小麥抽穗期TaHdM605精細作圖.pdf

1、適宜的抽穗期是保證作物高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的重要前提，因此挖掘抽穗期相關(guān)基因并對其功能進行解析，不但可以為培育具有適應(yīng)不同生態(tài)環(huán)境的小麥新品種提供候選基因，而且可以增加對小麥抽穗調(diào)控機理的理解和認識。小麥抽穗期突變體M605是從小麥偃展4110(YZ4110)EMS突變體庫中篩選出的一個特晚抽穗的突變體，其攜帶一隱性基因TaHdM605。我們前期的研究已將TaHdM605定位于小麥3DL染色體上?；虻木氉鲌D是基因圖位克隆的基石。本文利用小麥基因

2、組序列信息及比較基因組學(xué)的原理對小麥抽穗期基因TaHdM605所在區(qū)段進行了共線性分析，利用序列比對分析的結(jié)果開發(fā)了大量新的分子標記，繪制了小麥抽穗期基因TaHdM605精細遺傳圖譜。
　　利用TaHdM605兩側(cè)的分子標記barc42和cfd152的序列分別BLAST水稻、高粱、大麥和短柄草的基因組序列，通過序列的比對分析，將TaHdM605基因鎖定在水稻的LOC_Os01g66190-LOC_Os01 g67360、高粱Sb0

3、3g042010-Sb03g042770、大麥3H染色體480Mb-510Mb和短柄草Bradi2g57170-Bradi2g57710區(qū)間內(nèi)，共線性分析表明該區(qū)段在不同物種中具有比較好的共線性關(guān)系。通過序列的比對分析，在此區(qū)間內(nèi)共開發(fā)了1046對SSR分子標記，發(fā)現(xiàn)8對連鎖的分子標記，其中最近的分子標記M310距離目標基因0.8cM。利用新近發(fā)表的小麥中國春3B染色體序列和粗山羊草基因組序列草圖又開發(fā)了766對對新的SSR分子標記，發(fā)

4、現(xiàn)13對連鎖的分子標記，其中最近分子標記M35與目標基因共分離。利用新開發(fā)的連鎖標記，在大的作圖群體(3228個F2單株和1468個選自次級分離群體的隱性純合單株)中對TaHdM605進行了精細遺傳作圖，最終將抽穗期基因TaHdM605定位于分子標記M310和M27之間，其中，M35與目標基因共分離，M310有2個重組單株，M27有1個重組單株。
　　通過對共分離標記M35所在scaffold1510和側(cè)翼scaffolds序列中

5、基因及重復(fù)序列的詳細分析，從中選擇15個預(yù)測基因用于SNP標記的開發(fā)，共獲得16個連鎖SNP位點，目前正在對這些SNP位點進行驗證。
　　此外，利用本室已發(fā)表的粗山羊草高密度遺傳圖，并結(jié)合對該作圖群體抽穗期表型的調(diào)查數(shù)據(jù)，在粗山羊草7D染色體bin77-bin78區(qū)間內(nèi)定位了一個控制抽穗期的主效QTL，該QTL貢獻率為21.73％。通過bin77-bin78區(qū)段與水稻基因組序列的比對分析，發(fā)現(xiàn)該區(qū)段在兩物種中的共線性非常差，因此進