因的遺傳變異,同時(shí)探討黃牛群體的遺傳多態(tài)性、遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀(體重、體高、體長(zhǎng)、胸圍、管圍、腹圍等)的關(guān)系,以期獲取相應(yīng)的分子遺傳學(xué)信息,發(fā)掘與黃牛重要的經(jīng)濟(jì)性狀顯著相關(guān)的遺傳標(biāo)記,為進(jìn)一步保護(hù)利用與開(kāi)發(fā)黃牛種質(zhì)資源、建立分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫(kù)以及改善與提高黃牛的生產(chǎn)性能提供重要的遺傳學(xué)依據(jù)。
本研
2、究共檢測(cè)了3個(gè)黃牛品種GPR41基因6個(gè)基因座(P1,P2,P3,P4,P5,P6)和GPR43基因7個(gè)基因座(P7,P8,P9,P10,P11,P12,P13)的遺傳變異。并與黃牛的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行了相關(guān)分析,獲得了以下研究結(jié)果:
1.黃牛GPR41基因的遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)系研究
GPR41,又稱FFAR3,是人體內(nèi)最大的膜受體蛋白G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS)超家族中的成員。高產(chǎn)反芻動(dòng)物需要利用大量短鏈脂肪酸作
3、為能源,營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收調(diào)控的關(guān)鍵步驟是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的感知,行使這一功能的主要是G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS),GPR41作為脂肪酸感受器可以感知來(lái)自消化腔的短鏈脂肪酸。GPR41還能夠促進(jìn)瘦素的分泌、調(diào)節(jié)糖脂和能量代謝、控制體重等。
本研究在GPR41基因6個(gè)基因座上檢測(cè)到了1個(gè)SNPs位點(diǎn):P3(c.+498A>G)。在此位點(diǎn)上檢測(cè)到3種基因型分別命名為:A3A3、A3B3和B3B3。該突變位于該基因外顯子2上,為同義突變,沒(méi)有引
4、起氨基酸改變。
在郟縣紅牛群體中,GPR41基因P3位點(diǎn)不同基因型對(duì)體重和體長(zhǎng)有顯著影響(P<0.05)。A3A3比 A3B3與B3B3型個(gè)體體重分別高出10.83%和14.99%,A3A3比 A3B3與B3B3型個(gè)體體長(zhǎng)分別高出4.42%和5.93%。該位點(diǎn)的不同基因型與魯西牛、秦川牛的生長(zhǎng)性狀沒(méi)有明顯相關(guān)性(P>0.05)。
2.黃牛GPR43基因的遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)系研究
GPR43(又稱FF
5、AR2)同GPR41一樣,也是G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS)超家族中的成員,對(duì)動(dòng)物體內(nèi)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收和能量穩(wěn)態(tài)調(diào)控起到重要的作用。GPR41和GPR43是目前已被證實(shí)的僅有的兩種特異性短鏈脂肪酸受體。
本研究在GPR43基因7個(gè)基因座中檢測(cè)到了5個(gè)SNPs:在5’UTR上有1個(gè)遺傳變異位點(diǎn)P7(c.-1085T>C),檢測(cè)到3種基因型,分別命名為:A7A7、A7B7和B7B7。在編碼區(qū)上有3個(gè)遺傳變異位點(diǎn)分別為 P8、P10和P
6、12(c.+36T>C、c.+401C>T和c.+612T>C)。這3個(gè)突變位點(diǎn)均檢測(cè)到3種基因型,分別命名為:A8A8、A8B8和B8B8,A10A10、A10B10和B10B10,A12A12、A12B12和B12B12。3’UTR上有1個(gè)遺傳變異位點(diǎn)P13(c.+1009G>A),檢測(cè)到3種基因型,分別命名為:A13A13、A13B13和B13B13。其中c.+401C>T突變?yōu)殄e(cuò)義突變導(dǎo)致GPR43蛋白V(GTC)134A(GC
7、C)氨基酸的改變,其余c.+36T>C和c.+612G>A為同義突變,未引起氨基酸的改變。
在郟縣紅牛群體中,GPR43基因P7位點(diǎn)不同基因型對(duì)體重、體長(zhǎng)和胸深有顯著影響(P<0.05)。A7B7個(gè)體比A7A7和B7B7基因型個(gè)體體重分別高出7.10%和8.10%,體長(zhǎng)分別高出2.86%和3.76%,胸深分別高出3.1%和3.80%。P8位點(diǎn)的不同基因型對(duì)體重和胸圍方面有顯著影響,可以看出基因型A8A8個(gè)體比A8B8和B8B8
8、基因型個(gè)體體重分別高出8.58%和5.00%,胸圍分別高出3.20%和1.57%。P10位點(diǎn)的不同基因型對(duì)體重、胸圍、十字部高和胸深方面有顯著影響,可以看出基因型A10B10個(gè)體比A10A10和B10B10基因型個(gè)體體重分別高出10.48%和6.51%,胸圍分別高出4.06%和2.13%,十字部高分別高出5.61%和1.02%,胸深分別高出5.58%和2.54%。在魯西牛群體中,GPR43基因P7位點(diǎn)不同基因型對(duì)體重、腹圍有顯著影響(P
9、<0.05)。A7B7個(gè)體比A7A7和B7B7基因型個(gè)體體重分別高出10.59%和13.62%,腹圍指標(biāo)高出4.71%和4.90%。P10位點(diǎn)的不同基因型對(duì)體重、胸圍和腹圍方面顯著相關(guān),基因型A10B10個(gè)體比A10A10和B10B10基因型個(gè)體體重分別高出11.62%和9.95%。胸圍分別高出4.61%和3.94%,腹圍分別高出5.14%和4.00%。在秦川牛群體中,GPR43基因P10位點(diǎn)的不同基因型在秦川牛的體重顯著相關(guān)(P<0.
10、05)。基因型A10B10個(gè)體比A10A10和B10B10基因型個(gè)體體重分別高出22.61%和17.91%。
綜上所述,本研究揭示了黃牛群體 GPR41和GPR43基因的變異位點(diǎn),共發(fā)現(xiàn)了6個(gè)SNPs,分別為GPR41基因:c.+498A>G;GPR43基因:c.-1085T>C、+36T>C、+401C>T、+612T>C和+1009G>A。經(jīng)關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn) P3、P7、P8和P10位點(diǎn)的多態(tài)類型與黃牛生長(zhǎng)性狀存在顯著關(guān)聯(lián)性。
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