RNAi醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫的研究.pdf

1、背景和目的: 作為新興的基因阻斷技術(shù)，越來越多的研究單位和公司都采用RNAi技術(shù)平臺來研究基因功能，篩選藥物或疾病的靶基因，核心進展是特定基因組RNAi文庫的建立，為我們能夠進行人類細(xì)胞的全基因組掃描奠定基礎(chǔ)，是一項具有重要實用使用價值的研究。 RNAi技術(shù)涉及多個學(xué)科的交叉，醫(yī)學(xué)，生物等相關(guān)領(lǐng)域的工作人員都可以利用RNAi技術(shù)進行研究工作，目前運用RNAi技術(shù)進行研究的工作正大量的成倍的增長，因此建立的RNAi信息數(shù)據(jù)

2、庫能使相關(guān)研究人員可以快捷、及時地獲得已通過RNAi沉默的基因和靶序列，這對相關(guān)人員就有非常大的意義。此外，還可以在互聯(lián)網(wǎng)上接受有關(guān)科研人員提交的相關(guān)基因研究信息，使數(shù)據(jù)庫更加豐富。 在數(shù)據(jù)庫操作系統(tǒng)選擇過程中,Linux下MYSQL+PHP建立的數(shù)據(jù)庫存在不直觀，數(shù)據(jù)類型不足，且對數(shù)據(jù)庫的修改操作過程復(fù)雜等缺點，為了使用戶可以方便、快捷地使用本數(shù)據(jù)庫，軟件設(shè)計采用了動態(tài)數(shù)據(jù)庫交互結(jié)構(gòu)，外部用戶通過互聯(lián)網(wǎng)使用通用的瀏覽器就可以訪

3、問數(shù)據(jù)庫。 本實驗希望通過Windowssever2003下SQL2000+PHP構(gòu)建一個WEB數(shù)據(jù)庫來實現(xiàn)特定基因組RNAi的資料搜集，將所有基因信息下載到本地數(shù)據(jù)庫中，人工搜索文獻并提交的方法更新數(shù)據(jù)庫。此法的優(yōu)點是可以自主、靈活地顯示數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容，并檢測其是否能提供最直接、最經(jīng)濟和最有效地在特定基因組范圍內(nèi)進行基因序列和功能篩選。 本研究的目的是建立一個較完整確切的已有文獻支持的RNAi相關(guān)醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫，并為以后

4、后續(xù)的研究打下基礎(chǔ)。 方法: 1.RNAi醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫的軟件開發(fā)平臺：包括windowsserver2003，Microsoftsqlserver2000，php5.1+ⅡS6,PHP腳本安裝運行過程三個部分。 2.RNAi醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫內(nèi)部開發(fā)：包括建立數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)表，數(shù)據(jù)庫的外部連接。 3.數(shù)據(jù)庫的外部應(yīng)用：包括數(shù)據(jù)庫的登錄，提交數(shù)據(jù)庫界面，基因檢索界面三部分。 結(jié)果: 1.成功安裝wind

5、owsserver2003，Microsoftsqlserver2000，php5.1+ⅡS6,PHP三個軟件。 2.用SQLserver2000建立了RNAi數(shù)據(jù)庫，并用PHP設(shè)計瀏覽器端和服務(wù)器端的連接，使PHP與數(shù)據(jù)庫動態(tài)鏈接起來.再經(jīng)過ⅡS6.0發(fā)布于internet之后，使用戶可以通過瀏覽器對數(shù)據(jù)庫進行訪問，添加，查詢等操作。 3.建立了可以同時顯示干擾基因，GeneTarget，PositionfromATG