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1、水稻是人類最為重要的糧食作物之一,為全世界約一半的人口提供了食物來(lái)源。理解水稻代謝物性狀的遺傳和生化基礎(chǔ),對(duì)于人類培育抗逆性強(qiáng)和營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)高的優(yōu)良品種意義重大。
本研究基于系統(tǒng)遺傳學(xué)研究思想,提出一套基于代謝通路的全表型組關(guān)聯(lián)分析研究策略(M-PheWAS),一方面對(duì)表型與基因型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,另一方面,利用基于通路的方法鑒定出與具有富集效應(yīng)的代謝物相關(guān)的遺傳位點(diǎn)及相關(guān)生化反應(yīng)的催化蛋白酶。
最終,我們得到105個(gè)顯著S
2、NP位點(diǎn)和52個(gè)通過(guò)代謝通路富集得到的催化蛋白酶;同時(shí),發(fā)現(xiàn)并證實(shí)了一條由sf0315305925和sf0315308337兩個(gè)SNP位點(diǎn)調(diào)控著一個(gè)編碼蛋白酶為查爾酮異構(gòu)酶(EC:5.5.1.6)的靶基因LOC_Os03g60509,并最終控制著4,5,7-三羥黃烷酮(Naringenin)生化合成的遺傳調(diào)控通路。
結(jié)果表明,本研究提出的M-PheWAS策略具有可行性。同時(shí),對(duì)水稻中4,5,7-三羥黃烷酮(Naringenin
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