中國西南馬遺傳資源特征研究.pdf

1、中國西南馬是我國馬種主要生態(tài)類型之一，經(jīng)歷了遺傳變異和自然選擇的長期進(jìn)化過程，在西南地區(qū)逐漸分化形成了百色馬、貴州馬、文山馬、烏蒙馬、大理馬、建昌馬、騰沖馬、中甸馬等優(yōu)良類群。受其特殊歷史、自然、社會諸多條件的影響，西南馬形成體形矮小、結(jié)構(gòu)緊湊、抗逆性強(qiáng)、善走山路等特點(diǎn)，可以廣泛用于科學(xué)研究、觀光旅游、藝術(shù)表演、騎乘培訓(xùn)、馱負(fù)運(yùn)輸?shù)?，是中國乃至世界原始矮馬資源的寶貴基因庫?？梢?，中國西南馬在遺傳資源保護(hù)利用和現(xiàn)代馬業(yè)發(fā)展中具有重要地位。

2、但國內(nèi)外關(guān)于西南馬遺傳多樣性、起源進(jìn)化、親緣關(guān)系、資源分布、矮小機(jī)理等方面的研究還相對缺乏。 本課題在對西南地區(qū)馬進(jìn)行初步調(diào)查的基礎(chǔ)上，運(yùn)用SAS、SPSS統(tǒng)計分析軟件對西南馬資源特征進(jìn)行分析；通過PCR-SSCP技術(shù)、PCR產(chǎn)物純化直接測序等方法，對七個類群的西南馬及引入品種Shetland馬共150個樣品的mtDNAD-Loop區(qū)、ND3、ND4、ND4L基因和核內(nèi)SHOX基因的多態(tài)性進(jìn)行了檢測，并進(jìn)行了多態(tài)性與體尺指標(biāo)相關(guān)

3、分析，了解了西南馬群體資源表型、分子特征。本文得出以下基本結(jié)論： (1)中國西南馬在數(shù)量上已經(jīng)成為我國五大類型馬的第一大類群，影響其數(shù)量分布的主要因子是人均農(nóng)機(jī)、人口密度、轄區(qū)比重等。非密度制約因子如年無霜期、降水量、日照時數(shù)和平均氣溫等自然因素均與中國西南馬體高呈強(qiáng)相關(guān)，對不同類群馬的形成可能起重要作用。 (2)對中國西南馬mtDNAD-Loop位點(diǎn)進(jìn)行了研究，結(jié)果表明：中國西南馬種內(nèi)遺傳多樣性相對豐富，在類型間和類型

4、內(nèi)遺傳分化不顯著(P>0.05)；中國西南馬具有多個母系起源，且與蒙古國蒙古馬親緣關(guān)系較近，部分西南馬起源于普氏野馬或蒙古野馬。 (3)在ND4L、ND4基因上游和下游檢測到多態(tài)：ND4L和ND4上游片段出現(xiàn)兩種單倍型(定義為A和B)，而且B單倍型出現(xiàn)頻率均略高于A單倍型；ND4下游片段中，出現(xiàn)四種單倍型，其中一個為共享單倍型，三個為稀有單倍型。 (4)西南馬線粒體ND4基因和ND4L基因核苷酸組成的偏倚不嚴(yán)重，但在密碼

5、子第二和第三位點(diǎn)上，C的含量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于G含量，而且密碼子的使用存在偏倚。 (5)所研究的西南馬(不包括建昌馬)各類群內(nèi)核苷酸多樣性(Pi)較高，在0.00467至0.00737之間，其中大理馬最低，烏蒙馬最高。各類群間的遺傳距離很小，而烏蒙馬與其它西南馬的遺傳距離最大(0.006)：類群間的核苷酸分化系數(shù)(Nst)在-0.35665至0.01694之間，烏蒙馬與其它馬種的核苷酸分化系數(shù)均較大，且同處云南地區(qū)的烏蒙馬與大理馬之間的N

6、st值最大，可見烏蒙馬與大理馬存在遺傳分化。 (6)本文對ND4下游片段的多態(tài)性與體尺性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明基因型對體長影響顯著(P<0.05)：D基因型的體長較其余基因型大；對體高和管圍的影響接近顯著水平(P=0.0809和0.0753)，對胸圍影響不顯著。 (7)西南馬種內(nèi)遺傳多樣性低，類群間的遺傳距離小，遺傳相似度高。烏蒙馬獨(dú)立性最高(Pi=0.00737)，可作為獨(dú)立的管理單元；大理馬核苷酸多樣度最低(Pi

7、=0.00467)，分化最小(k=3.167)，保持著類群特有的遺傳特質(zhì)，應(yīng)該得到良好的保護(hù)。 (8)本研究還首次克隆了西南馬矮小性狀基因SHOX的部分序列。其長度為520bp，與其他物種已知的SHOX基因序列比對，發(fā)現(xiàn)克隆所得的序列是馬SHOX基因編碼區(qū)的部分序列，包含了完整的第二外顯子。 (9)通過對馬SHOX基因第二外顯子序列與其它物種相應(yīng)區(qū)域序列進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)：不同物種間的第二外顯子較保守，未出現(xiàn)不同片段的插入、缺

8、失及短串聯(lián)重復(fù)序列多態(tài)現(xiàn)象，且馬的SHOX基因富含GC(7個類群馬平均為67.85％)。 (10)通過PCR-SSCP分析，檢測到在SHOX基因P2位點(diǎn)268處有一個G→A的突變，431處有一個T→G的突變，導(dǎo)致了等位基因B變?yōu)榈任换駻。 (11)不同類群馬SHOX基因P2位點(diǎn)純合度(Ho)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)及多態(tài)信息含量(PIC)分析表明：多態(tài)信息含量(PIC)以文山馬最高，為0.513，處于高